More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0408 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_0230  cytochrome c oxidase, subunit I  61.08 
 
 		 565 aa  635    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.123434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0408  cytochrome-c oxidase  100 
 
 		 542 aa  1083    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0043  cytochrome c oxidase, subunit I  57.75 
 
 		 539 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3990  cytochrome c oxidase, subunit I  60.38 
 
 		 564 aa  632  1e-180  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.74194  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0219  cytochrome c oxidase, subunit I  58.57 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0536  cytochrome c oxidase, subunit I  58.7 
 
 		 541 aa  622  1e-177  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.091525 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0249  cytochrome c oxidase, subunit I  56.59 
 
 		 541 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0038308  hitchhiker  0.00422313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4436  cytochrome-c oxidase  57.12 
 
 		 545 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0196071  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1345  cytochrome-c oxidase  57.41 
 
 		 541 aa  609  1e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0187504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1541  cytochrome c oxidase, subunit I  56.08 
 
 		 539 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1521  cytochrome c oxidase, subunit I  55.64 
 
 		 552 aa  607  9.999999999999999e-173  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.999426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1587  cytochrome c oxidase, subunit I  56.32 
 
 		 548 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2995  cytochrome-c oxidase  52.79 
 
 		 544 aa  599  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0459294 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0827  cytochrome c oxidase, subunit I  56.84 
 
 		 540 aa  598  1e-169  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.541437  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2420  cytochrome c oxidase, subunit I  57.53 
 
 		 556 aa  597  1e-169  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.040842  normal  0.534979 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0042  cytochrome c oxidase, subunit I  55.6 
 
 		 542 aa  596  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00140919 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1245  cytochrome c oxidase  56.75 
 
 		 535 aa  594  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2526  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit I  55.68 
 
 		 543 aa  592  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000123308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1823  cytochrome-c oxidase  58 
 
 		 543 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0200006  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0849  cytochrome c oxidase subunit I type  55.03 
 
 		 555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0804  cytochrome-c oxidase  55.05 
 
 		 554 aa  573  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0856  cytochrome c oxidase, subunit I  54.86 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0025  cytochrome c oxidase, subunit I  54.98 
 
 		 563 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.785934 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0852  cytochrome c oxidase, subunit I  54.86 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.783048  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5947  cytochrome c oxidase, subunit I  52.91 
 
 		 554 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1037  cytochrome c oxidase, subunit I  52.59 
 
 		 558 aa  569  1e-161  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0167  cytochrome c oxidase, subunit I  52.39 
 
 		 563 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.357082  normal  0.0110936 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0223  cytochrome c oxidase, subunit I  52.65 
 
 		 563 aa  567  1e-160  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.109955  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2274  cytochrome-c oxidase  54.76 
 
 		 554 aa  557  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.413145  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6230  cytochrome c oxidase, subunit I  55.29 
 
 		 565 aa  550  1e-155  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.33684  normal  0.0324677 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4179  cytochrome c oxidase, subunit I  54.32 
 
 		 557 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.263418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6885  cytochrome c oxidase, subunit I  52.38 
 
 		 558 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1677  cytochrome c oxidase, subunit I  54.4 
 
 		 555 aa  541  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1601  cytochrome c oxidase, subunit I  54.4 
 
 		 555 aa  542  1e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.171665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5816  cytochrome c oxidase, subunit I  50.56 
 
 		 558 aa  535  1e-151  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.099341  hitchhiker  0.00453601 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2705  Cytochrome-c oxidase  53.67 
 
 		 528 aa  531  1e-149  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.388874 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  46.97 
 
 		 587 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0568  cytochrome c oxidase, subunit I  46.61 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0585  cytochrome c oxidase, subunit I  46.61 
 
 		 555 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4072  cytochrome c oxidase, subunit I  48.7 
 
 		 560 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  46.61 
 
 		 575 aa  495  1e-139  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3574  cytochrome c oxidase subunit I  45.8 
 
 		 564 aa  493  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  46.76 
 
 		 541 aa  492  9.999999999999999e-139  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1778  cytochrome-c oxidase  47.43 
 
 		 590 aa  493  9.999999999999999e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2640  cytochrome c oxidase subunit I  45.47 
 
 		 548 aa  486  1e-136  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3957  cytochrome c oxidase, subunit I  46.23 
 
 		 553 aa  475  1e-133  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0447  cytochrome c oxidase, subunit I  46.9 
 
 		 559 aa  478  1e-133  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.130684 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  47.95 
 
 		 566 aa  475  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  45.61 
 
 		 615 aa  474  1e-132  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3659  cytochrome c oxidase  43.28 
 
 		 555 aa  469  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0178  cytochrome c oxidase, subunit I  43.81 
 
 		 559 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.942874  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0277  cytochrome-c oxidase  44.91 
 
 		 562 aa  470  1.0000000000000001e-131  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0513618 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1776  cytochrome c oxidase, subunit I  45.19 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4299  cytochrome c oxidase, subunit I  45.37 
 
 		 555 aa  468  9.999999999999999e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00437809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04421  cytochrome c oxidase, subunit I  43.99 
 
 		 552 aa  466  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04991  cytochrome c oxidase, subunit I  45 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.217716 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06411  cytochrome c oxidase, subunit I  44.57 
 
 		 558 aa  464  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.113459 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3140  Cytochrome-c oxidase  44.34 
 
 		 565 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  47.17 
 
 		 641 aa  464  1e-129  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.37 
 
 		 641 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1902  Cytochrome-c oxidase  44.61 
 
 		 638 aa  462  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.96615  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0607  cytochrome-c oxidase  45 
 
 		 555 aa  459  9.999999999999999e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05071  cytochrome c oxidase, subunit I  43.15 
 
 		 539 aa  458  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04691  cytochrome c oxidase, subunit I  43.33 
 
 		 541 aa  458  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1755  cytochrome-c oxidase  43.44 
 
 		 556 aa  455  1e-127  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.900369  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0444  cytochrome c oxidase, subunit I  43.39 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05001  cytochrome c oxidase, subunit I  43.39 
 
 		 541 aa  457  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  43.1 
 
 		 669 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  42.54 
 
 		 671 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0829  cytochrome c oxidase, subunit I  45.51 
 
 		 537 aa  451  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.12188  normal  0.348177 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5317  cytochrome c oxidase  41.93 
 
 		 554 aa  442  1e-123  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4587  cytochrome-c oxidase  46.51 
 
 		 541 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0148874  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4788  cytochrome-c oxidase  44.28 
 
 		 540 aa  445  1e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3643  cytochrome-c oxidase  44.55 
 
 		 534 aa  444  1e-123  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0900  cytochrome c oxidase, subunit I  45.54 
 
 		 541 aa  442  1e-123  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0552276  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2166  cytochrome-c oxidase  45.2 
 
 		 532 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.655768  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0301  cytochrome c oxidase, subunit I  44.92 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.249737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3576  cytochrome c oxidase, subunit I  42.2 
 
 		 553 aa  439  9.999999999999999e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0128043 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4647  cytochrome c oxidase subunit I type  45.26 
 
 		 540 aa  439  9.999999999999999e-123  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.608702  normal  0.13111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  42.97 
 
 		 638 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  42.53 
 
 		 679 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0729  cytochrome c oxidase, subunit I  43.69 
 
 		 555 aa  441  9.999999999999999e-123  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.484854  normal  0.0785351 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  45.59 
 
 		 661 aa  437  1e-121  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  41.59 
 
 		 678 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  41.51 
 
 		 680 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1404  cytochrome-c oxidase  44.68 
 
 		 556 aa  437  1e-121  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.29775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0670  cytochrome c oxidase subunit I type  45.07 
 
 		 535 aa  437  1e-121  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.154602  normal  0.969161 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  46.35 
 
 		 743 aa  433  1e-120  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0124  cytochrome-c oxidase  42.88 
 
 		 536 aa  432  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  42.48 
 
 		 563 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0032  cytochrome c oxidase, subunit I  45.47 
 
 		 542 aa  432  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.616804 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  42.58 
 
 		 638 aa  434  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0123  cytochrome c oxidase, subunit I  44.64 
 
 		 529 aa  432  1e-120  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0914  cytochrome-c oxidase  44.44 
 
 		 562 aa  433  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00560774  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1681  cytochrome-c oxidase  41.76 
 
 		 539 aa  432  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.793322  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0261  cytochrome c oxidase, subunit I  44.86 
 
 		 542 aa  433  1e-120  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.043486  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0815  cytochrome-c oxidase  45.93 
 
 		 541 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0856305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1381  cytochrome-c oxidase  42.64 
 
 		 543 aa  434  1e-120  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.442131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0294  cytochrome-c oxidase  43.54 
 
 		 526 aa  432  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00647712  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  45.36 
 
 		 594 aa  435  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>