185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_4871 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4871  hypothetical protein  100 
 
 		 666 aa  1286    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4482  hypothetical protein  52.21 
 
 		 680 aa  597  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1224  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  52.71 
 
 		 645 aa  590  1e-167  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.188464 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4077  hypothetical protein  52.96 
 
 		 695 aa  574  1.0000000000000001e-162  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0451671 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4092  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.02 
 
 		 670 aa  567  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.445905  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0489  hypothetical protein  51.56 
 
 		 692 aa  564  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0388236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8908  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  51.12 
 
 		 672 aa  561  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3297  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.88 
 
 		 659 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.925836 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8108  ATP-dependent DNA helicase  48.34 
 
 		 719 aa  550  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2397  putative ATP/GTP binding protein  50.07 
 
 		 727 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.115029  normal  0.0547233 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2694  hypothetical protein  51.19 
 
 		 679 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.129277 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4146  putative ATP-dependent DNA helicase  51.51 
 
 		 717 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21750  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.37 
 
 		 695 aa  525  1e-147  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.114546 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2447  putative ATP-dependent DNA helicase  47.43 
 
 		 792 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.250058  normal  0.190451 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0164  ATP-dependent DNA helicase  49.05 
 
 		 684 aa  489  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.532739 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24030  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.86 
 
 		 710 aa  318  3e-85  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1829  ATP-dependent DNA helicase  37.64 
 
 		 706 aa  293  1e-77  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1059  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.85 
 
 		 732 aa  284  4.0000000000000003e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.394879  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2679  Superfamily I DNA and RNA helicase  35.04 
 
 		 1048 aa  260  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.357877  normal  0.0252741 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16000  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.4 
 
 		 813 aa  254  3e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22980  DNA/RNA helicase, superfamily I  33.93 
 
 		 741 aa  251  4e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.51647  normal  0.435822 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1900  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.85 
 
 		 724 aa  245  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4508  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.58 
 
 		 693 aa  242  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5784  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.17 
 
 		 691 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3388  hypothetical protein  36.14 
 
 		 706 aa  239  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.667328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1438  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.68 
 
 		 767 aa  237  5.0000000000000005e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0481652  normal  0.535977 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09430  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.4 
 
 		 705 aa  234  5e-60  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.260549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2547  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.5 
 
 		 861 aa  233  6e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0101417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3630  hypothetical protein  35.22 
 
 		 705 aa  229  9e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000100418 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0171  superfamily I DNA and RNA helicase  31.98 
 
 		 759 aa  227  7e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0108  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  33.06 
 
 		 804 aa  224  6e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4531  putative helicase protein  32.78 
 
 		 726 aa  221  3e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0952  putative helicase  33.46 
 
 		 829 aa  216  8e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.249866 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1510  ATP-dependent DNA helicase  31.88 
 
 		 742 aa  216  9.999999999999999e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000268127 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0576  DNA or RNA helicase, Superfamily I family protein  30.12 
 
 		 758 aa  212  2e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0841204 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0962  hypothetical protein  34.41 
 
 		 703 aa  212  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.916066  normal  0.251911 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1511  ATP-dependent DNA helicase  31.25 
 
 		 742 aa  211  3e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2857  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  35.93 
 
 		 788 aa  205  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2623  uvrD/Rep helicase family protein  27.13 
 
 		 689 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000508135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2814  uvrD/Rep helicase family protein  27.13 
 
 		 689 aa  204  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000183326  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2539  UvrD/Rep helicase family protein  26.55 
 
 		 689 aa  203  9e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000078955  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5818  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.95 
 
 		 766 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.814611 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2615  UvrD/Rep helicase family protein  26.84 
 
 		 691 aa  200  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000204354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3796  putative helicase  32.06 
 
 		 735 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10650  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.99 
 
 		 747 aa  199  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.85506  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2821  uvrD/Rep helicase family protein  26.73 
 
 		 689 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000164243 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2572  UvrD/Rep helicase family protein  26.31 
 
 		 689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000433537  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2823  UvrD/Rep helicase family protein  27.08 
 
 		 691 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.271387  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0580  putative helicase  27.11 
 
 		 706 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.937698  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0566  helicase, putative  27.12 
 
 		 706 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.712813  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2469  UvrD/Rep helicase family protein  26.33 
 
 		 691 aa  197  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00119782  normal  0.334322 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1592  hypothetical protein  42.09 
 
 		 776 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.430325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2428  ATP-dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 726 aa  192  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0523427  normal  0.292743 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1110  hypothetical protein  28.59 
 
 		 702 aa  191  4e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.924141 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14320  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.42 
 
 		 758 aa  191  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.00598075  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1262  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  39.49 
 
 		 757 aa  189  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.188499  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2839  uvrD/Rep helicase family protein  26.43 
 
 		 689 aa  189  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000185117  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4104  AAA ATPase  43.48 
 
 		 799 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.133628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5266  putative helicase  33.24 
 
 		 724 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5355  putative helicase  33.24 
 
 		 724 aa  187  5e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1552  hypothetical protein  40.97 
 
 		 754 aa  186  8e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457555  normal  0.0469841 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3607  ATP-dependent DNA helicase  38.78 
 
 		 759 aa  186  9e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0408041 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5052  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  36.82 
 
 		 733 aa  186  1.0000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.540758  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1963  helicase  25.73 
 
 		 748 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2598  putative helicase  36.3 
 
 		 734 aa  185  2.0000000000000003e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75582 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1311  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  40.1 
 
 		 748 aa  183  8.000000000000001e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2150  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.68 
 
 		 746 aa  181  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.491919 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0765  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.57 
 
 		 832 aa  181  5.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.360581  normal  0.192195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3817  hypothetical protein  40.84 
 
 		 765 aa  180  7e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1591  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.25 
 
 		 763 aa  180  9e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.68447  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5043  superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  32.28 
 
 		 685 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1872  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.04 
 
 		 763 aa  179  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05760  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.96 
 
 		 755 aa  175  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.594948 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7576  hypothetical protein  35.28 
 
 		 795 aa  172  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0032  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  53.01 
 
 		 786 aa  169  1e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2425  hypothetical protein  36.05 
 
 		 771 aa  169  2e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.548064  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5583  putative helicase  35.28 
 
 		 874 aa  169  2e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2268  ATP-dependent DNA helicase replicase  26.06 
 
 		 753 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000472116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7542  hypothetical protein  36.03 
 
 		 761 aa  159  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.322202 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4189  hypothetical protein  41.41 
 
 		 902 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.060673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1632  ATP-dependent DNA helicase rep  25 
 
 		 703 aa  157  7e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0201  superfamily I DNA/RNA helicase-like protein  25.69 
 
 		 772 aa  157  8e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5645  putative helicase  46.54 
 
 		 724 aa  155  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577217  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0457  superfamily I DNA and RNA helicase  43.75 
 
 		 710 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4154  superfamily I DNA and RNA helicase  38.79 
 
 		 742 aa  148  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.534763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0213  superfamily I DNA and RNA helicases  29.88 
 
 		 717 aa  146  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13570  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.87 
 
 		 764 aa  143  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.176836 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1440  superfamily I DNA/RNA helicase  25.48 
 
 		 762 aa  142  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1826  superfamily I DNA and RNA helicase  34.11 
 
 		 716 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.200376  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2903  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  34.04 
 
 		 732 aa  131  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0195315  hitchhiker  0.0000337224 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3423  superfamily I DNA helicase  33.98 
 
 		 760 aa  130  9.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000327842  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1050  hypothetical protein  34.65 
 
 		 702 aa  128  3e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0895  superfamily I DNA helicase  32.34 
 
 		 755 aa  124  5e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.531504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0083  hypothetical protein  39.13 
 
 		 785 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1680  superfamily I DNA/RNA helicase  33.5 
 
 		 764 aa  122  3e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.119697  hitchhiker  0.00309861 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2861  uvrD/Rep helicase family protein  28.44 
 
 		 689 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000106246  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1882  superfamily I DNA/RNA helicase  32.92 
 
 		 787 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5180  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.07 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292486 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3352  superfamily I DNA and RNA helicase  37.61 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4227  helicase, UvrD/Rep family  35.82 
 
 		 778 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00019989  hitchhiker  0.000557099 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>