233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2962 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2962  Na+/H+ antiporter NhaA  100 
 
 		 481 aa  934    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1802  cyclic nucleotide-binding protein  50.6 
 
 		 876 aa  355  6.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668239  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0893  Na+/H+ antiporter NhaA  47.87 
 
 		 470 aa  353  4e-96  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2307  Na+/H+ antiporter NhaA  46.04 
 
 		 455 aa  348  9e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4950  Na+/H+ antiporter NhaA  48.13 
 
 		 465 aa  344  2e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0144  Na+/H+ antiporter NhaA  45.97 
 
 		 446 aa  343  4e-93  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.174095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3828  Na+/H+ antiporter NhaA  47.03 
 
 		 457 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0371269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2771  Na+/H+ antiporter NhaA  43.96 
 
 		 450 aa  327  3e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00813597  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5677  Na+/H+ antiporter NhaA  49.52 
 
 		 404 aa  325  9e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.575468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2941  pH-dependent sodium/proton antiporter  43 
 
 		 394 aa  315  9e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.135486  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3215  Na+/H+ antiporter NhaA  43.61 
 
 		 456 aa  313  4.999999999999999e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4069  Na+/H+ antiporter NhaA  43.88 
 
 		 455 aa  313  5.999999999999999e-84  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.16071 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1784  Na+/H+ antiporter NhaA  39.62 
 
 		 444 aa  312  1e-83  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3123  Na+/H+ antiporter NhaA  43.1 
 
 		 449 aa  311  2e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.158144  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2414  Na+/H+ antiporter NhaA  48.77 
 
 		 426 aa  310  4e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0173976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1390  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.46 
 
 		 391 aa  310  5e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000519432  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0868  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.52 
 
 		 391 aa  309  8e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.128339 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1649  Na+/H+ antiporter NhaA  42.27 
 
 		 468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.349535  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3059  Na+/H+ antiporter NhaA  43.56 
 
 		 452 aa  307  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3958  sodium-proton antiporter, NhaA family  43.41 
 
 		 453 aa  306  6e-82  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.529436 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  40.9 
 
 		 391 aa  305  9.000000000000001e-82  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1868  Na+/H+ antiporter NhaA  44.44 
 
 		 453 aa  305  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.138297 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1336  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 389 aa  302  1e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0732  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.63 
 
 		 409 aa  301  1e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1147  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.79 
 
 		 391 aa  301  2e-80  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1189  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.28 
 
 		 389 aa  299  7e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.685573  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3124  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.28 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.646901  normal  0.440513 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1266  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.28 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1233  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.28 
 
 		 389 aa  298  1e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6362  Na+/H+ antiporter NhaA  42.92 
 
 		 475 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5554  Na+/H+ antiporter NhaA  43.76 
 
 		 451 aa  298  2e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.477487  normal  0.958846 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1513  Na+/H+ antiporter NhaA  43.43 
 
 		 624 aa  298  2e-79  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0531977  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2570  Na+/H+ antiporter NhaA  41.8 
 
 		 472 aa  297  3e-79  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7296  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.6 
 
 		 399 aa  297  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.059957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4283  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.99 
 
 		 391 aa  296  7e-79  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2942  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 389 aa  295  8e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0919251  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2860  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 389 aa  295  1e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51740  Na+/H+ antiporter NhaA  44.26 
 
 		 446 aa  295  1e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.9845  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3038  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.77 
 
 		 389 aa  294  3e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0842  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.46 
 
 		 390 aa  292  7e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1136  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.01 
 
 		 399 aa  291  1e-77  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2853  Na+/H+ antiporter NhaA  44.06 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1762  Na(+)/H(+) antiporter 1  41.01 
 
 		 464 aa  291  2e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10430  Na+/H+ antiporter NhaA  42.4 
 
 		 444 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.745936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4533  sodium-proton antiporter NhaA  44.93 
 
 		 392 aa  290  3e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4662  Na+/H+ antiporter NhaA  40.38 
 
 		 438 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000933832 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2666  Na+/H+ antiporter NhaA  45.93 
 
 		 445 aa  289  6e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.657461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1867  Na+/H+ antiporter NhaA  42.79 
 
 		 616 aa  288  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1042  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.03 
 
 		 391 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.12391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0585  Na+/H+ antiporter NhaA  46.12 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0583  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.94 
 
 		 392 aa  286  5.999999999999999e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0187832  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5991  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.47 
 
 		 399 aa  286  7e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.688009  normal  0.157669 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1390  Na+/H+ antiporter NhaA  41.63 
 
 		 396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.168803  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2205  Na+/H+ antiporter NhaA  42.33 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.29594  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4197  Na+/H+ antiporter NhaA  42.62 
 
 		 401 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.917396  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1861  Na+/H+ antiporter NhaA  42.33 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.995313  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2568  Na+/H+ antiporter NhaA  44.2 
 
 		 424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.95 
 
 		 388 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.62168  normal  0.149849 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0042  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.95 
 
 		 388 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.975088  hitchhiker  0.00613874 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0043  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.95 
 
 		 388 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2456  Na+/H+ antiporter  42.59 
 
 		 438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00270708  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.95 
 
 		 388 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0065  Na+/H+ antiporter NhaA  43.69 
 
 		 402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000634714  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0044  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.95 
 
 		 388 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02646  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.19 
 
 		 391 aa  285  2.0000000000000002e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0694  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.65 
 
 		 398 aa  283  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000263731  hitchhiker  0.00301245 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0371  Na+/H+ antiporter NhaA  41.99 
 
 		 452 aa  283  6.000000000000001e-75  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3851  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.86 
 
 		 398 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.79655  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1896  pH-dependent sodium/proton antiporter  39.66 
 
 		 400 aa  281  2e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0128  Na+/H+ antiporter NhaA  45.02 
 
 		 399 aa  280  3e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.124586  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1488  Na+/H+ antiporter  39.13 
 
 		 386 aa  280  3e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3464  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.29 
 
 		 394 aa  280  5e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000517181  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1696  Na+/H+ antiporter NhaA  42.89 
 
 		 600 aa  280  6e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1132  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.24 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.422688  normal  0.012742 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4210  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.04 
 
 		 392 aa  278  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.400142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0369  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.09 
 
 		 399 aa  278  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0301682  hitchhiker  0.000785162 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3592  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.04 
 
 		 394 aa  279  1e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000151252  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1168  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.34 
 
 		 397 aa  278  1e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1234  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.89 
 
 		 395 aa  278  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.400812  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7481  putative sodium/proton antiporter  45.16 
 
 		 629 aa  277  2e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2616  Na+/H+ antiporter NhaA  44.28 
 
 		 391 aa  278  2e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.536675  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2582  Na+/H+ antiporter NhaA  42.99 
 
 		 393 aa  277  4e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1025  pH-dependent sodium/proton antiporter  41.03 
 
 		 391 aa  276  4e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2713  pH-dependent sodium/proton antiporter  44.56 
 
 		 430 aa  276  5e-73  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.532059  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003767  Na+/H+ antiporter NhaA type  40.89 
 
 		 383 aa  276  5e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6044  pH-dependent sodium/proton antiporter  45.21 
 
 		 400 aa  276  7e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.227636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3264  sodium-proton antiporter NhaA  40.3 
 
 		 382 aa  275  1.0000000000000001e-72  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000713954 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0795  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.64 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000129218  normal  0.24433 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05370  NA(+)/H(+) antiporter 1  37.67 
 
 		 435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.765198  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07000  Na+/H+ antiporter NhaA  40.77 
 
 		 514 aa  275  2.0000000000000002e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.107154  normal  0.0342501 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2026  pH-dependent sodium/proton antiporter  40.19 
 
 		 382 aa  274  2.0000000000000002e-72  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.470958  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3022  Na+/H+ antiporter NhaA  39.42 
 
 		 395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.396021  normal  0.0264038 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2277  pH-dependent sodium/proton antiporter  38.8 
 
 		 397 aa  274  3e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00329368  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1480  Na+/H+ antiporter NhaA  39.9 
 
 		 450 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.627445  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3657  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.11 
 
 		 398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.457018  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00573  Na+/H+ antiporter, NhaA  40.63 
 
 		 424 aa  273  7e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1756  Na+/H+ antiporter NhaA  38.95 
 
 		 394 aa  273  7e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0016  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.14 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000467126  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0017  pH-dependent sodium/proton antiporter  42.89 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0019  pH-dependent sodium/proton antiporter  43.14 
 
 		 388 aa  272  8.000000000000001e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0237343  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>