More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2509 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1704  recombination factor protein RarA  74.76 
 
 		 435 aa  657    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0939  recombination factor protein RarA  75 
 
 		 441 aa  651    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2242  recombination factor protein RarA  76.19 
 
 		 448 aa  665    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00131552  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2509  recombination factor protein RarA  100 
 
 		 435 aa  891    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0107971  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2067  recombination factor protein RarA  71.88 
 
 		 440 aa  630  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.792002  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2447  recombination factor protein RarA  71.8 
 
 		 434 aa  611  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1770  recombination factor protein RarA  71.56 
 
 		 434 aa  609  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000220644 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2328  recombination factor protein RarA  62.77 
 
 		 432 aa  531  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.279354  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1284  recombination factor protein RarA  56.26 
 
 		 443 aa  499  1e-140  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000241266  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1785  recombination factor protein RarA  54.52 
 
 		 447 aa  474  1e-133  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.295244  hitchhiker  0.00333986 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24410  recombination factor protein RarA  54.4 
 
 		 439 aa  476  1e-133  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2614  recombination factor protein RarA  54.61 
 
 		 447 aa  473  1e-132  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.794652 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3401  AAA ATPase central domain protein  55.04 
 
 		 463 aa  465  9.999999999999999e-131  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.365732  normal  0.230972 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1192  recombination factor protein RarA  53.9 
 
 		 445 aa  467  9.999999999999999e-131  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.211083  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12030  recombination factor protein RarA  53.21 
 
 		 450 aa  463  1e-129  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.51  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1672  recombination factor protein RarA  54.4 
 
 		 447 aa  462  1e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.339813 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0730  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 437 aa  459  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.44453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0767  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.369206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0767  recombination factor protein RarA  56.75 
 
 		 437 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.764171  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2133  recombination factor protein RarA  56.37 
 
 		 459 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1885  recombination factor protein RarA  53.85 
 
 		 447 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0976  AAA ATPase central domain protein  56.39 
 
 		 423 aa  455  1e-127  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2002  recombination factor protein RarA  52.64 
 
 		 447 aa  450  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1440  recombination factor protein RarA  52.9 
 
 		 426 aa  444  1e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1119  recombination factor protein RarA  53.24 
 
 		 457 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0774  recombination factor protein RarA  57.52 
 
 		 444 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0591315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0184  AAA ATPase central domain protein  55.24 
 
 		 426 aa  442  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.858304 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1710  recombination factor protein RarA  53.01 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0515171  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0617  recombination factor protein RarA  52.82 
 
 		 432 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.907625  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0537  AAA ATPase central domain protein  51.81 
 
 		 432 aa  439  9.999999999999999e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0323  AAA ATPase central domain protein  54.37 
 
 		 458 aa  438  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0732  recombination factor protein RarA  52.59 
 
 		 457 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0626  recombination factor protein RarA  53.32 
 
 		 453 aa  440  9.999999999999999e-123  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432966  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2041  recombination factor protein RarA  53.88 
 
 		 435 aa  439  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1091  ATPase, AAA family  51.29 
 
 		 457 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0953  recombination factor protein RarA  53.46 
 
 		 446 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1309  recombination factor protein RarA  52.28 
 
 		 457 aa  435  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.163372  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1103  recombination factor protein RarA  52.56 
 
 		 434 aa  438  1e-121  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3807  recombination factor protein RarA  52.4 
 
 		 505 aa  437  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.921575 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0855  recombination factor protein RarA  53.3 
 
 		 451 aa  437  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3121  recombination factor protein RarA  51.06 
 
 		 485 aa  436  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1393  recombination factor protein RarA  53.19 
 
 		 427 aa  432  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1040  recombination factor protein RarA  56.74 
 
 		 429 aa  433  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.405947  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2386  recombination factor protein RarA  52.96 
 
 		 440 aa  432  1e-120  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.010148 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2595  recombination factor protein RarA  53.72 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.743395  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0165  AAA ATPase central domain protein  53.18 
 
 		 419 aa  431  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2743  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  51.42 
 
 		 731 aa  430  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05640  putative ATPase, AAA family protein  52 
 
 		 425 aa  428  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.721032  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3406  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 441 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.355862 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4002  recombination factor protein RarA  53.72 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00336552 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1831  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 441 aa  425  1e-118  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.272086  hitchhiker  0.00967825 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1103  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  52.52 
 
 		 726 aa  426  1e-118  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000432194  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3607  recombination factor protein RarA  53.72 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889053 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1656  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000573735  hitchhiker  0.00861976 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1695  recombination factor protein RarA  51.05 
 
 		 444 aa  426  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.173001 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2481  recombination factor protein RarA  50.71 
 
 		 443 aa  425  1e-118  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000627884  hitchhiker  0.00000452551 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30320  recombination factor protein RarA  53.48 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0420  AAA ATPase central domain protein  52.78 
 
 		 423 aa  426  1e-118  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.781835 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1782  recombination factor protein RarA  52.45 
 
 		 435 aa  424  1e-117  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0836  recombination factor protein RarA  54.29 
 
 		 449 aa  422  1e-117  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3121  recombination factor protein RarA  53.41 
 
 		 459 aa  423  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0192623  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0410  recombination factor protein RarA  51.18 
 
 		 425 aa  422  1e-117  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.108672  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3583  recombination factor protein RarA  49.88 
 
 		 437 aa  422  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000174356  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0707  recombination factor protein RarA  48.21 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.56713  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1429  recombination factor protein RarA  52.25 
 
 		 438 aa  424  1e-117  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.530617  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00896  recombination protein  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.203608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2751  AAA ATPase central domain protein  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101047  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3347  ATPase, AAA family  51.54 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.22534  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2193  recombination factor protein RarA  50.12 
 
 		 443 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000160471  normal  0.268912 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3177  recombination factor protein RarA  51.77 
 
 		 440 aa  420  1e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0569954 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0027  AAA ATPase central domain protein  52.35 
 
 		 459 aa  418  1e-116  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.797145 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2158  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00790556  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0112  recombination factor protein RarA/unknown domain fusion protein  50.82 
 
 		 739 aa  419  1e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2213  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 443 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000293647  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2228  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.331515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1618  recombination factor protein RarA  53.22 
 
 		 445 aa  420  1e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1416  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0997  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0155118  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2458  recombination factor protein RarA  49.53 
 
 		 445 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00903  hypothetical protein  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.227866  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2321  recombination factor protein RarA  50.36 
 
 		 443 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000013456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2436  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  421  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203785  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1054  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  418  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0434989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28200  recombination factor protein RarA  53 
 
 		 441 aa  417  9.999999999999999e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.866353  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2704  recombination factor protein RarA  47.93 
 
 		 447 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20405  normal  0.882945 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0796  recombination factor protein RarA  47.74 
 
 		 455 aa  416  9.999999999999999e-116  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.24208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1027  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  415  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0967  recombination factor protein RarA  48.16 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.17279  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0967  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0751258  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1341  recombination factor protein RarA  51.17 
 
 		 440 aa  417  9.999999999999999e-116  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0553369  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1061  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1745  recombination factor protein RarA  51.31 
 
 		 443 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000175803  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2405  recombination factor protein RarA  50.98 
 
 		 420 aa  417  9.999999999999999e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1936  recombination factor protein RarA  50 
 
 		 432 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.160058  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0996  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1076  recombination factor protein RarA  48.39 
 
 		 447 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2009  recombination factor protein RarA  50.24 
 
 		 443 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107159  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0502  recombination factor protein RarA  51.07 
 
 		 444 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383176  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3584  recombination factor protein RarA  52.04 
 
 		 441 aa  412  1e-114  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.1367  normal  0.488195 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1280  recombination factor protein RarA  50.7 
 
 		 440 aa  414  1e-114  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.76998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>