More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1445 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  100 
 
 
188 aa  380  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  61.08 
 
 
192 aa  231  3e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  58.06 
 
 
186 aa  226  1e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  60.22 
 
 
184 aa  226  1e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  59.89 
 
 
188 aa  225  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  57.53 
 
 
201 aa  224  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  57.53 
 
 
201 aa  224  6e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  56.99 
 
 
186 aa  222  2e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  57.75 
 
 
188 aa  221  4.9999999999999996e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  56.99 
 
 
186 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  56.99 
 
 
186 aa  220  7e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  56.99 
 
 
186 aa  220  7e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3928  resolvase domain-containing protein  57.53 
 
 
191 aa  220  7e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.272515  hitchhiker  0.0000753359 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  56.45 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  56.99 
 
 
186 aa  220  9.999999999999999e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  55.91 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
186 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  57.14 
 
 
235 aa  217  7e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0043  hypothetical protein  58.38 
 
 
188 aa  217  8.999999999999998e-56  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  56.22 
 
 
186 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  56.22 
 
 
186 aa  216  1e-55  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
185 aa  215  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  55.91 
 
 
185 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  56.91 
 
 
189 aa  213  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  55.68 
 
 
205 aa  212  2.9999999999999995e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  55.38 
 
 
185 aa  211  2.9999999999999995e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3170  resolvase domain-containing protein  56.45 
 
 
200 aa  199  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00430122 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3523  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  55.98 
 
 
184 aa  194  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000257012  decreased coverage  0.00040401 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0884  Resolvase domain protein  51.93 
 
 
187 aa  193  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000364698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1312  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  54.26 
 
 
187 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.183881 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  54.82 
 
 
183 aa  185  3e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1735  putative resolvase  47.54 
 
 
188 aa  171  5e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1325  resolvase domain-containing protein  48.39 
 
 
192 aa  171  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2803  putative resolvase  46.99 
 
 
188 aa  170  9e-42  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.545302  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16170  resolvase  45.56 
 
 
207 aa  164  6.9999999999999995e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.982528  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1811  Resolvase domain protein  42.93 
 
 
183 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0297206  hitchhiker  0.00833685 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5336  transposon Tn21 resolvase  58.27 
 
 
129 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  40.66 
 
 
189 aa  134  5e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  41.18 
 
 
184 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  42.31 
 
 
184 aa  131  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  41.9 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  41.9 
 
 
191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  41.48 
 
 
186 aa  129  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4685  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
193 aa  127  7.000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 
188 aa  126  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  39.57 
 
 
188 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  42.08 
 
 
182 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  39.46 
 
 
185 aa  125  3e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2362  DNA-invertase  42.16 
 
 
188 aa  125  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0260  resolvase family site-specific recombinase  37.89 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1082  resolvase family site-specific recombinase  37.89 
 
 
205 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.271311  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2179  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
188 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0190993  hitchhiker  0.0022624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  43.48 
 
 
194 aa  124  7e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2946  resolvase domain-containing protein  39.66 
 
 
188 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0986415  normal  0.227448 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2319  resolvase, putative  44.12 
 
 
137 aa  123  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000512602  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5126  Resolvase domain protein  40.22 
 
 
197 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.114051 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1711  integrative genetic element Gsu5, resolvase  38.8 
 
 
190 aa  121  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0316952  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  40.11 
 
 
192 aa  121  6e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_011204  SeD_B0011  RlgA  41.08 
 
 
186 aa  120  9e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.928686  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  36.17 
 
 
189 aa  120  9e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  42.61 
 
 
218 aa  119  1.9999999999999998e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  37.43 
 
 
197 aa  119  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_010373  M446_7006  hypothetical protein  40.86 
 
 
183 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  37.16 
 
 
190 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5457  hypothetical protein  40.21 
 
 
194 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5424  Resolvase domain  40.21 
 
 
194 aa  119  3e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  41.3 
 
 
196 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  39.67 
 
 
186 aa  118  3.9999999999999996e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_42  putative resolvase  38.25 
 
 
181 aa  118  6e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0684051  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0466  Resolvase domain  37.5 
 
 
205 aa  118  6e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.418385  normal  0.0169839 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
201 aa  118  6e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  37.43 
 
 
198 aa  117  9e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  40.43 
 
 
191 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  39.34 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25710  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  39.18 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.7 
 
 
201 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4991  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0235  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
187 aa  115  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1052  Resolvase domain  36.96 
 
 
186 aa  115  5e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3124  resolvase domain-containing protein  45.07 
 
 
194 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0904767  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0580  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 
186 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0611  Resolvase domain protein  41.71 
 
 
186 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0605  resolvase domain-containing protein  41.71 
 
 
186 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.177837 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  37.5 
 
 
199 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  37.97 
 
 
184 aa  114  7.999999999999999e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  39.79 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  39.79 
 
 
192 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  39.13 
 
 
189 aa  114  7.999999999999999e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009777  VIBHAR_p08245  resolvase  35.68 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  37.31 
 
 
195 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_010374  M446_7059  hypothetical protein  38.71 
 
 
183 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4091  Resolvase domain  35.29 
 
 
186 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5459  resolvase domain-containing protein  38.33 
 
 
190 aa  112  2.0000000000000002e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.358499  normal 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  38.71 
 
 
189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>