More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_3280 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001301  ANIA_05886  alpha isopropylmalate isomerase (Eurofung)  65.75 
 
 		 772 aa  638    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00198619  normal  0.994666 
 
 
-
 
NC_004310  BR1906  isopropylmalate isomerase large subunit  68.97 
 
 		 469 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.276241  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4084  isopropylmalate isomerase large subunit  67.74 
 
 		 469 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.774814  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2314  isopropylmalate isomerase large subunit  67.24 
 
 		 469 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1922  isopropylmalate isomerase large subunit  70.24 
 
 		 467 aa  656    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2785  isopropylmalate isomerase large subunit  65.51 
 
 		 468 aa  635    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.378068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0863  isopropylmalate isomerase large subunit  68.09 
 
 		 475 aa  647    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1245  isopropylmalate isomerase large subunit  68.52 
 
 		 470 aa  644    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.923179  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2523  isopropylmalate isomerase large subunit  68.09 
 
 		 475 aa  646    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.520601  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3759  isopropylmalate isomerase large subunit  67.96 
 
 		 469 aa  640    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1189  isopropylmalate isomerase large subunit  68.25 
 
 		 472 aa  669    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.672672  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  67.32 
 
 		 470 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.266094 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0363  isopropylmalate isomerase large subunit  67.03 
 
 		 468 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.271446  normal  0.532793 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1705  isopropylmalate isomerase large subunit  69.44 
 
 		 468 aa  666    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0785429  hitchhiker  0.00273209 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0819  isopropylmalate isomerase large subunit  69.03 
 
 		 470 aa  650    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1423  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.03 
 
 		 473 aa  651    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3280  isopropylmalate isomerase large subunit  100 
 
 		 467 aa  948    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1416  isopropylmalate isomerase large subunit  69.03 
 
 		 470 aa  649    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.941586  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2475  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.891959  normal  0.311686 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0636  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  66.16 
 
 		 468 aa  636    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0643204 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2149  isopropylmalate isomerase large subunit  75.22 
 
 		 466 aa  730    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.754808  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2316  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  69.74 
 
 		 480 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0965913 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4757  isopropylmalate isomerase large subunit  67.46 
 
 		 469 aa  645    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1228  isopropylmalate isomerase large subunit  67.74 
 
 		 469 aa  634    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896395 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0947  isopropylmalate isomerase large subunit  67.74 
 
 		 469 aa  647    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1812  isopropylmalate isomerase large subunit  67.6 
 
 		 466 aa  639    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.364535  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0158  isopropylmalate isomerase large subunit  67.45 
 
 		 472 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4355  isopropylmalate isomerase large subunit  67.46 
 
 		 480 aa  645    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2520  isopropylmalate isomerase large subunit  69.16 
 
 		 478 aa  639    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3059  isopropylmalate isomerase large subunit  69.25 
 
 		 469 aa  652    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4707  isopropylmalate isomerase large subunit  68.09 
 
 		 479 aa  644    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1834  isopropylmalate isomerase large subunit  68.97 
 
 		 469 aa  654    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.538456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1565  isopropylmalate isomerase large subunit  66.67 
 
 		 472 aa  635    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.046679  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4879  isopropylmalate isomerase large subunit  67.03 
 
 		 469 aa  642    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.29662  normal  0.101077 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1821  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.626663  normal  0.539563 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1343  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  67.82 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.444862 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02270  3-isopropylmalate dehydratase, putative  64.23 
 
 		 762 aa  632  1e-180  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0205062  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4223  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 469 aa  632  1e-180  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3448  isopropylmalate isomerase large subunit  66.24 
 
 		 469 aa  634  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2103  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  65.86 
 
 		 470 aa  631  1e-180  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0775087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0240  isopropylmalate isomerase large subunit  64.45 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3579  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.482085  normal  0.399315 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2454  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0296584  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28677  predicted protein  65.31 
 
 		 722 aa  629  1e-179  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2316  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 469 aa  628  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1921  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.724454  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0672  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00206744  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0227  isopropylmalate isomerase large subunit  64.66 
 
 		 473 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00400027 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3584  isopropylmalate isomerase large subunit  65.94 
 
 		 468 aa  629  1e-179  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.931395  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2145  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 469 aa  630  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4418  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4630  isopropylmalate isomerase large subunit  66.38 
 
 		 477 aa  629  1e-179  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3949  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-179  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0520  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1729  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.405505  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0778  isopropylmalate isomerase large subunit  66.81 
 
 		 479 aa  627  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000809283  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2133  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 469 aa  625  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0241304 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6850  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.670748 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1422  isopropylmalate isomerase large subunit  67.3 
 
 		 473 aa  626  1e-178  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0348  isopropylmalate isomerase large subunit  64.86 
 
 		 470 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2889  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1057  isopropylmalate isomerase large subunit  64.88 
 
 		 469 aa  624  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.960077  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1849  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0604506  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0764  isopropylmalate isomerase large subunit  65.1 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3340  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.184073  normal  0.862322 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1641  isopropylmalate isomerase large subunit  66.6 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.159625  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3844  isopropylmalate isomerase large subunit  65.95 
 
 		 469 aa  627  1e-178  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.777096 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4367  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2065  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 470 aa  622  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1990  isopropylmalate isomerase large subunit  65.31 
 
 		 469 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.508129  normal  0.146532 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3071  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 468 aa  624  1e-177  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1170  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 478 aa  622  1e-177  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.910867  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3229  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 473 aa  623  1e-177  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0550685  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0504  isopropylmalate isomerase large subunit  65.08 
 
 		 470 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2582  isopropylmalate isomerase large subunit  66.17 
 
 		 473 aa  622  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2164  isopropylmalate isomerase large subunit  66.74 
 
 		 479 aa  624  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.170701 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0216  isopropylmalate isomerase large subunit  65.4 
 
 		 480 aa  618  1e-176  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.146559 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34280  isopropylmalate isomerase large subunit  66.31 
 
 		 474 aa  619  1e-176  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3608  isopropylmalate isomerase large subunit  66.03 
 
 		 473 aa  618  1e-176  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1223  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 473 aa  619  1e-176  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.10034  normal  0.0157674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2012  isopropylmalate isomerase large subunit  65.54 
 
 		 474 aa  615  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0300931  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0775  isopropylmalate isomerase large subunit  64.96 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2935  isopropylmalate isomerase large subunit  65.74 
 
 		 469 aa  615  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02613  isopropylmalate isomerase large subunit  65.04 
 
 		 482 aa  616  1e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0194  3-isopropylmalate dehydratase, large subunit  64.52 
 
 		 469 aa  617  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2508  isopropylmalate isomerase large subunit  66.88 
 
 		 467 aa  615  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2129  isopropylmalate isomerase large subunit  67.73 
 
 		 476 aa  615  1e-175  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0624  isopropylmalate isomerase large subunit  64.96 
 
 		 470 aa  617  1e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1985  isopropylmalate isomerase large subunit  65.47 
 
 		 477 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.682408  normal  0.0241842 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1516  isopropylmalate isomerase large subunit  65.47 
 
 		 477 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11161  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2723  isopropylmalate isomerase large subunit  64.69 
 
 		 475 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00243563  normal  0.0720472 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_68659  3-isopropylmalate dehydratase  61.31 
 
 		 770 aa  611  9.999999999999999e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.161777 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0135  isopropylmalate isomerase large subunit  65.03 
 
 		 468 aa  611  9.999999999999999e-175  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0383908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2086  isopropylmalate isomerase large subunit  64.62 
 
 		 472 aa  612  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3774  isopropylmalate isomerase large subunit  65.47 
 
 		 477 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23750  isopropylmalate isomerase large subunit  65.54 
 
 		 474 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0168844 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0861  isopropylmalate isomerase large subunit  62.88 
 
 		 471 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1548  isopropylmalate isomerase large subunit  65.25 
 
 		 477 aa  611  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.272021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00074  isopropylmalate isomerase large subunit  64.44 
 
 		 466 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0085  isopropylmalate isomerase large subunit  65.46 
 
 		 467 aa  608  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.362256  normal  0.223362 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>