57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0306 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0306  hypothetical protein  100 
 
 		 644 aa  1271    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.919182  decreased coverage  0.00578351 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1987  hypothetical protein  35.91 
 
 		 499 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2619  hypothetical protein  32.56 
 
 		 460 aa  143  8e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0605452  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1763  hypothetical protein  34.69 
 
 		 516 aa  141  3e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.85755  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1166  triple helix repeat-containing collagen  36.28 
 
 		 1050 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.000520628  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5397  hypothetical protein  31.07 
 
 		 465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4889  hypothetical protein  30.51 
 
 		 447 aa  131  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.322179 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0641  hypothetical protein  29.78 
 
 		 594 aa  127  5e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  decreased coverage  0.00375147  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2933  hypothetical protein  31.3 
 
 		 469 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2113  hypothetical protein  28.46 
 
 		 493 aa  114  5e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.234838  normal  0.126619 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0421  hypothetical protein  25.34 
 
 		 738 aa  114  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5071  triple helix repeat-containing collagen  33.84 
 
 		 465 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0278582  normal  0.141411 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2282  hypothetical protein  32.93 
 
 		 452 aa  103  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2062  hypothetical protein  32.18 
 
 		 418 aa  102  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5751  hypothetical protein  34.24 
 
 		 363 aa  102  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.357131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4881  Collagen triple helix repeat protein  31.15 
 
 		 743 aa  102  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3487  triple helix repeat-containing collagen  34.22 
 
 		 848 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18885 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2422  hypothetical protein  32.99 
 
 		 283 aa  98.6  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.756462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0663  hypothetical protein  27.78 
 
 		 1503 aa  97.8  5e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.994599  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0772  hypothetical protein  31.34 
 
 		 266 aa  94.4  7e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.585439  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0722  hypothetical protein  30.88 
 
 		 266 aa  92.4  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3516  hypothetical protein  31.64 
 
 		 346 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3940  hypothetical protein  35.76 
 
 		 273 aa  87  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6773  hypothetical protein  31.36 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1179  hypothetical protein  28.83 
 
 		 343 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.983645  normal  0.0540579 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4207  triple helix repeat-containing collagen  30.86 
 
 		 346 aa  79.3  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.532408 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4724  collagen triple helix repeat  27.32 
 
 		 342 aa  77.4  0.0000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.958299  normal  0.038222 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6774  peptidase metallopeptidase  30.87 
 
 		 641 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.486131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1453  hypothetical protein  27.71 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.445258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3178  hypothetical protein  30.63 
 
 		 292 aa  74.7  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.187373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4817  hypothetical protein  30.07 
 
 		 212 aa  74.7  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.542662 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0294  hemolysin-type calcium-binding region  24.51 
 
 		 589 aa  71.2  0.00000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2108  hypothetical protein  31.06 
 
 		 353 aa  70.5  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2490  hemolysin-type calcium-binding protein  28.85 
 
 		 833 aa  69.7  0.0000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0747804  normal  0.0246403 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3159  hypothetical protein  28.66 
 
 		 322 aa  64.3  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0953  hypothetical protein  27.95 
 
 		 364 aa  61.2  0.00000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3785  hemolysin-type calcium-binding region  23.03 
 
 		 792 aa  61.2  0.00000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0346171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0010  hypothetical protein  28.66 
 
 		 425 aa  60.8  0.00000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  28.1 
 
 		 950 aa  59.7  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  27.88 
 
 		 1462 aa  59.3  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0780  hypothetical protein  26.9 
 
 		 340 aa  56.6  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2465  hemolysin-type calcium-binding region  25.79 
 
 		 561 aa  56.6  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.798132  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0133  putative type I secretion target repeat protein  28.57 
 
 		 319 aa  56.2  0.000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.749153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3087  hypothetical protein  28.06 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1574  hypothetical protein  27.37 
 
 		 207 aa  55.5  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.010056  normal  0.553816 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0911  hypothetical protein  24.24 
 
 		 232 aa  55.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0645348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0264  hypothetical protein  26.49 
 
 		 352 aa  54.7  0.000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1434  type I secretion target repeat-containing protein  26.28 
 
 		 220 aa  54.3  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.27327  normal  0.163462 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1836  hypothetical protein  28.39 
 
 		 369 aa  53.1  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.934972 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2930  hypothetical protein  27.06 
 
 		 207 aa  52.8  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.505078  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3041  hemolysin-type calcium-binding region  26.99 
 
 		 1043 aa  48.9  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2690  hemolysin-type calcium-binding region  25.82 
 
 		 767 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.969151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0232  hypothetical protein  28 
 
 		 356 aa  45.8  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0353  hypothetical protein  25 
 
 		 530 aa  45.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3000  hypothetical protein  24.2 
 
 		 526 aa  44.7  0.006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.592771  normal  0.37885 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1505  hypothetical protein  27.74 
 
 		 398 aa  44.3  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0183734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0234  hypothetical protein  26.67 
 
 		 354 aa  43.9  0.01  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>