More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0986 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 312 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  50.35 
 
 		 298 aa  239  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  43.77 
 
 		 296 aa  202  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 		 321 aa  194  1e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  39 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  38.18 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  40.75 
 
 		 511 aa  167  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.2 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  35.39 
 
 		 309 aa  162  5.0000000000000005e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  38.93 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.23 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  35.31 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  34.9 
 
 		 330 aa  155  9e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.85 
 
 		 293 aa  154  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  35.56 
 
 		 322 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  34.73 
 
 		 339 aa  151  1e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 303 aa  151  1e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  34.53 
 
 		 313 aa  152  1e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  36.33 
 
 		 393 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.33 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.69 
 
 		 320 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 303 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  30.5 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.97 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  35.97 
 
 		 291 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.97 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  35.61 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  35.97 
 
 		 320 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  32.53 
 
 		 329 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.08 
 
 		 297 aa  144  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 		 304 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  35.06 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  34.94 
 
 		 304 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.63 
 
 		 296 aa  142  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  28.48 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  32.04 
 
 		 324 aa  140  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  31.89 
 
 		 310 aa  139  6e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.09 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.43 
 
 		 308 aa  138  1e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  35.34 
 
 		 306 aa  137  2e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  30.8 
 
 		 307 aa  137  2e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  34.85 
 
 		 333 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 		 330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  31.94 
 
 		 297 aa  127  3e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  28.88 
 
 		 398 aa  124  1e-27  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 309 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  28.03 
 
 		 316 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  28.37 
 
 		 316 aa  97.1  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  26.99 
 
 		 316 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.68 
 
 		 316 aa  96.3  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  27.68 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  27.68 
 
 		 316 aa  95.9  9e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  27.34 
 
 		 316 aa  95.1  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  27.34 
 
 		 316 aa  92.8  7e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  23.93 
 
 		 350 aa  91.7  1e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  26.99 
 
 		 316 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 316 aa  90.5  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  26.93 
 
 		 326 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.09 
 
 		 309 aa  85.1  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.12 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.24 
 
 		 323 aa  83.2  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 317 aa  82.4  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 		 314 aa  82.4  0.000000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  28.14 
 
 		 353 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  29.15 
 
 		 311 aa  81.6  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.06 
 
 		 365 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.59 
 
 		 345 aa  80.5  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  30.63 
 
 		 298 aa  79.7  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.36 
 
 		 301 aa  79.7  0.00000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.2 
 
 		 315 aa  79.3  0.00000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.15 
 
 		 320 aa  77.4  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  25.63 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  26.37 
 
 		 316 aa  77  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1164  periplasmic solute binding protein  28.16 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.231796 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  27.56 
 
 		 310 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  23.55 
 
 		 282 aa  74.7  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  24.68 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  29.2 
 
 		 314 aa  73.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  29.2 
 
 		 317 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0224  periplasmic solute binding protein  27.62 
 
 		 368 aa  73.2  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.59 
 
 		 307 aa  73.2  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  27.09 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.33 
 
 		 292 aa  72.8  0.000000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2141  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.67 
 
 		 317 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  29.29 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 		 325 aa  72  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.86 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.62 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0123  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 307 aa  70.9  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.41 
 
 		 313 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  22.52 
 
 		 307 aa  70.5  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 309 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>