More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0239 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 310 aa  612  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  57.36 
 
 		 316 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  43.94 
 
 		 321 aa  247  2e-64  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  44.82 
 
 		 328 aa  236  5.0000000000000005e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  47.39 
 
 		 296 aa  229  6e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.66 
 
 		 301 aa  181  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  40.07 
 
 		 298 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  37.97 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  37.09 
 
 		 330 aa  166  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  36.7 
 
 		 303 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  37.77 
 
 		 322 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  36.33 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  35.79 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  37.07 
 
 		 294 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  37.62 
 
 		 310 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  36.5 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  37.13 
 
 		 393 aa  159  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.5 
 
 		 320 aa  159  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.13 
 
 		 320 aa  158  9e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  36.15 
 
 		 304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  33.43 
 
 		 343 aa  155  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.76 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.76 
 
 		 320 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.76 
 
 		 312 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  35.97 
 
 		 329 aa  155  9e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  36.76 
 
 		 291 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  32 
 
 		 303 aa  153  4e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  33.66 
 
 		 297 aa  151  1e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  35.58 
 
 		 333 aa  149  4e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.9 
 
 		 293 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  36.73 
 
 		 309 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  30.58 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.53 
 
 		 308 aa  145  1e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  32.77 
 
 		 312 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.87 
 
 		 308 aa  139  4.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.08 
 
 		 296 aa  137  3.0000000000000003e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  37.96 
 
 		 511 aa  132  6.999999999999999e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  37.4 
 
 		 306 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  32.25 
 
 		 309 aa  126  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  30.87 
 
 		 330 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  32.65 
 
 		 298 aa  124  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  31.08 
 
 		 339 aa  124  2e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  32.31 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.67 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 324 aa  117  3e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  31.74 
 
 		 307 aa  109  5e-23  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  29.52 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  28.8 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  22.86 
 
 		 293 aa  84.3  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  27.54 
 
 		 292 aa  82.4  0.000000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  22.51 
 
 		 301 aa  80.5  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  23.47 
 
 		 350 aa  80.5  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.53 
 
 		 313 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.34 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 346 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  27.66 
 
 		 292 aa  75.1  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 		 309 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  24.48 
 
 		 333 aa  75.1  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.52 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  25.51 
 
 		 324 aa  73.9  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  20.78 
 
 		 298 aa  73.2  0.000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  30.05 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.69 
 
 		 292 aa  71.6  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  25.64 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  21.75 
 
 		 316 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 346 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  24.79 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  20.45 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  21.12 
 
 		 317 aa  70.5  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  25.21 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.36 
 
 		 316 aa  69.7  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  25.21 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25.6 
 
 		 310 aa  69.7  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  25.21 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06745  hypothetical protein  27.04 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  32.2 
 
 		 318 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  28.27 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.79 
 
 		 316 aa  68.9  0.00000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  27.39 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.93 
 
 		 316 aa  68.6  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1794  hypothetical protein  26.49 
 
 		 311 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.79 
 
 		 316 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  24.92 
 
 		 353 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  22.46 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.5 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2025  Mn/Zn ABC transporter, substrate-binding protein  23.88 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  24.75 
 
 		 317 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0195  periplasmic solute binding protein  24.2 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.591767  normal  0.474509 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 301 aa  67.8  0.0000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  31.87 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.55 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  26.32 
 
 		 323 aa  67  0.0000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  25.68 
 
 		 309 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  22.52 
 
 		 328 aa  66.6  0.0000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  24.44 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  24.38 
 
 		 310 aa  66.2  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>