292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0747 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  100 
 
 
398 aa  802    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  43.42 
 
 
350 aa  260  3e-68  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  49.23 
 
 
307 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  32.84 
 
 
343 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  33.1 
 
 
339 aa  160  4e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 
298 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  36.84 
 
 
298 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 
298 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.3 
 
 
308 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  33.07 
 
 
296 aa  138  1e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  29.01 
 
 
330 aa  137  2e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  28.74 
 
 
303 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  29.48 
 
 
317 aa  132  2.0000000000000002e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.93 
 
 
308 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 
321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 
322 aa  123  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  32.79 
 
 
309 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.71 
 
 
293 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  28.62 
 
 
296 aa  121  1.9999999999999998e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  31.52 
 
 
313 aa  121  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  30.17 
 
 
309 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  32.16 
 
 
330 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  28.57 
 
 
511 aa  120  6e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  31.34 
 
 
297 aa  119  7e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  27.04 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  29.96 
 
 
324 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 
312 aa  117  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  31.84 
 
 
298 aa  116  7.999999999999999e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  27.92 
 
 
310 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  27.92 
 
 
294 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  28.97 
 
 
393 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.97 
 
 
312 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.97 
 
 
320 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.97 
 
 
320 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  28.97 
 
 
320 aa  113  6e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  29.37 
 
 
320 aa  113  7.000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  28.97 
 
 
291 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  32 
 
 
306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  29.93 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 
304 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 
303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  31.37 
 
 
304 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  30.98 
 
 
304 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  30.34 
 
 
303 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  28.17 
 
 
333 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
316 aa  106  8e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  26.97 
 
 
312 aa  102  1e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.87 
 
 
297 aa  100  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.3 
 
 
301 aa  99  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 
310 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.96 
 
 
293 aa  96.3  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  27.49 
 
 
298 aa  86.7  6e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  27.09 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 
318 aa  83.6  0.000000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 
309 aa  81.3  0.00000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 
308 aa  77  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.48 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 
292 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2226  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  24.57 
 
 
323 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118705  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  28.08 
 
 
292 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  32.9 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  23.25 
 
 
296 aa  66.6  0.0000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 
292 aa  66.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.04 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  27.43 
 
 
309 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  30.72 
 
 
301 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  21.15 
 
 
282 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0297  periplasmic solute binding protein  26.03 
 
 
316 aa  65.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0234277  normal  0.0497295 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.03 
 
 
349 aa  64.3  0.000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  26.29 
 
 
292 aa  63.9  0.000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  25.13 
 
 
301 aa  63.5  0.000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.97 
 
 
294 aa  63.2  0.000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  28.8 
 
 
307 aa  62.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  23.35 
 
 
306 aa  62.8  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.41 
 
 
304 aa  62.4  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1604  ABC transporter substrate-binding protein  27.16 
 
 
308 aa  62  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0613847 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  27.22 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11141  hypothetical protein  22.85 
 
 
324 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.201387 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  24.86 
 
 
303 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  27.11 
 
 
302 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.97 
 
 
304 aa  61.6  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2983  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  21.86 
 
 
317 aa  60.5  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3014  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0700149 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3050  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0195762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3066  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.354258  normal  0.0719754 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3171  periplasmic chelated iron-binding protein YfeA  25 
 
 
305 aa  60.5  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.866924 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  22.89 
 
 
309 aa  60.1  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
292 aa  60.5  0.00000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  28.4 
 
 
280 aa  60.5  0.00000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  33 
 
 
321 aa  60.1  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  37.31 
 
 
312 aa  59.7  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  22.96 
 
 
320 aa  59.7  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0688  periplasmic solute binding protein  24.03 
 
 
314 aa  59.3  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000152738  normal  0.0354959 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  25.83 
 
 
325 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 
313 aa  58.5  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3392  periplasmic solute binding protein  40.3 
 
 
320 aa  58.9  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00563427  normal  0.0658085 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2176  periplasmic solute binding protein  27.5 
 
 
320 aa  58.2  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1397  periplasmic solute binding protein  26.82 
 
 
299 aa  58.9  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.682117  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>