297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_2086 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 330 aa  666    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  55.81 
 
 		 324 aa  305  9.000000000000001e-82  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  46.89 
 
 		 309 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  40.15 
 
 		 317 aa  221  9.999999999999999e-57  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  36.7 
 
 		 313 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  37.83 
 
 		 339 aa  176  5e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  37.36 
 
 		 330 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  36.98 
 
 		 322 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 		 303 aa  171  1e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  36.16 
 
 		 303 aa  171  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.04 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.41 
 
 		 320 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  37.04 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.67 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.67 
 
 		 312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.67 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  36.67 
 
 		 291 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  35.8 
 
 		 304 aa  165  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  34.89 
 
 		 304 aa  165  9e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  35.94 
 
 		 304 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.38 
 
 		 308 aa  165  1.0000000000000001e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  37.95 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  41.09 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  33.95 
 
 		 329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  39.73 
 
 		 297 aa  163  4.0000000000000004e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  40.73 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  40.73 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  35.16 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  33.59 
 
 		 307 aa  157  2e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  34.77 
 
 		 333 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  32.67 
 
 		 310 aa  147  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.87 
 
 		 294 aa  145  7.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  29.43 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  31.95 
 
 		 316 aa  142  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  29.01 
 
 		 398 aa  138  1e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.01 
 
 		 293 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.59 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  29.76 
 
 		 312 aa  136  6.0000000000000005e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.59 
 
 		 308 aa  122  8e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  34.12 
 
 		 511 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 312 aa  116  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  32.73 
 
 		 306 aa  115  8.999999999999998e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  31.72 
 
 		 310 aa  113  6e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  28.98 
 
 		 328 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  30.36 
 
 		 298 aa  106  7e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  28.86 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.09 
 
 		 297 aa  104  2e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  26.27 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.88 
 
 		 292 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  32.3 
 
 		 301 aa  95.9  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  26.69 
 
 		 350 aa  95.1  2e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 		 292 aa  89  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  25.52 
 
 		 292 aa  87.4  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  25.96 
 
 		 291 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0843  periplasmic solute-binding protein  29.44 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.620273  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1601  periplasmic solute binding protein  30 
 
 		 325 aa  81.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.298891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3500  periplasmic solute binding protein  27.24 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.639001  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  29.57 
 
 		 301 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  24.43 
 
 		 292 aa  81.3  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2784  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 301 aa  81.6  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199172  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 301 aa  80.9  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 		 309 aa  80.5  0.00000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2998  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 		 311 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0528665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  26.55 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  26.15 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.97 
 
 		 309 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  25.93 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 		 307 aa  76.6  0.0000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0370  periplasmic solute binding protein  32.82 
 
 		 309 aa  75.9  0.0000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  24.64 
 
 		 307 aa  75.9  0.0000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.79 
 
 		 317 aa  75.5  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 313 aa  75.5  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  31.02 
 
 		 305 aa  75.5  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3218  periplasmic solute binding protein  30.82 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0863891  normal  0.580114 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  24.31 
 
 		 318 aa  73.6  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0180  periplasmic solute binding protein  25.35 
 
 		 301 aa  73.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.946938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3625  periplasmic solute binding protein  26.78 
 
 		 326 aa  72.8  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  27.85 
 
 		 293 aa  72.4  0.00000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  24.24 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2635  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  26.47 
 
 		 298 aa  70.1  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0828517  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2553  periplasmic solute binding protein  23.17 
 
 		 319 aa  69.7  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1341  ABC transporter substrate-binding protein  27.35 
 
 		 291 aa  69.3  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.328207 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2914  periplasmic solute binding protein  25.7 
 
 		 301 aa  69.3  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5591  periplasmic solute binding protein  25.16 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.12 
 
 		 303 aa  68.6  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  22.64 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1388  periplasmic solute binding protein  27.97 
 
 		 312 aa  68.2  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  0.503002 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2483  periplasmic solute binding protein  24.73 
 
 		 317 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1312  periplasmic solute binding protein  23.26 
 
 		 306 aa  67.4  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.14 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  22.16 
 
 		 332 aa  66.6  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0678  periplasmic solute binding protein  26.94 
 
 		 299 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0630556 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.1 
 
 		 304 aa  66.2  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 304 aa  65.1  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  25.37 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>