More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1454 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 339 aa  680    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  68.31 
 
 		 343 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  65.37 
 
 		 298 aa  362  6e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  64.08 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  64.08 
 
 		 298 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  37.83 
 
 		 330 aa  175  8e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  37.85 
 
 		 313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  35.99 
 
 		 324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  32.42 
 
 		 398 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  36.2 
 
 		 304 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  34.95 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  37.59 
 
 		 303 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  35.89 
 
 		 330 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  37.77 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  32.59 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  31.56 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.63 
 
 		 320 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  32.16 
 
 		 317 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.84 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.84 
 
 		 320 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  36.84 
 
 		 291 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  37.54 
 
 		 393 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.84 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.98 
 
 		 320 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  35.19 
 
 		 322 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  37.41 
 
 		 309 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  36.96 
 
 		 304 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  32.91 
 
 		 312 aa  146  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  31.91 
 
 		 316 aa  142  8e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  32.49 
 
 		 310 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  33.7 
 
 		 329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.24 
 
 		 308 aa  141  1.9999999999999998e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  31.19 
 
 		 294 aa  138  1e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  34.88 
 
 		 328 aa  137  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  33.13 
 
 		 296 aa  136  5e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  35.59 
 
 		 333 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  33.11 
 
 		 297 aa  134  3e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.36 
 
 		 309 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.43 
 
 		 296 aa  119  6e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  27.22 
 
 		 293 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  30.27 
 
 		 306 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  32.43 
 
 		 511 aa  115  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.32 
 
 		 297 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.02 
 
 		 308 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  30.74 
 
 		 310 aa  111  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  23.82 
 
 		 303 aa  107  4e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  34.63 
 
 		 301 aa  105  9e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  31.07 
 
 		 298 aa  100  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  24.26 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.45 
 
 		 320 aa  87.8  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.42 
 
 		 353 aa  87  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 307 aa  83.2  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  25.84 
 
 		 309 aa  82.4  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  28.17 
 
 		 333 aa  79.7  0.00000000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.21 
 
 		 317 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  22.51 
 
 		 318 aa  76.6  0.0000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  36.75 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  22.64 
 
 		 307 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.35 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1597  periplasmic solute binding protein  30.94 
 
 		 309 aa  73.9  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0467055 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  28.69 
 
 		 309 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  26.72 
 
 		 292 aa  73.2  0.000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  24.28 
 
 		 323 aa  72  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  30.26 
 
 		 313 aa  72  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  22.92 
 
 		 316 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.79 
 
 		 316 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  31.06 
 
 		 303 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.78 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  27.86 
 
 		 321 aa  70.9  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  21.5 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  23.45 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  23.45 
 
 		 316 aa  70.1  0.00000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 		 309 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  24.32 
 
 		 311 aa  69.7  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.07 
 
 		 345 aa  69.7  0.00000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  24.85 
 
 		 325 aa  69.7  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.45 
 
 		 316 aa  69.3  0.00000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 307 aa  69.3  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.45 
 
 		 316 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  25.9 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  25.79 
 
 		 292 aa  68.9  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  25.37 
 
 		 345 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  25.87 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  32.35 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  27.99 
 
 		 305 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  20.93 
 
 		 316 aa  67.4  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  27.72 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  22.59 
 
 		 314 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2368  periplasmic solute binding protein  26.17 
 
 		 298 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000358992  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  20.45 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  24.28 
 
 		 303 aa  66.2  0.0000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3176  periplasmic solute binding protein  27.45 
 
 		 292 aa  66.2  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  22.91 
 
 		 282 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  24.26 
 
 		 315 aa  65.5  0.000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4830  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  42.05 
 
 		 301 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>