More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12096 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  100 
 
 		 511 aa  1006    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  40.59 
 
 		 296 aa  159  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  39.2 
 
 		 316 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  40.42 
 
 		 298 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  40.75 
 
 		 312 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  42.13 
 
 		 301 aa  140  6e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  32.88 
 
 		 321 aa  139  8.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  35.08 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  34.32 
 
 		 328 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  34.6 
 
 		 329 aa  130  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  34.8 
 
 		 393 aa  128  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  31.28 
 
 		 317 aa  126  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  37.96 
 
 		 310 aa  126  1e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  35.22 
 
 		 304 aa  126  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  30.95 
 
 		 303 aa  125  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.8 
 
 		 320 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  34.94 
 
 		 291 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.94 
 
 		 312 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.94 
 
 		 320 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  35.77 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.8 
 
 		 320 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  34.8 
 
 		 320 aa  125  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  34.28 
 
 		 304 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  35.37 
 
 		 304 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 303 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.27 
 
 		 294 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 310 aa  122  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  34.41 
 
 		 333 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  34.62 
 
 		 303 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  31.62 
 
 		 343 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  34.58 
 
 		 322 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  34.22 
 
 		 309 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  28.52 
 
 		 398 aa  119  9.999999999999999e-26  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  32.95 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.97 
 
 		 296 aa  119  1.9999999999999998e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  33.21 
 
 		 298 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  30.2 
 
 		 312 aa  117  6e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  34.09 
 
 		 324 aa  116  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  32.43 
 
 		 339 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  32.27 
 
 		 309 aa  114  3e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.94 
 
 		 308 aa  114  3e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  34.12 
 
 		 330 aa  114  5e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  25 
 
 		 350 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.76 
 
 		 293 aa  107  5e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  36.4 
 
 		 306 aa  105  3e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  29.57 
 
 		 307 aa  99  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.71 
 
 		 308 aa  97.4  5e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.36 
 
 		 297 aa  93.2  1e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1681  periplasmic solute binding protein  22.88 
 
 		 277 aa  82.8  0.00000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  26.41 
 
 		 317 aa  82  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  29.24 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.25 
 
 		 309 aa  79.7  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.34 
 
 		 320 aa  74.7  0.000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 		 307 aa  73.6  0.000000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31330  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.23 
 
 		 305 aa  71.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1156  periplasmic solute binding protein  24.74 
 
 		 303 aa  69.7  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0625  periplasmic solute binding protein  28.33 
 
 		 321 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0313744  normal  0.289666 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.34 
 
 		 318 aa  68.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2190  periplasmic solute binding protein  24.67 
 
 		 287 aa  67.8  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000321353  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  25.36 
 
 		 333 aa  67.4  0.0000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1102  periplasmic solute binding protein  23.58 
 
 		 282 aa  67.4  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  23.96 
 
 		 302 aa  67  0.0000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  33.79 
 
 		 346 aa  67  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0624  periplasmic solute binding protein  26.25 
 
 		 310 aa  67  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.17894  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 291 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3070  periplasmic solute binding protein  25.21 
 
 		 315 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.000000101463  hitchhiker  0.00347584 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3426  periplasmic solute binding protein  30.8 
 
 		 313 aa  65.1  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.525736  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0534  periplasmic solute binding protein  27.84 
 
 		 293 aa  65.1  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4030  periplasmic solute binding protein  25.33 
 
 		 305 aa  64.7  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0298524  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  22.59 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  26.07 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2115  periplasmic solute binding protein  25.85 
 
 		 300 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181464  normal  0.0892527 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 		 303 aa  62.8  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  22.18 
 
 		 298 aa  63.2  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3282  periplasmic solute binding protein  22.61 
 
 		 311 aa  62  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 353 aa  62.8  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  19.08 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2895  twin-arginine translocation pathway signal  35.66 
 
 		 310 aa  62  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33560  putative adhesion protein  25.99 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000392177  normal  0.054682 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1951  periplasmic solute binding protein  24.57 
 
 		 310 aa  60.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0524661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  24.03 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1891  cation ABC transporter, periplasmc-binding protein  22.92 
 
 		 288 aa  60.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1062  ABC transporter substrate binding protein  23.94 
 
 		 298 aa  60.8  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.861783  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  30.07 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0037  ABC transporter substrate-binding protein  23.93 
 
 		 321 aa  60.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  20.16 
 
 		 308 aa  60.8  0.00000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2090  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.261111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2852  putative adhesion protein  25.99 
 
 		 314 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  24.77 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  23.85 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3927  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 309 aa  60.1  0.00000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.51869  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3801  periplasmic solute binding protein  25.42 
 
 		 300 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.142921  normal  0.42718 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2781  periplasmic solute binding protein  28.05 
 
 		 318 aa  59.7  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  26.53 
 
 		 314 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  27.63 
 
 		 310 aa  59.3  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  27.01 
 
 		 313 aa  59.7  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06571  ABC transporter substrate-binding protein  23.5 
 
 		 321 aa  59.3  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140221  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>