More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5320 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  100 
 
 
343 aa  690    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  70.06 
 
 
339 aa  445  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  62.5 
 
 
298 aa  357  1.9999999999999998e-97  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  61.88 
 
 
298 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  61.88 
 
 
298 aa  353  2e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  32.84 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  37.95 
 
 
330 aa  173  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  36.49 
 
 
313 aa  168  1e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  36.95 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  34.6 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  36.7 
 
 
393 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  37.04 
 
 
320 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  36.7 
 
 
291 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.7 
 
 
312 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.7 
 
 
320 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.7 
 
 
320 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  36.7 
 
 
320 aa  161  2e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  31.21 
 
 
307 aa  159  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  34.35 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  35.93 
 
 
303 aa  155  8e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  35.64 
 
 
304 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  31.37 
 
 
317 aa  154  2e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  35.29 
 
 
304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  31.66 
 
 
312 aa  152  5.9999999999999996e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  34.01 
 
 
322 aa  152  8e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  34.69 
 
 
309 aa  151  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  34.55 
 
 
312 aa  151  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  34.49 
 
 
304 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  35.46 
 
 
333 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  31.75 
 
 
310 aa  146  5e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  35.67 
 
 
328 aa  143  5e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  33.68 
 
 
294 aa  142  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  32.8 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  33.93 
 
 
297 aa  140  1.9999999999999998e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  30.9 
 
 
316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  32.99 
 
 
329 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  37.07 
 
 
301 aa  139  7e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.37 
 
 
308 aa  135  9.999999999999999e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  31.55 
 
 
309 aa  134  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  30.56 
 
 
296 aa  133  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.67 
 
 
293 aa  124  2e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  30.93 
 
 
511 aa  123  5e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.53 
 
 
296 aa  116  6e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  24.92 
 
 
350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  30.66 
 
 
306 aa  115  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  25.08 
 
 
303 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  24.38 
 
 
297 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  29.21 
 
 
353 aa  102  9e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  23.21 
 
 
308 aa  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.82 
 
 
320 aa  82  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  28 
 
 
345 aa  80.1  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  33.15 
 
 
346 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  24.3 
 
 
314 aa  79.7  0.00000000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  24.26 
 
 
309 aa  78.6  0.0000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  21.31 
 
 
318 aa  79  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  20.96 
 
 
307 aa  77.8  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  25.57 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2875  periplasmic solute binding protein  25.93 
 
 
309 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.279263  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  28.99 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  21.85 
 
 
293 aa  77  0.0000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.02 
 
 
317 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 
316 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0220  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 
333 aa  75.9  0.0000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.732372  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0822  periplasmic solute binding protein  26.11 
 
 
356 aa  75.9  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000237297  normal  0.0439411 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3101  periplasmic solute binding protein  29.52 
 
 
309 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.624143  normal  0.191751 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1123  periplasmic solute binding protein  24.53 
 
 
292 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000244311  unclonable  0.0000000116493 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2656  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 
301 aa  73.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.149358 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1041  periplasmic solute binding protein  26.19 
 
 
303 aa  73.9  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.203742 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0516  periplasmic solute binding protein  24.72 
 
 
299 aa  73.2  0.000000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.26 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  28.73 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3681  periplasmic solute binding protein  23.55 
 
 
292 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2304  putative ABC-transporter metal-binding lipoprotein  26.23 
 
 
311 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3532  periplasmic solute binding protein  24.14 
 
 
292 aa  70.5  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  24.16 
 
 
304 aa  70.1  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  25.5 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2430  ribulose-phosphate 3-epimerase  20.65 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000562899  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2478  ribulose-phosphate 3-epimerase  20.65 
 
 
515 aa  69.7  0.00000000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00360703  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  24.1 
 
 
321 aa  69.3  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03390  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.58 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.563003  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 
307 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0703  periplasmic solute binding protein  24.9 
 
 
292 aa  68.2  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.326839  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0653  periplasmic solute binding protein  24.52 
 
 
292 aa  67.8  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3560  periplasmic solute binding protein  23.1 
 
 
307 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.24573 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0350  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  22.11 
 
 
315 aa  67.8  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.74 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  20.74 
 
 
316 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2898  periplasmic solute binding protein  27.49 
 
 
301 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.910422  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  24.17 
 
 
303 aa  67.8  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  26.67 
 
 
302 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  27.6 
 
 
311 aa  67.4  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  20.74 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  22.4 
 
 
316 aa  66.6  0.0000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  20 
 
 
316 aa  67  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  20.74 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  20.43 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5661  periplasmic solute binding protein  24.28 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.203291 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  20.43 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>