More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2641 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_2641  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 321 aa  645    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2376  periplasmic solute binding protein  61.47 
 
 		 328 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000812872 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4923  periplasmic solute binding protein  42.61 
 
 		 316 aa  251  1e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0239  periplasmic solute binding protein  45.8 
 
 		 310 aa  228  1e-58  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.527409  hitchhiker  0.00481833 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0352  periplasmic solute binding protein  42.22 
 
 		 296 aa  207  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35300  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  41.11 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.23608  normal  0.449954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0986  periplasmic solute binding protein  36.59 
 
 		 312 aa  177  3e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.566713  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2613  periplasmic solute binding protein  33.54 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.340349  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5320  periplasmic solute binding protein  34.6 
 
 		 343 aa  159  9e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.723333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0754  periplasmic solute binding protein  32.47 
 
 		 310 aa  157  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.130073 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1454  periplasmic solute binding protein  34.8 
 
 		 339 aa  156  4e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0602  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.67 
 
 		 294 aa  156  4e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0611  periplasmic solute binding protein  36.21 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3249  periplasmic solute binding protein  33.22 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.284399  normal  0.365665 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0717  ABC Mn2+/Zn2+ transporter, periplasmic ligand binding protein  33.22 
 
 		 330 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0454927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0866  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.87 
 
 		 320 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1722  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.91 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000557387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1029  ABC transporter substrate binding protein  32.76 
 
 		 393 aa  142  7e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.421036  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0870  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.18 
 
 		 320 aa  142  9e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.812377  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0216  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000799126  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0074  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.18 
 
 		 312 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2460  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.18 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0626  putative cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein  32.18 
 
 		 320 aa  140  3e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.695512  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12096  hypothetical protein  32.88 
 
 		 511 aa  140  3e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000121377  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0328  cation ABC transporter, periplasmic cation-binding protein, putative  32.18 
 
 		 291 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344237  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1990  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.738154  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2600  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 303 aa  139  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4719  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4805  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 298 aa  139  7e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.457429  normal  0.308806 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2624  periplasmic solute binding protein  31.85 
 
 		 303 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1958  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 297 aa  139  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5104  periplasmic solute binding protein  36.54 
 
 		 298 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.861086  normal  0.244188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0697  periplasmic solute binding protein  30.99 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.669096 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2516  periplasmic solute binding protein  32.15 
 
 		 304 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.322122 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2369  periplasmic solute binding protein  34.41 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00739211  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1279  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.34 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000395362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0803  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  30.84 
 
 		 296 aa  134  3e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.000167329  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0292  periplasmic solute binding protein  33 
 
 		 329 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1188  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.84 
 
 		 308 aa  132  6.999999999999999e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3195  periplasmic solute binding protein  33.75 
 
 		 309 aa  132  7.999999999999999e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0732077 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2648  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 304 aa  132  9e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5931  ABC heavy metal transporter, periplasmic ligand binding protein  31.75 
 
 		 304 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0747  Mn2+/Zn2+ ABC transporter periplasmic protein  30.56 
 
 		 398 aa  129  9.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.209831  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0487  periplasmic solute binding protein  31.79 
 
 		 309 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0440527  hitchhiker  0.00169017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0690  ABC transporter solute-binding protein  31.29 
 
 		 333 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1169  periplasmic solute binding protein  27.37 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.693162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2086  periplasmic solute binding protein  27.69 
 
 		 330 aa  113  4.0000000000000004e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2479  periplasmic solute binding protein  30.48 
 
 		 324 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.958913  normal  0.0425697 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2019  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.84 
 
 		 293 aa  112  7.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.387589  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0883  metal ion ABC transporter periplasmic protein  26.22 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.194298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  27.74 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1972  periplasmic solute binding protein  28.7 
 
 		 303 aa  91.3  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0599  periplasmic solute binding family protein  22.33 
 
 		 350 aa  90.1  5e-17  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  24.23 
 
 		 316 aa  89.4  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  24.23 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  24.23 
 
 		 316 aa  89  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.54 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  24.54 
 
 		 316 aa  88.2  2e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1470  periplasmic solute binding protein  26.23 
 
 		 298 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0700113  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2998  periplasmic solute binding protein  24.7 
 
 		 328 aa  86.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000688581  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3553  periplasmic solute binding protein  29.28 
 
 		 306 aa  86.7  6e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00157548  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.93 
 
 		 316 aa  86.3  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3704  periplasmic solute binding protein  28.81 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.474771  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2575  Mn transporter MntC  30.39 
 
 		 313 aa  84  0.000000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  23.38 
 
 		 316 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  23.38 
 
 		 316 aa  82  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  32.83 
 
 		 307 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  23.38 
 
 		 316 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1532  periplasmic solute binding protein  34.05 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  29.02 
 
 		 325 aa  80.5  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  27.18 
 
 		 292 aa  80.9  0.00000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3634  periplasmic solute binding protein  23.81 
 
 		 311 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  22.15 
 
 		 316 aa  79.3  0.00000000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  21.65 
 
 		 333 aa  78.6  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  22.8 
 
 		 314 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  27.03 
 
 		 333 aa  77.4  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  26.65 
 
 		 345 aa  77  0.0000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0222  periplasmic solute binding protein  24.69 
 
 		 306 aa  77  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18350  periplasmic solute binding protein  23.53 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000303257  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0928  periplasmic solute binding protein  29.65 
 
 		 305 aa  74.7  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.664518  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1724  periplasmic solute binding protein  24.67 
 
 		 309 aa  74.3  0.000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.147475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  31.44 
 
 		 304 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  31.9 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0953  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  22.32 
 
 		 313 aa  74.3  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  24.23 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17080  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  29.34 
 
 		 347 aa  73.6  0.000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.222095  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1141  periplasmic solute binding protein  25.77 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2472  periplasmic solute binding protein  26.49 
 
 		 311 aa  73.2  0.000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  24.65 
 
 		 317 aa  71.2  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1316  Mn transporter MntC  27.4 
 
 		 345 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.832277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5737  periplasmic solute binding protein  29.7 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  25.98 
 
 		 326 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0036  adhesion lipoprotein  20.91 
 
 		 311 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0129637  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 311 aa  70.1  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5324  periplasmic solute binding protein  26.95 
 
 		 302 aa  70.1  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  23.24 
 
 		 293 aa  70.5  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4709  periplasmic solute binding protein  29.68 
 
 		 321 aa  70.1  0.00000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.150845 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1259  periplasmic solute binding protein  26.59 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0030  periplasmic solute binding protein  25.15 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3491  periplasmic solute binding protein  24.11 
 
 		 323 aa  69.7  0.00000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.171763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>