More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0788 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  100 
 
 		 120 aa  239  7e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  95 
 
 		 120 aa  228  3e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 119 aa  153  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 130 aa  151  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  63.33 
 
 		 119 aa  150  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  61.67 
 
 		 135 aa  147  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  62.83 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  55 
 
 		 119 aa  137  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  55 
 
 		 128 aa  133  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  44.74 
 
 		 125 aa  104  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  50 
 
 		 123 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  55 
 
 		 117 aa  102  2e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  45.37 
 
 		 119 aa  95.5  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  45 
 
 		 132 aa  91.7  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4967  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.32 
 
 		 115 aa  92  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.968943  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  44 
 
 		 127 aa  91.3  4e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0222  transcriptional regulator, ArsR family  43.27 
 
 		 116 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  46.74 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0501  regulatory protein ArsR  42.61 
 
 		 127 aa  88.6  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0567681  normal  0.0228507 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  43.69 
 
 		 131 aa  87.8  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1722  transcriptional regulator, ArsR family  43.75 
 
 		 116 aa  87  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.416614 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 105 aa  87.4  7e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3375  transcriptional regulator, ArsR family  44.12 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0206443  hitchhiker  0.00373778 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  45.19 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  42.27 
 
 		 183 aa  84.7  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2695  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 123 aa  84.7  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.260827  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5418  transcriptional regulator, ArsR family  38.74 
 
 		 124 aa  84.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.697465 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  43.88 
 
 		 126 aa  84.3  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 125 aa  84.3  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  41.9 
 
 		 112 aa  84  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0590  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 117 aa  83.6  8e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.506747 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 120 aa  83.6  8e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  41.75 
 
 		 122 aa  82.8  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4496  putative transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 113 aa  82.4  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.698258  normal  0.92567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  41.41 
 
 		 124 aa  82.4  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 116 aa  81.6  0.000000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  42 
 
 		 126 aa  81.3  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 136 aa  80.9  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0384  transcriptional regulator, ArsR family  44.09 
 
 		 127 aa  80.9  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  41.82 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  43.01 
 
 		 127 aa  79.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20610  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 121 aa  79.3  0.00000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1856  transcriptional regulator, ArsR family  42.72 
 
 		 137 aa  79  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8614  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 123 aa  78.2  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00781131  normal  0.130567 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0112  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 119 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2579  transcriptional regulator, ArsR family  39.81 
 
 		 120 aa  77.4  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  38 
 
 		 118 aa  77  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  46.34 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 120 aa  75.5  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  47.44 
 
 		 120 aa  75.9  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 121 aa  74.3  0.0000000000006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0367  transcriptional regulator, ArsR family  41.57 
 
 		 337 aa  73.6  0.0000000000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  42.35 
 
 		 116 aa  73.2  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0103  transcriptional regulator, ArsR family  41 
 
 		 124 aa  72  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  40.19 
 
 		 120 aa  72.4  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 125 aa  70.9  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2310  ArsR family transcriptional regulator  39 
 
 		 121 aa  70.5  0.000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3175  ArsR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 126 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.164371  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14660  protein-tyrosine-phosphatase  37.08 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0131  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 125 aa  68.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000212185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2662  transcriptional regulator, ArsR family  42.5 
 
 		 337 aa  68.6  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.459906 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0211  ArsR family transcriptional regulator  36.63 
 
 		 125 aa  67.8  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  39.33 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3653  transcriptional regulator, ArsR family  37.5 
 
 		 347 aa  67.4  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0388  transcriptional regulator, ArsR family  41.54 
 
 		 349 aa  65.1  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1223  regulatory protein, ArsR  37.11 
 
 		 131 aa  63.9  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0337905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2774  ArsR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 108 aa  62  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.111393  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2879  ArsR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 110 aa  61.6  0.000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0822  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 118 aa  61.2  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2071  regulatory protein, ArsR  34.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.3776  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1324  regulatory protein, ArsR  34.33 
 
 		 107 aa  60.8  0.000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  37.21 
 
 		 109 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3738  ArsR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25900  transcriptional regulator, ArsR family  43.04 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1851  regulatory protein ArsR  40 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120336  hitchhiker  0.00320391 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0492  transcriptional regulator, ArsR family  37 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.483938  hitchhiker  0.00309358 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1123  transcriptional regulator, ArsR family  34.65 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000000269044  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2670  transcriptional regulator, ArsR family  46.15 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00021786  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4387  ArsR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1705  ArsR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0202215  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4984  transcriptional regulator, ArsR family  38.83 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.452478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2767  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0187  transcriptional regulator, ArsR family  36.45 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1689  transcriptional regulator, ArsR family  38.46 
 
 		 141 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1930  arsenic resistance transcriptional regulator  36.59 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.406567  unclonable  0.000000264829 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1126  ArsR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 131 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0458599  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  40 
 
 		 94 aa  57.8  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0417  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2832  regulatory protein, ArsR  43.75 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.119331 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0532  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1492  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 127 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.220175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0574  ArsR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.191131 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0928  transcriptional regulator, ArsR family  37.35 
 
 		 125 aa  57  0.00000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3499  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 114 aa  57  0.00000009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3960  ArsR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3834  regulatory protein ArsR  37.04 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0532  ArsR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 114 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>