156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0438 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0438  TAP domain protein  100 
 
 		 542 aa  1098    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574551  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1042  TAP domain-containing protein  31.14 
 
 		 535 aa  161  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0225624 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0481  TAP domain protein  28.14 
 
 		 539 aa  162  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.223264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4414  hypothetical protein  30.07 
 
 		 505 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.694835  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4973  TAP domain protein  41.5 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.39691  normal  0.167078 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3412  TAP domain protein  35.02 
 
 		 766 aa  154  5.9999999999999996e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3345  TAP domain-containing protein  27.57 
 
 		 532 aa  153  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7303  hypothetical protein  29.17 
 
 		 532 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1966  hypothetical protein  35.26 
 
 		 530 aa  143  7e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.52219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4728  TAP domain-containing protein  26.82 
 
 		 506 aa  141  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0472  alpha/beta hydrolase fold protein  34.18 
 
 		 525 aa  138  3.0000000000000003e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.562012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4117  TAP domain-containing protein  30.85 
 
 		 556 aa  137  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4537  TAP domain protein  29.52 
 
 		 506 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7044  hypothetical protein  27.44 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.393484  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3369  TAP domain protein  27.68 
 
 		 547 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0557447  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1183  TAP domain-containing protein  27.34 
 
 		 495 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2656  TAP domain protein  35.98 
 
 		 535 aa  129  9.000000000000001e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0201051  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3316  TAP domain protein  29.91 
 
 		 484 aa  129  2.0000000000000002e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0266981  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3160  TAP domain protein  37.14 
 
 		 527 aa  127  5e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2780  tripeptidyl-peptidase B  33.61 
 
 		 500 aa  126  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.834234  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24850  alpha/beta hydrolase family protein  26.85 
 
 		 515 aa  125  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0881  TAP domain protein  25.84 
 
 		 545 aa  124  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.478786  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0663  TAP domain protein  33.19 
 
 		 525 aa  121  3.9999999999999996e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419459  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1136  TAP domain protein  30.99 
 
 		 514 aa  120  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25020  alpha/beta hydrolase family protein  31.35 
 
 		 542 aa  120  7.999999999999999e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4710  TAP domain protein  33.45 
 
 		 504 aa  119  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2331  putative protease  34.82 
 
 		 300 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3329  tripeptidyl-peptidase B  28.71 
 
 		 533 aa  117  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.224727  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3391  tripeptidyl-peptidase B  29.25 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.349155 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3340  tripeptidyl-peptidase B  29.25 
 
 		 508 aa  117  5e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.478437  normal  0.109915 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3464  TAP domain-containing protein  27.33 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.660985  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4956  TAP domain protein  31.56 
 
 		 507 aa  117  6e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.562249  normal  0.30314 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6275  TAP domain-containing protein  29.28 
 
 		 476 aa  117  6.9999999999999995e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0577  TAP domain protein  27.89 
 
 		 508 aa  116  7.999999999999999e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.677702  hitchhiker  0.00225183 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2212  TAP domain-containing protein  26.62 
 
 		 520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.544179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1723  TAP domain protein  27.99 
 
 		 536 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00370292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0388  TAP domain-containing protein  33.2 
 
 		 521 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07410  alpha/beta hydrolase family protein  30.77 
 
 		 525 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2906  alpha/beta hydrolase fold  28.24 
 
 		 505 aa  114  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.834545 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1065  TAP domain protein  30.65 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.87268  normal  0.682621 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0750  putative secreted peptidase  26.85 
 
 		 521 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12252  exported protease  36.15 
 
 		 520 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.212366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0841  TAP domain protein  27.94 
 
 		 521 aa  112  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.127306 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0220  TAP domain protein  34.74 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000712779 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2839  TAP domain protein  29.9 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350131  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6091  TAP domain-containing protein  32.48 
 
 		 504 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2523  TAP domain protein  30.96 
 
 		 564 aa  111  3e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4219  alpha/beta hydrolase fold protein  29.57 
 
 		 486 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3616  TAP domain protein  26.05 
 
 		 546 aa  109  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.812667  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0185  TAP domain protein  31.84 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.696189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12253  exported protease  32.8 
 
 		 520 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.499354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2970  TAP domain protein  33.01 
 
 		 542 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.32712  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02580  alpha/beta hydrolase family protein  28.03 
 
 		 623 aa  107  6e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.978734  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2192  TAP domain protein  25.6 
 
 		 518 aa  107  7e-22  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3257  TAP domain-containing protein  29.01 
 
 		 499 aa  107  8e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.590122  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7397  TAP domain-containing protein  32.34 
 
 		 613 aa  106  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.312183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3267  TAP domain protein  31.25 
 
 		 538 aa  106  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000317549  decreased coverage  0.0000157542 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3600  TAP domain-containing protein  32.34 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.601455 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3330  tripeptidyl-peptidase B  31.3 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0380101  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0715  TAP domain-containing protein  24.95 
 
 		 524 aa  104  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3392  tripeptidyl-peptidase B  31.3 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.365277 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3599  TAP domain-containing protein  35.41 
 
 		 505 aa  104  4e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3341  tripeptidyl-peptidase B  31.3 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.175683  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0644  hypothetical protein  30.56 
 
 		 597 aa  103  8e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0491  TAP domain protein  34.08 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557817 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0356  TAP domain protein  31.98 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2687  TAP domain protein  30.95 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.589968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0066  tripeptidyl-peptidase B  35.8 
 
 		 540 aa  100  5e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.974168 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5024  TAP domain protein  26.77 
 
 		 571 aa  100  6e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412323  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4357  TAP domain-containing protein  31.98 
 
 		 504 aa  100  7e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00619924  normal  0.129935 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1133  putative hydrolase  38.64 
 
 		 200 aa  100  7e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146654  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6093  TAP domain-containing protein  27.89 
 
 		 505 aa  99.4  1e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2729  TAP domain protein  25.7 
 
 		 515 aa  99.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.196617  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2442  TAP domain protein  34.21 
 
 		 597 aa  99.4  2e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000431609  normal  0.057711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1545  TAP domain-containing protein  30.65 
 
 		 542 aa  98.6  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0907  TAP domain protein  30.89 
 
 		 521 aa  97.8  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2904  TAP domain-containing protein  31.2 
 
 		 495 aa  97.1  7e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.411145  normal  0.553721 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2509  hypothetical protein  30.74 
 
 		 750 aa  97.1  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.689132 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4882  TAP domain-containing protein  33.33 
 
 		 493 aa  96.7  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1488  TAP domain-containing protein  31.3 
 
 		 522 aa  96.3  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00026814 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0464  TAP domain-containing protein  23.99 
 
 		 499 aa  95.9  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000978752 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6097  TAP domain protein  26.93 
 
 		 559 aa  95.1  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2254  TAP domain-containing protein  26.6 
 
 		 486 aa  94.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.267716 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2767  TAP domain-containing protein  31.58 
 
 		 546 aa  94  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1946  TAP domain protein  30.34 
 
 		 518 aa  94  7e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0350254  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8392  TAP domain protein  32.76 
 
 		 537 aa  93.6  9e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.258609  normal  0.179275 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32570  alpha/beta hydrolase family protein  27.59 
 
 		 541 aa  92.8  1e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2785  TAP domain protein  29.07 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000127217  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2980  TAP domain protein  32.88 
 
 		 557 aa  91.7  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.085257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5935  TAP domain protein  26.4 
 
 		 518 aa  91.3  5e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.235476  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6092  TAP domain-containing protein  29.37 
 
 		 478 aa  90.5  7e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9211  hypothetical protein  30.24 
 
 		 485 aa  86.3  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1310  TAP domain protein  29.2 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.330733  normal  0.30723 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0722  alpha/beta fold family hydrolase  32.58 
 
 		 480 aa  81.3  0.00000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3059  hypothetical protein  31.58 
 
 		 459 aa  81.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.253596 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_11121  conserved hypothetical protein  27.68 
 
 		 555 aa  79.7  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0230414 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4190  TAP domain-containing protein  27.96 
 
 		 519 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3351  alpha/beta hydrolase fold protein  35.23 
 
 		 489 aa  77.8  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.172382  normal  0.0371725 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3994  TAP domain protein  32.89 
 
 		 557 aa  76.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3780  TAP domain-containing protein  31.03 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>