209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2002 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2002  flagellar hook-basal body protein FliE  100 
 
 
98 aa  198  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1110  flagellar hook-basal body protein FliE  63.64 
 
 
100 aa  126  9.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00977073  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0409  flagellar hook-basal body complex protein FliE  45.45 
 
 
100 aa  83.6  9e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3305  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.18 
 
 
99 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1694  flagellar hook-basal body protein FliE  55.71 
 
 
98 aa  79.7  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.390523  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4214  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.1 
 
 
102 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3113  flagellar hook-basal body complex protein FliE  44.44 
 
 
101 aa  78.2  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0687  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  45.83 
 
 
99 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0848  flagellar hook-basal body protein  48 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44.57 
 
 
100 aa  75.5  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3923  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  48.57 
 
 
104 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0876315 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3839  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  47.14 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0464  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.78 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1193  flagellar hook-basal body complex protein FliE  42.11 
 
 
99 aa  73.2  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1766  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.511452  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1979  flagellar hook-basal body protein FliE  41.18 
 
 
121 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2409  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.17 
 
 
96 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1390  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.36 
 
 
96 aa  69.7  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.852858 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1725  flagellar hook-basal body complex protein  45.07 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1725  flagellar hook-basal body complex protein  45.07 
 
 
104 aa  68.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1599  flagellar hook-basal body protein FliE  39.02 
 
 
114 aa  68.6  0.00000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.834778  normal  0.409653 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1463  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1417  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
94 aa  68.6  0.00000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1686  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
99 aa  68.2  0.00000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.317979  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2360  flagellar hook-basal body complex protein FliE  43.06 
 
 
106 aa  67.8  0.00000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0760  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.54 
 
 
105 aa  68.2  0.00000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4151  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.29 
 
 
114 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2309  flagellar hook-basal body protein FliE  40.74 
 
 
103 aa  67  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0389  flagellar hook-basal body protein FliE  35.71 
 
 
110 aa  66.2  0.0000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555741  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0776  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 
107 aa  66.2  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0965242 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0770  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  44.12 
 
 
102 aa  66.6  0.0000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00516062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1535  flagellar hook-basal body protein FliE  39.77 
 
 
109 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1577  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  44 
 
 
104 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4732  flagellar hook-basal body protein FliE  42.25 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.132545 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3655  flagellar hook-basal body protein FliE  42.25 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.56057  normal  0.181807 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002814  flagellar hook-basal body complex protein FliE  36.78 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2826  flagellar hook-basal body protein FliE  38.75 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0213407 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03163  flagellar hook-basal body protein FliE  37.35 
 
 
103 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0499  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.5 
 
 
103 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1716  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  32.1 
 
 
96 aa  64.3  0.0000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000289402  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1126  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.63 
 
 
95 aa  64.7  0.0000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50160  flagellar hook-basal body protein FliE  40.96 
 
 
109 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00315535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16900  flagellar hook-basal body protein FliE  40.54 
 
 
100 aa  63.9  0.0000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4271  flagellar hook-basal body protein FliE  40.96 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0391399  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1718  flagellar hook-basal body protein FliE  36.59 
 
 
109 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0360024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2189  hypothetical protein  37.5 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1286  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  37.11 
 
 
121 aa  63.5  0.0000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.828428 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2052  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  42.65 
 
 
102 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06184  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.5 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000899406  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3695  flagellar hook-basal body protein FliE  40.26 
 
 
110 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268246  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00982  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  37.5 
 
 
123 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1649  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.14 
 
 
145 aa  62  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.39718  normal  0.182209 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4743  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.743066 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3666  flagellar hook-basal body protein FliE  35.63 
 
 
108 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0743096  normal  0.625579 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0432  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  35.56 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.449981  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2174  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
104 aa  62  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.36 
 
 
107 aa  61.2  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1892  flagellar hook-basal body protein FliE  38.55 
 
 
104 aa  61.2  0.000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4370  flagellar hook-basal body protein FliE  40.26 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.00634776  normal  0.821893 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3931  flagellar hook-basal body protein FliE  40.26 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0348738  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1497  flagellar hook-basal body protein FliE  40.26 
 
 
110 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.113287  normal  0.994821 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2574  flagellar hook-basal body protein FliE  37.35 
 
 
104 aa  60.5  0.000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0254712  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2045  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  34.83 
 
 
94 aa  60.5  0.000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1443  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  32.95 
 
 
110 aa  60.5  0.000000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2298  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40.85 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2528  flagellar hook-basal body protein FliE  44.93 
 
 
104 aa  60.5  0.000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0425  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.75 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1970  flagellar hook-basal body protein FliE  43.66 
 
 
105 aa  60.1  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1711  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0769379  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1501  flagellar hook-basal body complex protein FliE  37.21 
 
 
120 aa  59.7  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.814922  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2037  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2170  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.175717  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2712  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.320643 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1247  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.709609  normal  0.816735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1705  flagellar hook-basal body protein FliE  43.48 
 
 
104 aa  60.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0863696 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2015  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2289  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
105 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.983576  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5259  flagellar hook-basal body complex protein FliE  39.51 
 
 
106 aa  59.3  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172965 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24240  flagellar hook-basal body complex protein  37.21 
 
 
108 aa  58.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.960049  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2390  flagellar hook-basal body protein FliE  39.76 
 
 
103 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1365  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  39.44 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.917716 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3458  flagellar hook-basal body protein FliE  37.08 
 
 
111 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5096  flagellar hook-basal body complex protein FliE  41.79 
 
 
107 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1344  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
115 aa  58.2  0.00000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.331686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2130  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
104 aa  57.8  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000214778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2028  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  31.82 
 
 
110 aa  58.2  0.00000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1957  flagellar hook-basal body complex protein FliE  35.96 
 
 
118 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.67399  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1275  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.654615 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2896  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40.85 
 
 
107 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.360485  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1617  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.03 
 
 
110 aa  57.8  0.00000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2937  flagellar hook-basal body complex protein (FliE)  40 
 
 
117 aa  57.8  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.762036 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1152  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00870924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2125  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
104 aa  57.8  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  normal  0.179374 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0791  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  41.79 
 
 
102 aa  57.8  0.00000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0284427  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0691  flagellar hook-basal body protein FliE  34.74 
 
 
98 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3048  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  36.99 
 
 
113 aa  57.4  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2183  flagellar hook-basal body protein FliE  40.85 
 
 
104 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0948525 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0708  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  40 
 
 
108 aa  57  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.37465  normal  0.418764 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31230  flagellar hook-basal body protein  38.24 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.571171  normal  0.135684 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1338  flagellar hook-basal body complex subunit FliE  38.57 
 
 
100 aa  56.2  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0658432  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>