More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0122 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  100 
 
 		 178 aa  350  5e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  94.38 
 
 		 178 aa  334  2.9999999999999997e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000315024  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201317  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0121  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112924  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0119  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000265093  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0146  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000964591  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0137  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.83996e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0156  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000162457  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0125  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  272  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00622633  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0120  50S ribosomal protein L6  75.42 
 
 		 179 aa  270  6e-72  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000168089  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5180  50S ribosomal protein L6  74.3 
 
 		 179 aa  270  6e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000519907  unclonable  1.81149e-25 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0119  50S ribosomal protein L6  75.98 
 
 		 179 aa  268  2e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000205529  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  68.54 
 
 		 179 aa  250  6e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 180 aa  248  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000179167  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2445  50S ribosomal protein L6  71.18 
 
 		 183 aa  246  9e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  68.24 
 
 		 182 aa  246  9e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000764662  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1730  50S ribosomal protein L6  67.25 
 
 		 182 aa  246  1e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000672522  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2262  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00376277  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2303  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 178 aa  234  4e-61  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0125142  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1816  50S ribosomal protein L6  66.85 
 
 		 178 aa  233  9e-61  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.997854  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  63.28 
 
 		 179 aa  233  1.0000000000000001e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  64.8 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  64.8 
 
 		 179 aa  231  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0609  50S ribosomal protein L6P  62.36 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338994  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0210  50S ribosomal protein L6  65.17 
 
 		 178 aa  229  1e-59  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  65.88 
 
 		 184 aa  229  2e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  64.61 
 
 		 181 aa  225  2e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  0.00000113192 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0882  50S ribosomal protein L6  63.69 
 
 		 180 aa  225  3e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.527147  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  62.36 
 
 		 178 aa  225  3e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2918  50S ribosomal protein L6P  64.33 
 
 		 183 aa  224  6e-58  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000181969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  62.5 
 
 		 182 aa  221  3e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2386  50S ribosomal protein L6  64.04 
 
 		 178 aa  219  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00107371  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 179 aa  219  1.9999999999999999e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  59.55 
 
 		 180 aa  218  3e-56  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  0.0000169605 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1170  50S ribosomal protein L6  58.82 
 
 		 187 aa  217  6e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.011794  normal  0.0958603 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1892  50S ribosomal protein L6  61.8 
 
 		 178 aa  215  2e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0452279  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1169  ribosomal protein L6  59.32 
 
 		 179 aa  216  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.324291  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0773  ribosomal protein L6 signature 1  62.57 
 
 		 183 aa  212  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000853841  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  60.89 
 
 		 179 aa  212  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  60.45 
 
 		 177 aa  213  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4011  50S ribosomal protein L6  57.84 
 
 		 187 aa  211  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000166589  hitchhiker  0.0000686168 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0073  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 178 aa  211  5.999999999999999e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.177407  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  62.86 
 
 		 177 aa  211  5.999999999999999e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 178 aa  209  2e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  0.000000282439  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0996  50S ribosomal protein L6  59.22 
 
 		 180 aa  207  8e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.156125  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0240  ribosomal protein L6  56.5 
 
 		 181 aa  206  1e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.358397  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3009  50S ribosomal protein L6  57.84 
 
 		 187 aa  206  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.149447  hitchhiker  0.00994922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  56.5 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0305  50S ribosomal protein L6  61.24 
 
 		 176 aa  204  4e-52  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  1.9924900000000002e-28 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23171  50S ribosomal protein L6  58.43 
 
 		 179 aa  202  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0705  50S ribosomal protein L6  56.47 
 
 		 182 aa  202  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000000289089  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2309  ribosomal protein L6  57.95 
 
 		 178 aa  202  2e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000583709  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2309  ribosomal protein L6  56 
 
 		 177 aa  202  2e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  53.93 
 
 		 178 aa  202  3e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  58.1 
 
 		 180 aa  201  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2573  50S ribosomal protein L6  57.06 
 
 		 182 aa  201  4e-51  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1468  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108957  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0473  50S ribosomal protein L6  57.71 
 
 		 177 aa  200  9.999999999999999e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  54.75 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  57.3 
 
 		 179 aa  199  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  52.81 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  199  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  53.37 
 
 		 178 aa  198  3e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  198  3.9999999999999996e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5055  50S ribosomal protein L6  55.43 
 
 		 177 aa  197  5e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.468069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  55.87 
 
 		 179 aa  197  5e-50  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0310  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  197  7e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000340261  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 181 aa  197  7.999999999999999e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  55.06 
 
 		 178 aa  197  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  52.25 
 
 		 178 aa  197  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0616  ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  54.75 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  54.19 
 
 		 179 aa  196  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1270  ribosomal protein L6  55.93 
 
 		 177 aa  196  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  55.56 
 
 		 181 aa  195  3e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  56.18 
 
 		 179 aa  195  3e-49  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000776648  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0269  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  194  4.0000000000000005e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0431444  normal  0.459215 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19891  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  194  4.0000000000000005e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1115  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  194  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1839  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0352  50S ribosomal protein L6  57.14 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344085  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  52.81 
 
 		 177 aa  193  9e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000313624  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2998  50S ribosomal protein L6P  56.18 
 
 		 179 aa  193  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.220968  normal  0.0212963 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0734  50S ribosomal protein L6  54.29 
 
 		 177 aa  193  1e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000390696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2604  50S ribosomal protein L6  55.37 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000953175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3433  50S ribosomal protein L6  53.14 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.286607  normal  0.347857 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  55.62 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000375476  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  54.4 
 
 		 184 aa  192  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  54.19 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0843  50S ribosomal protein L6  54.86 
 
 		 177 aa  192  2e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.602028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 		 179 aa  192  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  0.000000526273  normal  0.385866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>