More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2362 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  67.86 
 
 
560 aa  799    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  67.26 
 
 
560 aa  794    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  67.5 
 
 
560 aa  797    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  67.32 
 
 
560 aa  794    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  100 
 
 
555 aa  1150    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  67.5 
 
 
560 aa  798    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  67.86 
 
 
560 aa  800    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  85.23 
 
 
554 aa  991    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  51.45 
 
 
572 aa  543  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0259  helicase domain-containing protein  39.93 
 
 
578 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  45.94 
 
 
467 aa  369  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1303  helicase domain-containing protein  40.96 
 
 
669 aa  369  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  38.57 
 
 
584 aa  351  2e-95  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  36.11 
 
 
584 aa  346  7e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1341  helicase domain-containing protein  31.17 
 
 
921 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134377 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1945  helicase domain protein  30.67 
 
 
949 aa  225  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  31.63 
 
 
963 aa  224  3e-57  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  31.24 
 
 
933 aa  223  6e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  30.84 
 
 
966 aa  222  9.999999999999999e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1426  helicase domain protein  31.33 
 
 
915 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1328  helicase domain protein  31.33 
 
 
916 aa  220  6e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  30.08 
 
 
915 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  30.57 
 
 
951 aa  218  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  30.61 
 
 
969 aa  214  2.9999999999999995e-54  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  29.6 
 
 
941 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  32.11 
 
 
541 aa  214  3.9999999999999995e-54  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  29.6 
 
 
941 aa  214  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0513  helicase domain-containing protein  30.27 
 
 
942 aa  213  4.9999999999999996e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1953  helicase domain-containing protein  32.14 
 
 
967 aa  209  2e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3804  SNF2-related protein  30.1 
 
 
961 aa  206  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.502587  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1983  SNF2-related protein  31.14 
 
 
966 aa  205  1e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.094528  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3286  helicase domain protein  27.94 
 
 
988 aa  202  9e-51  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52390  helicase, Snf2 family  29.25 
 
 
929 aa  202  9.999999999999999e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2075  hypothetical protein  28.25 
 
 
835 aa  200  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.989433  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2010  hypothetical protein  28.25 
 
 
1144 aa  200  6e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0017  helicase/SNF2 family domain protein  30.64 
 
 
801 aa  199  9e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1660  helicase/SNF2 family domain protein  30.38 
 
 
805 aa  199  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2959  helicase domain-containing protein  30.45 
 
 
937 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.789708  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1538  helicase domain-containing protein  28.7 
 
 
963 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4276  helicase-like  28.23 
 
 
1138 aa  196  1e-48  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3187  helicase domain protein  27.81 
 
 
969 aa  196  1e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3658  SNF2 family helicase  29.88 
 
 
960 aa  194  3e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.041395  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  27.99 
 
 
962 aa  194  4e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3989  helicase domain-containing protein  28.76 
 
 
1145 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.164502 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0779  DEAD/DEAH box helicase-like  29.53 
 
 
665 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  28.15 
 
 
1002 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.2 
 
 
971 aa  180  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0233  Type III restriction enzyme, res subunit  29.44 
 
 
900 aa  178  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179652  decreased coverage  0.00064314 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5353  helicase domain protein  30.58 
 
 
894 aa  177  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.157102 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  27.67 
 
 
1170 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  27.06 
 
 
1043 aa  171  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2892  ATP-dependent helicase HepA  28.96 
 
 
942 aa  168  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2144  helicase domain protein  26.32 
 
 
1160 aa  168  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.270016  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1096  helicase domain-containing protein  25.84 
 
 
964 aa  167  4e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1434  SNF2-related protein  27 
 
 
621 aa  165  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0748383  normal  0.519779 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0569  ATP-dependent helicase HepA  27.31 
 
 
967 aa  163  6e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0294  non-specific serine/threonine protein kinase  29.84 
 
 
1152 aa  162  1e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.596055  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0568  ATP-dependent helicase HepA  28.45 
 
 
970 aa  162  2e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00434325  normal  0.886581 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0606  ATP-dependent helicase HepA  26.73 
 
 
968 aa  161  3e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00996895  normal  0.766513 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0608  ATP-dependent helicase HepA  27.14 
 
 
967 aa  160  6e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.171676  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2520  DEAD/DEAH box helicase-like  27.16 
 
 
1065 aa  159  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.138323  normal  0.614208 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.283033  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3540  SNF2-related protein  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.410418  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0063  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000144173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0051  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000808065  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0064  ATP-dependent helicase HepA  27.53 
 
 
919 aa  159  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.694047  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00060  hypothetical protein  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.326785  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0874  DEAD/DEAH box helicase-like  25.53 
 
 
1019 aa  158  2e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00587786  normal  0.0126455 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  159  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000176621  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3598  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.517032  unclonable  0.0000000467864 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0061  ATP-dependent helicase HepA  27.13 
 
 
968 aa  159  2e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00130615  normal  0.800173 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1805  helicase domain-containing protein  26.35 
 
 
1013 aa  157  4e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  25.64 
 
 
1072 aa  157  6e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1485  ATP-dependent helicase HepA  27.03 
 
 
947 aa  156  9e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.810829  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  27.29 
 
 
1078 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0730  ATP-dependent helicase HepA  27.71 
 
 
968 aa  155  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000570719  normal  0.719856 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  26.63 
 
 
1170 aa  155  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0106  ATP-dependent helicase HepA  26.57 
 
 
968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00405197  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0103  ATP-dependent helicase HepA  26.57 
 
 
944 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2175  DEAD/DEAH box helicase-like  26.4 
 
 
1063 aa  154  2.9999999999999998e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0102  ATP-dependent helicase HepA  26.57 
 
 
968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0648061  normal  0.111163 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0101  ATP-dependent helicase HepA  26.57 
 
 
968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0108  ATP-dependent helicase HepA  26.57 
 
 
968 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0505  non-specific serine/threonine protein kinase  26.08 
 
 
617 aa  155  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3286  SNF2-related protein  27.06 
 
 
988 aa  154  4e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  28.45 
 
 
947 aa  152  2e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1812  ATP-dependent helicase HepA  27.64 
 
 
948 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.502146  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21230  ATP-dependent helicase HepA  27.85 
 
 
950 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0352  ATP-dependent helicase HepA  28.99 
 
 
969 aa  152  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  26.44 
 
 
1037 aa  151  3e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0884  SNF2-related protein  26.59 
 
 
1068 aa  150  7e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00950493  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00501  SNF2 family DNA/RNA helicase  27.41 
 
 
1067 aa  150  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3455  ATP-dependent helicase HepA  26.59 
 
 
968 aa  150  7e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0575  ATP-dependent helicase HepA  26.59 
 
 
968 aa  150  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0469  ATP-dependent helicase HepA  27.77 
 
 
980 aa  149  9e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>