More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1888 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1888  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 246 aa  493  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.986838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1282  ABC transporter-related protein  82.93 
 
 		 246 aa  414  9.999999999999999e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000182009 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2973  ABC transporter related  76.42 
 
 		 246 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000014361  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3391  ABC transporter related  75.61 
 
 		 245 aa  356  1.9999999999999998e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0868  ABC transporter related protein  75.2 
 
 		 245 aa  354  6.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.463879  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2167  ABC transporter related  69.2 
 
 		 247 aa  331  5e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0973  ABC transporter related  69.62 
 
 		 247 aa  329  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.059424  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1939  hypothetical protein  65.82 
 
 		 241 aa  321  5e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2070  ABC transporter related  62.4 
 
 		 245 aa  308  5e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0552622  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17500  ABC transporter related  60.85 
 
 		 239 aa  301  7.000000000000001e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0533908  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3335  ABC transporter related  59 
 
 		 250 aa  297  1e-79  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0534  ATPase component ABC-type transport system  59.83 
 
 		 240 aa  296  2e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.32942  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0085  ABC transporter related  60.25 
 
 		 268 aa  293  2e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.329192  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4299  ABC transporter-related protein  58.94 
 
 		 255 aa  293  2e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2229  ABC transporter related  61.34 
 
 		 241 aa  292  4e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0727  ABC transporter related  61.76 
 
 		 241 aa  291  6e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1661  ABC transporter, ATPase subunit  62.5 
 
 		 242 aa  291  6e-78  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.138216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4150  ABC transporter related  60.34 
 
 		 244 aa  290  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3376  ABC transporter related  58.51 
 
 		 243 aa  290  1e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.681925  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4366  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  60.08 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.254909  normal  0.374938 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12800  LPS transport protein LptB  59.24 
 
 		 241 aa  290  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1421  hypothetical protein  57.81 
 
 		 243 aa  289  2e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.872796 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0141  ABC transporter related  57.32 
 
 		 240 aa  290  2e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.911941  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0898  hypothetical protein  60.42 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0867  hypothetical protein  60.42 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1176  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2891  ABC transporter ATP-binding protein  58.82 
 
 		 241 aa  288  4e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.724805  normal  0.0929005 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03192  ABC-type transport system ATPase component  58.4 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4313  ABC transporter related  59.49 
 
 		 251 aa  288  6e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3637  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.4 
 
 		 241 aa  288  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.671496  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3814  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.188088  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3511  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3580  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3509  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3678  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.156461 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3616  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  287  9e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.238218 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0708  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.658002  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1236  ABC transporter related protein  60.09 
 
 		 245 aa  286  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.839262  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2108  ABC transporter, ATP-binding protein  56.72 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0717  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.759015  normal  0.46231 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3667  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00165948  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3656  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.98 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.875085  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0687  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  286  2e-76  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000839172  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2634  ABC transporter related  59.92 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.445237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3026  ABC transporter, ATP-binding protein  59.92 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.808463  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3960  ABC transporter, ATP-binding protein  58.92 
 
 		 243 aa  285  4e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12363  ABC transporter, ATP-binding protein  54.85 
 
 		 246 aa  285  4e-76  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0674  ABC transporter related  58.92 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.120094  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3348  ABC transporter related  58.92 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00159492  normal  0.142579 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0673  ABC transporter related  58.92 
 
 		 243 aa  285  5e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.207873  normal  0.0972351 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0507  ABC transporter-related protein  59.91 
 
 		 240 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.302089  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0828  ABC transporter related  59.24 
 
 		 239 aa  284  8e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0871  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0818606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2117  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2170  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 		 244 aa  283  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.529851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0251  ATPase  57.26 
 
 		 244 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1937  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  283  2.0000000000000002e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0868  ABC transporter related  58.33 
 
 		 254 aa  283  2.0000000000000002e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0567  ABC transporter related  58.4 
 
 		 241 aa  283  2.0000000000000002e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.714932  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0595  ABC transporter related protein  58.16 
 
 		 249 aa  283  2.0000000000000002e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63679  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0065  ABC transporter related  59 
 
 		 310 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0428  ABC transporter related  56.85 
 
 		 241 aa  282  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.02513 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1911  ABC transporter related  57.6 
 
 		 255 aa  282  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3684  ABC transporter related  55.7 
 
 		 244 aa  282  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4542  ABC transporter, ATP-binding protein  57.92 
 
 		 246 aa  281  5.000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.979233  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2546  ABC transporter related  57.26 
 
 		 244 aa  281  6.000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.651086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002404  lipopolysaccharide ABC transporter ATP-binding protein LptB  56.72 
 
 		 241 aa  281  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.052444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0275  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.314804  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0282  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  57.14 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03663  hypothetical protein  56.72 
 
 		 241 aa  280  1e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3615  ABC transporter related  57.68 
 
 		 243 aa  280  1e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0117606  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0759  LPS ABC transporter ATP-binding protein  57.56 
 
 		 249 aa  279  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1206  ABC transporter, ATP-binding protein  57.56 
 
 		 249 aa  279  2e-74  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1770  ATPase  58.65 
 
 		 240 aa  279  3e-74  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.464592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4049  ABC transporter related  55.7 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000937515 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0716  ABC transporter related  59.34 
 
 		 243 aa  279  3e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0818834  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0752  ABC transporter related protein  57.89 
 
 		 247 aa  279  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.306795  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4452  ABC transporter, ATP-binding protein  57.14 
 
 		 241 aa  278  6e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0490  ABC transporter related  58.26 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.858965  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0176  ABC transporter related  59.49 
 
 		 333 aa  278  6e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.102512  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1196  ABC transporter related protein  55.27 
 
 		 243 aa  278  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0587  ABC transporter related  56.3 
 
 		 256 aa  278  7e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.410332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1616  ABC transporter related  58.68 
 
 		 255 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0174  ABC transporter, ATPase subunit  59.07 
 
 		 332 aa  277  1e-73  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.645822 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4168  ABC transporter, ATPase subunit  58.54 
 
 		 255 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3689  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.4 
 
 		 241 aa  277  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2798  ABC transporter related protein  55.88 
 
 		 277 aa  277  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0826  ABC transporter related  54.96 
 
 		 271 aa  276  1e-73  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2850  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.606639  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2708  ABC transporter related  57.55 
 
 		 258 aa  277  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0148157 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03066  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  58.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00157983  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0506  ABC transporter related protein  58.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4523  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.939154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4239  ABC transporter related  58.4 
 
 		 243 aa  276  2e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000891993 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0291  ABC transporter related  57.09 
 
 		 262 aa  276  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.342823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2801  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.312589 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2125  ABC transporter related  58.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3569  putative ABC transporter ATP-binding protein YhbG  58.82 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.863605  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57930  putative ATP-binding component of ABC transporter  57.56 
 
 		 241 aa  276  2e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2790  ABC transporter related  57.14 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.015078  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>