More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2192 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2027  CheA signal transduction histidine kinase  90.75 
 
 
777 aa  1271  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.162071  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2192  CheA signal transduction histidine kinase  100 
 
 
801 aa  1580  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2466  CheA signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 
772 aa  503  1e-141  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.378158  normal  0.0397197 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2710  CheA signal transduction histidine kinase  41.4 
 
 
777 aa  497  1e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
784 aa  496  1e-139  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  39.92 
 
 
777 aa  489  1e-137  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0238  CheA signal transduction histidine kinases  35.76 
 
 
764 aa  401  1e-110  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  34.71 
 
 
764 aa  397  1e-109  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0494  CheA signal transduction histidine kinases  33.17 
 
 
798 aa  380  1e-104  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0036  CheA signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
742 aa  357  7e-97  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0357  CheA signal transduction histidine kinase  34.61 
 
 
695 aa  346  9e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4206  CheA signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 
741 aa  340  8e-92  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.351121  normal  0.245941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1482  CheA signal transduction histidine kinases  31.89 
 
 
734 aa  330  9e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0181827 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1836  CheA signal transduction histidine kinase  31.99 
 
 
679 aa  329  1e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00846455 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0725  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
762 aa  324  4e-87  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0600  CheA signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 
706 aa  317  4e-85  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1834  CheA signal transduction histidine kinases  37.43 
 
 
878 aa  315  2e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1056  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.02 
 
 
764 aa  314  3e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.355241  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0831  chemotaxis protein  33.12 
 
 
752 aa  312  2e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.203342  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2405  CheA signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
740 aa  311  3e-83  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.588075  normal  0.188448 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  33.11 
 
 
756 aa  310  6e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0469  CheA signal transduction histidine kinase  40.7 
 
 
830 aa  308  2e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.153889  normal  0.631146 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4126  CheA signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
755 aa  308  3e-82  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.153494  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1687  chemotaxis protein CheA  28.71 
 
 
769 aa  303  6e-81  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0998  CheA signal transduction histidine kinase  29.85 
 
 
783 aa  303  7e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.154879  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0332  chemotaxis protein CheA  28.47 
 
 
769 aa  302  2e-80  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2382  CheA signal transduction histidine kinase  37.53 
 
 
679 aa  301  4e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0310  chemotaxis protein CheA  29.43 
 
 
769 aa  299  1e-79  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.560249  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0790  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
865 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0764  CheA signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 
865 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2678  CheA signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
705 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.295272  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1523  CheA signal transduction histidine kinase  27.5 
 
 
808 aa  297  6e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3200  CheA signal transduction histidine kinase  28.9 
 
 
781 aa  296  7e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.3357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1307  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.73 
 
 
789 aa  296  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.105152  hitchhiker  0.00575971 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5118  CheA signal transduction histidine kinase  33.38 
 
 
707 aa  295  2e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.179318  normal  0.034812 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0205  CheW domain protein  27.8 
 
 
774 aa  295  2e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00145615  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4171  CheA signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
686 aa  295  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2773  CheA signal transduction histidine kinase  40 
 
 
705 aa  293  1e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00107192  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3649  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  30.96 
 
 
763 aa  293  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0920169  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3969  signal transduction histidine kinase (cheA)  29.47 
 
 
768 aa  292  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00140745  normal  0.014071 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1433  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  30.84 
 
 
764 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.654463  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0417  CheA signal transduction histidine kinase  30.96 
 
 
896 aa  290  7e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0485913  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0331  chemotaxis histidine kinase  36.09 
 
 
770 aa  290  8e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3253  CheA signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
756 aa  287  4e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0312912  normal  0.0661628 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0407  CheA signal transduction histidine kinase  32.55 
 
 
896 aa  287  5e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5391  CheA signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
760 aa  286  8e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.45011  normal  0.581829 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3975  CheA signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
804 aa  285  3e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4439  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4230  CheA signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
765 aa  284  4e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1097  CheA signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
767 aa  283  8e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  35.76 
 
 
2212 aa  282  1e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1497  sensor histidine kinase/response regulator  35.55 
 
 
793 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1492  CheA signal transduction histidine kinase  35.28 
 
 
762 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0312687  normal  0.934055 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1369  chemotaxis protein CheA  33.62 
 
 
770 aa  281  4e-74  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  31.02 
 
 
2336 aa  278  3e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
2539 aa  277  5e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
1974 aa  275  2e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1580  putative response regulator of two-component system  33.33 
 
 
783 aa  275  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3533  CheA signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 
808 aa  274  4e-72  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.229129  normal  0.100521 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1657  chemotaxis protein CheA  32.98 
 
 
785 aa  273  8e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.153065  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  30.83 
 
 
2301 aa  273  8e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16470  putative chemotaxis sensor/effector fusion protein  35.08 
 
 
769 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0944854  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  28.46 
 
 
1758 aa  269  1e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  29.07 
 
 
1992 aa  269  2e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  34.12 
 
 
1643 aa  268  3e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  29.13 
 
 
1987 aa  267  7e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1725 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 
1725 aa  266  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1193  CheA signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
706 aa  265  4e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0440291  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  38.72 
 
 
768 aa  263  7e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
2423 aa  261  2e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1530  CheA signal transduction histidine kinases  32.68 
 
 
803 aa  260  6e-68  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2297  CheA signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
799 aa  260  7e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2396  CheA signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 
1832 aa  260  8e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.412957 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4942  CheA signal transduction histidine kinase  29.21 
 
 
766 aa  257  5e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.993861 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  33.67 
 
 
2301 aa  257  8e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  34.02 
 
 
2476 aa  256  1e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  34.28 
 
 
2458 aa  256  1e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2367  CheA signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
688 aa  256  2e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.990508  decreased coverage  9.28264e-05 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  32.45 
 
 
1971 aa  254  4e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1873  CheA signal transduction histidine kinases  32.66 
 
 
839 aa  253  8e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.7666  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3683  CheA signal transduction histidine kinase  29.11 
 
 
769 aa  253  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.461303  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5517  CheA signal transduction histidine kinases  29.2 
 
 
769 aa  251  4e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0873322  normal  0.1808 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2683  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.13 
 
 
864 aa  251  5e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  29.2 
 
 
1888 aa  250  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2538  chemotaxis histidine kinase/response regulator  31.13 
 
 
864 aa  250  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
2164 aa  250  7e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0258  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.13 
 
 
864 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.334424  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0221  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.13 
 
 
864 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1402  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.13 
 
 
864 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1599  putative chemotaxis sensor histidine kinase  31.13 
 
 
864 aa  250  9e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0359  CheA signal transduction histidine kinases  35.82 
 
 
1834 aa  249  1e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.505566  normal  0.609353 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1847  CheA signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 
934 aa  249  1e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.379526 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  32.93 
 
 
2284 aa  249  2e-64  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4695  putative CheA signal transduction histidine kinase  30.91 
 
 
1127 aa  248  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0613  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
750 aa  248  4e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.972381  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2775  CheA signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
1125 aa  247  5e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.74774  normal  0.345164 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3342  CheA signal transduction histidine kinase  32.81 
 
 
1137 aa  247  7e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0638  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
753 aa  247  7e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1065  CheA signal transduction histidine kinase  33.27 
 
 
1065 aa  246  8e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.47894  hitchhiker  1.40381e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0647  CheA signal transduction histidine kinase  34.63 
 
 
756 aa  246  9e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>