More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1787 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1787  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  100 
 
 		 569 aa  1131    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0490686 
 
 
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NC_009483  Gura_1721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.65 
 
 		 573 aa  662    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2614  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  59.12 
 
 		 578 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0857  RecJ exonuclease  55.87 
 
 		 578 aa  578  1e-164  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  51.41 
 
 		 568 aa  543  1e-153  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2006  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  48.31 
 
 		 586 aa  538  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_1890  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  45.2 
 
 		 574 aa  458  1e-127  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000386066  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1327  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 		 599 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.168372 
 
 
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NC_013216  Dtox_2289  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42 
 
 		 907 aa  444  1e-123  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.322971  hitchhiker  0.00000129081 
 
 
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NC_009253  Dred_0731  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.67 
 
 		 885 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.0000934537  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2536  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.82 
 
 		 564 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.962109  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1415  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.36 
 
 		 573 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1313  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  49.17 
 
 		 573 aa  427  1e-118  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1346  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.6 
 
 		 827 aa  403  1e-111  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000597878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2008  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.42 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00291083  decreased coverage  0.00122076 
 
 
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NC_010320  Teth514_1465  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.29 
 
 		 811 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0172153  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3611  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.75 
 
 		 801 aa  388  1e-106  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000975309  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1758  exonuclease RecJ  41.95 
 
 		 592 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.150743  normal  0.165864 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3931  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.24 
 
 		 572 aa  382  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.420242  normal  0.0571898 
 
 
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NC_011899  Hore_12210  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.79 
 
 		 814 aa  384  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000495428  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0689  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.34 
 
 		 798 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.944207  n/a   
 
 
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NC_009972  Haur_4833  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.86 
 
 		 573 aa  380  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00133424  n/a   
 
 
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NC_009943  Dole_2106  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.16 
 
 		 573 aa  382  1e-104  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00306237  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3668  single-strand DNA specific exonuclease  36.68 
 
 		 574 aa  375  1e-102  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013730  Slin_1195  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.48 
 
 		 584 aa  371  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010830  Aasi_1422  hypothetical protein  38.52 
 
 		 566 aa  368  1e-100  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432451 
 
 
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NC_009718  Fnod_0336  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.84 
 
 		 989 aa  367  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1795  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.63 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.76607  normal  1 
 
 
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NC_013132  Cpin_6989  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.53 
 
 		 568 aa  363  4e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000550153 
 
 
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NC_010803  Clim_0558  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.41 
 
 		 571 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.175836  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1673  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.34 
 
 		 570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000218302  normal  0.669002 
 
 
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NC_011831  Cagg_1887  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.53 
 
 		 570 aa  362  1e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014230  CA2559_02825  single-stranded-DNA-specific exonuclease recJ  36.93 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.274504  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_4050  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.64 
 
 		 570 aa  358  1.9999999999999998e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000178442 
 
 
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NC_013440  Hoch_2398  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.28 
 
 		 577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.924128  normal  0.955687 
 
 
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NC_007973  Rmet_1038  exonuclease RecJ  42.96 
 
 		 566 aa  357  3.9999999999999996e-97  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.329478 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0937  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.92 
 
 		 788 aa  356  5e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2512  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.61 
 
 		 785 aa  356  6.999999999999999e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000579618  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0347  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 564 aa  355  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007347  Reut_A1074  exonuclease RecJ  42.52 
 
 		 565 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0444947  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS4304  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 779 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_4639  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.7 
 
 		 779 aa  353  4e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010718  Nther_1287  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.81 
 
 		 831 aa  351  2e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0707  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.52 
 
 		 779 aa  350  3e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_1969  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.79 
 
 		 563 aa  350  5e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00305659  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4528  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 779 aa  349  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012912  Dd1591_3424  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  43.65 
 
 		 576 aa  349  8e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.297966  n/a   
 
 
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NC_003909  BCE_4493  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 779 aa  349  9e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011658  BCAH187_A4543  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 779 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_4142  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.35 
 
 		 779 aa  348  2e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_2838  RecJ exonuclease  42.58 
 
 		 566 aa  348  2e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.934115  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_0590  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.91 
 
 		 568 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.50334  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK4153  single-stranded-DNA-specific exonuclease  36.17 
 
 		 779 aa  347  3e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_0674  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  37.91 
 
 		 583 aa  347  3e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013061  Phep_3683  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.33 
 
 		 567 aa  347  4e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002978  WD0312  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.63 
 
 		 579 aa  347  5e-94  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_2743  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.45 
 
 		 574 aa  346  7e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00277097  n/a   
 
 
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NC_013501  Rmar_2564  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.73 
 
 		 587 aa  346  8e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010571  Oter_3463  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.19 
 
 		 573 aa  345  8.999999999999999e-94  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0980529  normal  0.938738 
 
 
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NC_010184  BcerKBAB4_4256  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.35 
 
 		 773 aa  344  2e-93  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_4489  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.17 
 
 		 779 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000134083 
 
 
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NC_002936  DET0964  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  36.25 
 
 		 566 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.010732  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2065  exonuclease RecJ  42.65 
 
 		 564 aa  343  5.999999999999999e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009674  Bcer98_3125  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.83 
 
 		 779 aa  342  1e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.388004  n/a   
 
 
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NC_007644  Moth_1681  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.25 
 
 		 911 aa  342  2e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.674318  normal  0.0670138 
 
 
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NC_013552  DhcVS_837  single-stranded-DNA-specific exonuclease  35.9 
 
 		 566 aa  340  4e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0560286  n/a   
 
 
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NC_011769  DvMF_1134  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  40.81 
 
 		 571 aa  340  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_007514  Cag_0603  RecJ exonuclease  37.39 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0855  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.9 
 
 		 566 aa  338  9.999999999999999e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000731526  n/a   
 
 
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NC_011312  VSAL_I0564  ssDNA exonuclease RecJ  40.92 
 
 		 579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.755584  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_4172  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.53 
 
 		 579 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.698282  normal  0.703771 
 
 
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NC_008346  Swol_0805  single-stranded DNA-specific exonuclease-like protein  38.98 
 
 		 932 aa  337  2.9999999999999997e-91  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00139649  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_0051  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  38.69 
 
 		 579 aa  336  7.999999999999999e-91  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.458674  normal  0.205446 
 
 
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NC_010622  Bphy_1448  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.84 
 
 		 577 aa  335  9e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007912  Sde_1213  exonuclease RecJ  40.83 
 
 		 581 aa  335  9e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012917  PC1_0647  ssDNA exonuclease RecJ  41.62 
 
 		 584 aa  335  2e-90  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.252802  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0301  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  35.23 
 
 		 977 aa  334  2e-90  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1298  RecJ exonuclease  41.52 
 
 		 571 aa  333  4e-90  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.882929  normal  0.617769 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0292  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.76 
 
 		 577 aa  333  5e-90  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1885  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.214774  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00958  ssDNA exonuclease RecJ  39.75 
 
 		 579 aa  332  9e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0863  ssDNA exonuclease RecJ  41.8 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0892  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.73 
 
 		 584 aa  332  1e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.488933  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4751  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.24 
 
 		 626 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3113  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2758  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.68 
 
 		 574 aa  331  3e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1698  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2205  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2721  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1478  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2642  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
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NC_009074  BURPS668_2588  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  42.88 
 
 		 564 aa  330  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4244  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.41 
 
 		 569 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010681  Bphyt_2569  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.55 
 
 		 568 aa  329  8e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.217652  normal  0.0265746 
 
 
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NC_002947  PP_1477  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.05 
 
 		 569 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.221142  normal  0.152861 
 
 
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NC_004347  SO_0952  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.41 
 
 		 574 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_010465  YPK_0922  ssDNA exonuclease RecJ  41.26 
 
 		 577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009665  Shew185_3522  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  39.73 
 
 		 577 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002620  TC0732  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  34.87 
 
 		 582 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.213373  n/a   
 
 
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NC_007519  Dde_2715  single-stranded-DNA-specific exonuclease RecJ  41.48 
 
 		 568 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.036762  n/a   
 
 
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