More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_7278 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
1094 aa  2182    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  85.08 
 
 
1142 aa  1852    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  34.22 
 
 
1160 aa  316  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1960  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  33.48 
 
 
1080 aa  303  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.54 
 
 
1089 aa  295  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1786  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  32.85 
 
 
1081 aa  291  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.145933 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2685  adenylate/guanylate cyclase  29.1 
 
 
1093 aa  264  8e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.111623 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1181  ATPase, putative adenylate/guanylate cyclase activity  28.29 
 
 
1134 aa  260  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1262  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.2 
 
 
1055 aa  254  7e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0385  adenylate/guanylate cyclase  31.97 
 
 
1198 aa  253  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1238  adenylate/guanylate cyclase  29.88 
 
 
1050 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.431531  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1255  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.88 
 
 
1050 aa  246  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.922944 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1904  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  31.17 
 
 
1014 aa  240  9e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1264  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.68 
 
 
1053 aa  240  1e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1064  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  31.32 
 
 
1226 aa  235  4.0000000000000004e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4593  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.65 
 
 
1141 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4285  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 
1204 aa  227  1e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0405  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  27.96 
 
 
1291 aa  227  1e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3641  adenylate/guanylate cyclase  29.67 
 
 
1138 aa  225  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.595732  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6723  adenylate/guanylate cyclase  26.39 
 
 
1148 aa  223  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2301  adenylate/guanylate cyclase  65.17 
 
 
199 aa  222  3.9999999999999997e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0000915403  normal  0.0162961 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4346  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.99 
 
 
1190 aa  220  1e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5181  adenylate/guanylate cyclase  28.34 
 
 
1227 aa  219  2e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.454407  normal  0.397726 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4834  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.42 
 
 
1149 aa  216  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.519309  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6648  adenylate/guanylate cyclase  28.55 
 
 
1048 aa  214  5.999999999999999e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.119419 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0329  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
1285 aa  214  5.999999999999999e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.902018  normal  0.090123 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5617  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.61 
 
 
1151 aa  214  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.413675 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5834  adenylate/guanylate cyclase  26.41 
 
 
1151 aa  212  3e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6166  adenylate/guanylate cyclase  27.6 
 
 
1139 aa  208  4e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0601  adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 
1063 aa  206  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.534178 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1771  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  29.61 
 
 
1403 aa  205  4e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00900617  normal  0.173635 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1683  sterile alpha motif-containing protein  27.96 
 
 
1122 aa  204  9e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.122095  normal  0.480972 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4524  adenylate/guanylate cyclase  25.55 
 
 
1105 aa  197  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7064  adenylate/guanylate cyclase  28.62 
 
 
1046 aa  195  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.48236  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4787  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  33.14 
 
 
1190 aa  191  9e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000313261 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  31.21 
 
 
1096 aa  190  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6475  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  28.55 
 
 
1175 aa  187  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.928071  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3586  adenylate/guanylate cyclase  24.77 
 
 
1123 aa  172  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0258664  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0044  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  27.03 
 
 
1360 aa  172  5e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0143745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1020  adenylate/guanylate cyclase with TPR repeats  30.37 
 
 
1441 aa  171  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5691  sterile alpha motif-containing protein  25.59 
 
 
1055 aa  169  2.9999999999999998e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2730  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  26.44 
 
 
1429 aa  166  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.225426  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  29.51 
 
 
919 aa  166  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  27.64 
 
 
1422 aa  162  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1458  adenylate/guanylate cyclase  26.81 
 
 
1271 aa  163  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1265  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.73 
 
 
1087 aa  159  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.313737  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5885  adenylate/guanylate cyclase  28.06 
 
 
1065 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.484069  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3318  serine/threonine protein kinase  25.11 
 
 
1403 aa  158  6e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0363788 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4100  tetratricopeptide TPR_4  27.11 
 
 
1377 aa  156  2.9999999999999998e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000225277 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  30.02 
 
 
968 aa  152  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4480  adenylate/guanylate cyclase  24.49 
 
 
1037 aa  150  9e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.420291 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6499  adenylate/guanylate cyclase  28.08 
 
 
1043 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.953876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1844  adenylate/guanylate cyclase  20.33 
 
 
1153 aa  150  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4365  serine/threonine protein kinase  27.16 
 
 
1398 aa  148  7.0000000000000006e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161943  normal  0.271622 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0233  protein kinase  28.16 
 
 
1358 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.838065 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3945  serine/threonine protein kinase  24.75 
 
 
1402 aa  143  9.999999999999999e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0258209  decreased coverage  0.00379805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2514  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.31 
 
 
805 aa  138  7.000000000000001e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255798  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5817  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.22 
 
 
1117 aa  135  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.987754  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  30.41 
 
 
833 aa  135  3.9999999999999996e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
320 aa  131  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  34.73 
 
 
320 aa  131  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  27.89 
 
 
979 aa  129  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2256  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  23.43 
 
 
1295 aa  129  5e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1263  adenylate/guanylate cyclase  26.05 
 
 
1027 aa  123  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.505762  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2406  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.32 
 
 
852 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.369938  normal  0.385932 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1821  adenylate/guanylate cyclase  34.11 
 
 
738 aa  121  9e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0453734  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1682  putative adenylate/guanylate cyclase  27.38 
 
 
1071 aa  120  9.999999999999999e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.114173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1991  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  26.4 
 
 
1023 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0171462  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1254  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
1027 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.419758  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1237  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
1027 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  36.36 
 
 
513 aa  118  6e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  35.6 
 
 
665 aa  118  6e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  34.69 
 
 
861 aa  118  6.9999999999999995e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1908  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain  33.64 
 
 
518 aa  117  8.999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.136997  normal  0.266082 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1214  adenylate/guanylate cyclase  25.64 
 
 
1130 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2702  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.57 
 
 
656 aa  115  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00394792  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1218  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.98 
 
 
611 aa  115  5e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  34.36 
 
 
860 aa  114  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2371  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  35.32 
 
 
657 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0177701 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  35.29 
 
 
864 aa  113  2.0000000000000002e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1658  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.17 
 
 
577 aa  110  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.791017  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0559  adenylate/guanylate cyclase  34.38 
 
 
523 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.855978  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1643  adenylate/guanylate cyclase  37.7 
 
 
536 aa  110  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.292421  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4057  serine/threonine protein kinase  26.23 
 
 
1321 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.362289 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  35.11 
 
 
858 aa  108  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  33.69 
 
 
431 aa  108  7e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0329  ATPase-like protein  25 
 
 
1169 aa  107  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.257596 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3177  adenylate/guanylate cyclase with GAF and PAS/PAC sensors  31.47 
 
 
971 aa  107  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  33.69 
 
 
441 aa  107  2e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4571  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor and FHA domain protein  31.75 
 
 
546 aa  107  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.226096  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2957  AAA ATPase  25.28 
 
 
1264 aa  107  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000302868 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  32.26 
 
 
479 aa  107  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2267  putative adenylate/guanylate cyclase  29.28 
 
 
703 aa  106  3e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2227  XRE family transcriptional regulator  27.31 
 
 
1015 aa  105  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1173  ribosomal protein L19  34.04 
 
 
460 aa  105  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000211521 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  32.98 
 
 
859 aa  105  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1344  adenylate/guanylate cyclase  33.86 
 
 
794 aa  105  6e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3132  serine/threonine protein kinase  25.75 
 
 
1349 aa  104  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.28005  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0102  serine/threonine protein kinase  25.14 
 
 
1289 aa  103  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5176  adenylate/guanylyl cyclase  34.43 
 
 
717 aa  103  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263029  normal  0.588904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>