More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5074 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_5074  bifunctional RNase H/acid phosphatase  100 
 
 		 378 aa  751    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0171562  normal  0.0167384 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1438  bifunctional RNase H/acid phosphatase  81.75 
 
 		 378 aa  605  9.999999999999999e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.246631  normal  0.0428381 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  61.29 
 
 		 378 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  56.88 
 
 		 382 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3618  bifunctional RNase H/acid phosphatase  54.45 
 
 		 369 aa  364  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.324125  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2311  phosphoglycerate mutase  50.11 
 
 		 440 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.3615 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2892  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.56 
 
 		 356 aa  349  4e-95  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.816574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07200  fructose-2,6-bisphosphatase  51.8 
 
 		 383 aa  342  7e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.282804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3342  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.7 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.135995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3404  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.7 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.262281 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3353  bifunctional RNase H/acid phosphatase  52.7 
 
 		 365 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.359668 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  49.14 
 
 		 411 aa  332  6e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3460  Phosphoglycerate mutase  52.94 
 
 		 363 aa  325  9e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  49.11 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3355  phosphoglycerate mutase  47.17 
 
 		 412 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2015  phosphoglycerate mutase  47.94 
 
 		 401 aa  301  2e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.128037  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12257  bifunctional RNase H/acid phosphatase  50.27 
 
 		 364 aa  292  7e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000101677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3274  Phosphoglycerate mutase  47.06 
 
 		 370 aa  285  9e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000275954  hitchhiker  0.000874495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  47.13 
 
 		 402 aa  278  1e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3334  Phosphoglycerate mutase  50.27 
 
 		 366 aa  273  4.0000000000000004e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185699  normal  0.415559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2083  Phosphoglycerate mutase  44.05 
 
 		 412 aa  244  1.9999999999999999e-63  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.244664  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6815  Fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  53.55 
 
 		 452 aa  199  5e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.142428 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2710  Phosphoglycerate mutase  53.66 
 
 		 215 aa  190  2.9999999999999997e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.266877  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  53.69 
 
 		 427 aa  188  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09490  ribonuclease HI  61.29 
 
 		 322 aa  176  4e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3094  Phosphoglycerate mutase  44.24 
 
 		 218 aa  162  7e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0314512  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4815  ribonuclease H  62.32 
 
 		 137 aa  162  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.084828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0171  phosphoglycerate mutase  43.37 
 
 		 205 aa  141  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.693324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  40.61 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  35 
 
 		 205 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  34.69 
 
 		 213 aa  117  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3660  ribonuclease H  51.13 
 
 		 133 aa  116  7.999999999999999e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270083  normal  0.190281 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 208 aa  113  5e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2324  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  112  8.000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 209 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 235 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1699  phosphoglycerate mutase  33.5 
 
 		 213 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.812426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  36.04 
 
 		 203 aa  109  9.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1600  phosphoglycerate mutase  34.02 
 
 		 209 aa  109  9.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1243  phosphoglycerate mutase, putative  36.19 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.348551  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  35.19 
 
 		 237 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 202 aa  108  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000059372  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  31.77 
 
 		 196 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000015335  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  32.04 
 
 		 213 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  34.98 
 
 		 214 aa  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0499  putative phosphoglycerate mutase 2 protein  37.62 
 
 		 227 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.725562  normal  0.192207 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0374  Phosphoglycerate mutase  41.56 
 
 		 226 aa  107  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3771  phosphoglycerate mutase  36.59 
 
 		 220 aa  105  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0389  Phosphoglycerate mutase  40.91 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0252032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0652  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 221 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.288396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0202  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.326215  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0685  phosphoglycerate mutase  37.56 
 
 		 221 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0613  phosphoglycerate mutase  35.21 
 
 		 223 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.496101 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3410  phosphoglycerate mutase 2  36.49 
 
 		 229 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14960  fructose-2,6-bisphosphatase  33.84 
 
 		 243 aa  100  3e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.588171  normal  0.430385 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4718  Phosphoglycerate mutase  37.5 
 
 		 198 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0179  ribonuclease H  47.29 
 
 		 132 aa  100  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1173  ribonuclease H  39.85 
 
 		 194 aa  100  5e-20  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3369  phosphoglycerate mutase family protein  35.58 
 
 		 220 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3404  phosphoglycerate mutase family protein  35.58 
 
 		 220 aa  100  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1238  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 213 aa  100  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.754918  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2350  phosphoglycerate mutase, putative  35.24 
 
 		 229 aa  99.8  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 206 aa  99.8  8e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1455  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 201 aa  99.4  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0579  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 220 aa  99.4  9e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.763016  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1409  phosphoglycerate mutase  33.17 
 
 		 201 aa  99.4  9e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.650422  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  35.6 
 
 		 201 aa  99  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2428  ribonuclease H  41.13 
 
 		 198 aa  99  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0723  ribonuclease H  42.4 
 
 		 168 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4654  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 212 aa  99  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000940837 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2587  ribonuclease H  45.26 
 
 		 197 aa  99  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0341  ribonuclease H  47.01 
 
 		 142 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4091  phosphoglycerate mutase  34.5 
 
 		 227 aa  98.2  2e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.810291 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4252  phosphoglycerate mutase  35.27 
 
 		 245 aa  98.2  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0605  phosphoglycerate mutase  35.61 
 
 		 220 aa  98.6  2e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.338062  normal  0.808152 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3448  Phosphoglycerate mutase  40.1 
 
 		 210 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.402092 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0263  putative phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 220 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.947461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1125  putative phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 220 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2529  putative phosphoglycerate mutase  35.1 
 
 		 220 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  39.41 
 
 		 210 aa  97.4  4e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0760  ribonuclease H  42.4 
 
 		 253 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2177  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 212 aa  97.1  5e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0760  ribonuclease H  42.4 
 
 		 253 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.641893  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  33.16 
 
 		 212 aa  97.1  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0764  ribonuclease H  39.39 
 
 		 254 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00463107  normal  0.774807 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2558  phosphoglycerate mutase  34.63 
 
 		 223 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.56106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0972  Phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 215 aa  96.7  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  37.27 
 
 		 200 aa  96.3  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  32.31 
 
 		 213 aa  96.3  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1226  Phosphoglycerate mutase  44.65 
 
 		 195 aa  96.3  8e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.129631  normal  0.708444 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4233  phosphoglycerate mutase  34 
 
 		 213 aa  95.9  9e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.555446  normal  0.270297 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18180  fructose-2,6-bisphosphatase  39.74 
 
 		 210 aa  95.5  1e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.13343  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  34.3 
 
 		 241 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0514  phosphoglycerate mutase  35.82 
 
 		 224 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.575889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  29.23 
 
 		 200 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 		 207 aa  95.1  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1298  Phosphoglycerate mutase  34.83 
 
 		 211 aa  94.4  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000085953  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2898  Phosphoglycerate mutase  32.85 
 
 		 208 aa  94.4  3e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.49 
 
 		 200 aa  94  4e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000021297  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0088  ribonuclease H  39.1 
 
 		 211 aa  93.6  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>