More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2449 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2449  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 211 aa  416  9.999999999999999e-116  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.265588 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2258  two component LuxR family transcriptional regulator  82.38 
 
 		 224 aa  346  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.124896  normal  0.0124728 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1971  two component LuxR family transcriptional regulator  76.59 
 
 		 216 aa  301  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.356635  normal  0.773651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3253  two component LuxR family transcriptional regulator  70.14 
 
 		 213 aa  298  5e-80  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4062  two component LuxR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 216 aa  294  6e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0448793  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  71.71 
 
 		 244 aa  293  1e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1487  two component LuxR family transcriptional regulator  68.72 
 
 		 231 aa  286  2e-76  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0122618  normal  0.753042 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4979  two component LuxR family transcriptional regulator  67.31 
 
 		 231 aa  280  1e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.889239  normal  0.507767 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2950  LuxR response regulator receiver  64.9 
 
 		 221 aa  276  1e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3524  response regulator receiver protein  67.68 
 
 		 214 aa  275  4e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0390864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0945  response regulator receiver  65.05 
 
 		 216 aa  273  1.0000000000000001e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0407172  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0992  regulatory protein, LuxR  64.39 
 
 		 218 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.850793  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4738  two component transcriptional regulator, LuxR family  65.37 
 
 		 233 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1528  two component LuxR family transcriptional regulator  64.56 
 
 		 212 aa  269  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.212037  hitchhiker  0.000165031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1577  response regulator receiver  64.08 
 
 		 212 aa  268  5e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.967001 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3505  LuxR family two component transcriptional regulator  62.63 
 
 		 213 aa  261  6e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.345096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0500  two component transcriptional regulator, LuxR family  63.96 
 
 		 226 aa  256  2e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0518  two component LuxR family transcriptional regulator  65.53 
 
 		 225 aa  254  6e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.665179 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4749  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.8 
 
 		 223 aa  254  7e-67  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0190  two component transcriptional regulator, LuxR family  60.48 
 
 		 219 aa  249  3e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.146862  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 233 aa  245  4e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0277195 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3035  LuxR response regulator receiver  63.94 
 
 		 223 aa  244  6e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3097  two component transcriptional regulator, LuxR family  59.62 
 
 		 222 aa  244  6.999999999999999e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472018  normal  0.507317 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6098  two component transcriptional regulator, LuxR family  62.62 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22850  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  57 
 
 		 239 aa  240  1e-62  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.711047 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1910  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.77 
 
 		 218 aa  239  2e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0097  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.1 
 
 		 209 aa  235  3e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142871  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1446  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.42 
 
 		 223 aa  234  5.0000000000000005e-61  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2003  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.12 
 
 		 219 aa  234  7e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.183245  hitchhiker  0.00373502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2073  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.15 
 
 		 226 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000764485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2136  two component LuxR family transcriptional regulator  56.37 
 
 		 254 aa  230  1e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0553154  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13154  two component system transcriptional regulatory protein DevR  54.59 
 
 		 217 aa  226  1e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1427  two component LuxR family transcriptional regulator  54.37 
 
 		 212 aa  224  1e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01100  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  54.81 
 
 		 214 aa  222  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3847  two component LuxR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 216 aa  222  3e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.118356  decreased coverage  0.00872558 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4126  two component LuxR family transcriptional regulator  52.88 
 
 		 220 aa  222  4e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4201  two component LuxR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 215 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.180608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4357  two component LuxR family transcriptional regulator  52.91 
 
 		 215 aa  221  8e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.171113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2140  response regulator receiver  58.37 
 
 		 218 aa  218  6e-56  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.95288  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4145  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.37 
 
 		 216 aa  211  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1076  two component LuxR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1092  two component LuxR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.123414  normal  0.110897 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1103  two component LuxR family transcriptional regulator  54.85 
 
 		 228 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.191898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4820  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.5 
 
 		 218 aa  205  4e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2548  two component LuxR family transcriptional regulator  53.62 
 
 		 216 aa  200  9.999999999999999e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.971783  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1611  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.57 
 
 		 208 aa  186  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.548364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  48.22 
 
 		 212 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.775478  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 228 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 221 aa  171  9e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.55 
 
 		 219 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.99 
 
 		 236 aa  169  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 217 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1701  response regulator receiver protein  44.88 
 
 		 224 aa  167  8e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0169479 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2171  two component LuxR family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0762379  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.06 
 
 		 242 aa  166  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04459  two-component system regulatory protein  43.81 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.57 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4064  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.02 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.72 
 
 		 253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  42.18 
 
 		 234 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 213 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2656  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.38 
 
 		 226 aa  162  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.161573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1998  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.66 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.12496  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1874  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.17 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.635222  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 242 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0356  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.96 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165726  normal  0.0985551 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  161  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0692  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.59 
 
 		 213 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  43.41 
 
 		 222 aa  161  5.0000000000000005e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.12 
 
 		 242 aa  161  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0647  two component LuxR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 225 aa  160  9e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  39.91 
 
 		 218 aa  160  1e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5788  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.06 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.785726 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  41.71 
 
 		 234 aa  160  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  44.93 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.4 
 
 		 226 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3988  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.03 
 
 		 228 aa  159  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0354189  normal  0.736565 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  40.19 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  42.44 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.63 
 
 		 217 aa  159  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  39.23 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1049  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.87 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.661499  normal  0.245945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.98 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.81 
 
 		 241 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  37.98 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  42.93 
 
 		 227 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 221 aa  159  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0239  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.02 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3240  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.85 
 
 		 224 aa  158  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1903  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.79 
 
 		 225 aa  159  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.202425  normal  0.182857 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2449  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 220 aa  158  4e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.729355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1633  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.67 
 
 		 241 aa  157  8e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.457155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>