162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1570 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 		 497 aa  971    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  76.57 
 
 		 484 aa  692    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  32.39 
 
 		 476 aa  202  8e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  32.69 
 
 		 508 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  32.54 
 
 		 514 aa  177  5e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  26.05 
 
 		 492 aa  174  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  26.26 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  26.26 
 
 		 492 aa  172  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  33.06 
 
 		 483 aa  171  3e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  27.73 
 
 		 510 aa  170  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  27.73 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  27.73 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  27.73 
 
 		 503 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  27.73 
 
 		 510 aa  170  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  26.05 
 
 		 492 aa  169  7e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  25.84 
 
 		 492 aa  169  9e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  26.25 
 
 		 492 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  26.68 
 
 		 492 aa  168  2e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  26.25 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  25.84 
 
 		 492 aa  167  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  29.18 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  30.21 
 
 		 504 aa  162  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 486 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 		 489 aa  160  6e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.35 
 
 		 487 aa  160  6e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  28.71 
 
 		 501 aa  159  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  27.17 
 
 		 488 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  28.84 
 
 		 501 aa  157  3e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  26.86 
 
 		 505 aa  157  3e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  30.83 
 
 		 509 aa  157  4e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  28.83 
 
 		 493 aa  156  8e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  30.66 
 
 		 503 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  31.07 
 
 		 503 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  30.66 
 
 		 507 aa  151  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  27.53 
 
 		 487 aa  151  3e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 		 483 aa  149  8e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 501 aa  147  3e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  28.91 
 
 		 504 aa  143  7e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 480 aa  140  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  29.06 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 479 aa  137  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  26.52 
 
 		 475 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  26.52 
 
 		 474 aa  137  6.0000000000000005e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  21.98 
 
 		 477 aa  133  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  29.79 
 
 		 510 aa  133  9e-30  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  29.79 
 
 		 510 aa  133  9e-30  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  30.48 
 
 		 493 aa  132  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  28.1 
 
 		 509 aa  130  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  24.61 
 
 		 479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  27.95 
 
 		 498 aa  127  3e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  26.04 
 
 		 483 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  27.98 
 
 		 497 aa  124  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  25.07 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 		 503 aa  123  8e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  28.82 
 
 		 499 aa  122  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  23.89 
 
 		 508 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 494 aa  120  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  27.96 
 
 		 492 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  34.26 
 
 		 515 aa  119  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0691  polysaccharide biosynthesis protein  26.24 
 
 		 502 aa  114  5e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  26.18 
 
 		 482 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  25.97 
 
 		 488 aa  113  9e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  26.51 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  23.96 
 
 		 423 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  30.57 
 
 		 484 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 		 500 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  26.53 
 
 		 491 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  28.33 
 
 		 575 aa  109  1e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 421 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  23.58 
 
 		 483 aa  108  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 		 487 aa  107  3e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1910  polysaccharide biosynthesis protein  29.97 
 
 		 520 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  26.49 
 
 		 510 aa  104  4e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 498 aa  103  5e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  27.05 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  30.72 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  28.48 
 
 		 507 aa  102  1e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  29.89 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  26.44 
 
 		 472 aa  100  6e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  24.93 
 
 		 482 aa  99.8  1e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2685  polysaccharide biosynthesis protein  24.87 
 
 		 424 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.996313  normal  0.698647 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  28.53 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3839  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 507 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.133481 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  22.02 
 
 		 492 aa  94.7  3e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2459  polysaccharide biosynthesis protein  28.84 
 
 		 415 aa  94.4  5e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 		 471 aa  93.2  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3039  polysaccharide biosynthesis protein  27.92 
 
 		 482 aa  91.7  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  22.75 
 
 		 483 aa  91.3  4e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 		 504 aa  89.7  1e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  25.4 
 
 		 512 aa  89.4  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5180  polysaccharide biosynthesis protein  29.68 
 
 		 467 aa  88.6  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  26.4 
 
 		 469 aa  87.8  4e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  24.48 
 
 		 484 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  23.41 
 
 		 533 aa  85.1  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  25.9 
 
 		 530 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0429  polysaccharide biosynthesis protein  25.88 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.67703  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.55 
 
 		 508 aa  83.6  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  24.5 
 
 		 488 aa  83.2  0.000000000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>