More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0395 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0395  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 96 aa  189  8e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05725  50S ribosomal protein L23  58.33 
 
 		 96 aa  123  9e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.261745  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1149  Ribosomal protein L25/L23  58.33 
 
 		 95 aa  112  2.0000000000000002e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00000523481  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1936  50S ribosomal protein L23  54.64 
 
 		 97 aa  102  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1617  Ribosomal protein L25/L23  48.94 
 
 		 99 aa  98.2  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3160  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 95 aa  98.6  3e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0604  Ribosomal protein L25/L23  48.96 
 
 		 96 aa  95.1  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0195  50S ribosomal protein L23  52.08 
 
 		 95 aa  94.7  4e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.323191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4345  Ribosomal protein L25/L23  46.32 
 
 		 95 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000178584  normal  0.183841 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5785  Ribosomal protein L25/L23  45.83 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0742289 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0182  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 103 aa  77.8  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000184382  normal  0.668364 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0267  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 99 aa  76.3  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000129072  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2294  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 109 aa  76.3  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0336822  normal  0.0105282 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0844  Ribosomal protein L25/L23  41.24 
 
 		 100 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2062  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 109 aa  74.7  0.0000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000372125  normal  0.225776 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0291  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  74.3  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17631  50S ribosomal protein L23  45.05 
 
 		 100 aa  73.2  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1648  50S ribosomal protein L23  43.96 
 
 		 100 aa  72.8  0.000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2227  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000627291  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0964  Ribosomal protein L25/L23  45.65 
 
 		 93 aa  72.4  0.000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000679303  hitchhiker  0.000000000153425 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2153  50S ribosomal protein L23P  41.05 
 
 		 95 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0455845  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17381  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 100 aa  72  0.000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1743  50S ribosomal protein L23  42.71 
 
 		 96 aa  71.6  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000745247  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17471  50S ribosomal protein L23  42.86 
 
 		 100 aa  71.2  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.576191  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1763  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 		 96 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00961532  normal  0.39775 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2709  Ribosomal protein L25/L23  45.16 
 
 		 95 aa  70.5  0.000000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000605336  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2255  50S ribosomal protein L23  39.36 
 
 		 96 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000014312  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2772  50S ribosomal protein L23  36.17 
 
 		 96 aa  69.3  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0118683  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1182  Ribosomal protein L25/L23  40.66 
 
 		 98 aa  69.3  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000210962  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4024  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.707217  hitchhiker  0.0000264859 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16761  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 97 aa  68.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0869  50S ribosomal protein L23  44.44 
 
 		 97 aa  67.8  0.00000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000185087  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0710  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 95 aa  67.8  0.00000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.58529  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0849  50S ribosomal protein L23P  38.3 
 
 		 99 aa  67.8  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000828313  decreased coverage  0.0000112275 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1348  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2421  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 103 aa  67  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00215934  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1127  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1957  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 100 aa  66.2  0.0000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01190  Ribosomal protein L25/L23  42.11 
 
 		 96 aa  66.2  0.0000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0110234  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20011  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.822236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1557  ribosomal protein L25/L23  39.36 
 
 		 97 aa  66.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.271789  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2316  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000264247  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23041  50S ribosomal protein L23  41.76 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3022  50S ribosomal protein L23  43.48 
 
 		 94 aa  65.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.395888  hitchhiker  0.00706162 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1849  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.310449  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1088  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 100 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1183  50S ribosomal protein L23  42.39 
 
 		 94 aa  66.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2275  50S ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 91 aa  65.5  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000227953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0374  50S ribosomal protein L23  37.36 
 
 		 100 aa  65.1  0.0000000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4917  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 98 aa  65.1  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0776922  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0196  LSU ribosomal protein L23P  40.86 
 
 		 93 aa  64.7  0.0000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00208833  normal  0.0650448 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0081  50S ribosomal protein L23  35.79 
 
 		 96 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.158855 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1829  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.132177  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0682  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  63.9  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.633867  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 110 aa  63.5  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10000  LSU ribosomal protein L23P  42.39 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00605072  hitchhiker  0.00000000356611 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 94 aa  62.8  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1342  Ribosomal protein L25/L23  38.3 
 
 		 98 aa  62.8  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1709  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 98 aa  62  0.000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.182173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2331  50S ribosomal protein L23  39.13 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000250147  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl125  50S ribosomal protein L23  38.95 
 
 		 94 aa  62  0.000000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00000058644  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0257  ribosomal protein L23  40.86 
 
 		 98 aa  62  0.000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4319  Ribosomal protein L25/L23  43.01 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  41.24 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  40.22 
 
 		 94 aa  61.2  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0194  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 94 aa  60.8  0.000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3903  50S ribosomal protein L23  41.3 
 
 		 101 aa  60.8  0.000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0564  Ribosomal protein L25/L23  38.71 
 
 		 100 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0217  50S ribosomal protein L23  40 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000142731  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0662  50S ribosomal protein L23  31.58 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00000319643  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  42.22 
 
 		 99 aa  60.5  0.000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16220  LSU ribosomal protein L23P  40.22 
 
 		 95 aa  60.5  0.000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.491689  decreased coverage  0.0000000109599 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2458  50S ribosomal protein L23  37.89 
 
 		 96 aa  60.1  0.000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0767433 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  44.94 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0456  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0420406  unclonable  0.000000164588 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4747  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000334762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0486  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00438289  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2712  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2397  50S ribosomal protein L23  38.3 
 
 		 97 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00942315  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0489  50S ribosomal protein L23  43.33 
 
 		 99 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.000000019112  normal  0.107844 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  43.82 
 
 		 97 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  38.89 
 
 		 99 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1159  Ribosomal protein L25/L23  38.3 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000025981  hitchhiker  0.000000476583 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  35.79 
 
 		 94 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2644  50S ribosomal protein L23  38.04 
 
 		 96 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.302905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  39.78 
 
 		 95 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0955  ribosomal protein L25/L23  41.11 
 
 		 101 aa  58.2  0.00000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000594054  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1294  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000021109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1392  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 100 aa  58.2  0.00000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000409295  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0247  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.925224  normal  0.80387 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0250  50S ribosomal protein L23  36.84 
 
 		 100 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  42.7 
 
 		 97 aa  57.4  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2063  50S ribosomal protein L23  36.17 
 
 		 96 aa  57.4  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000000993724  normal  0.203735 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3141  Ribosomal protein L25/L23  41.05 
 
 		 103 aa  57  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.457141  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>