More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2557 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2557  ApbE family lipoprotein  100 
 
 
321 aa  659  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0513612 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3125  ApbE family lipoprotein  63.01 
 
 
325 aa  403  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.779525  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3494  ApbE family lipoprotein  62.58 
 
 
323 aa  397  1e-109  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.960386  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2350  ApbE family lipoprotein  58.57 
 
 
323 aa  380  1e-104  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2624  ApbE family lipoprotein  57.45 
 
 
323 aa  370  1e-101  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.53738  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2491  ApbE family protein  43.41 
 
 
342 aa  261  8e-69  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0264  ApbE family lipoprotein  43.28 
 
 
320 aa  244  1e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.398879  normal  0.351019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  43.71 
 
 
345 aa  241  9e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0788  thiamine biosynthesis lipoprotein  45.19 
 
 
297 aa  238  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1081  ApbE family protein  40.39 
 
 
312 aa  236  5e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0283392  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05540  hypothetical protein  42.37 
 
 
323 aa  232  6e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0414  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  43.24 
 
 
325 aa  227  2e-58  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0146647  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1746  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  45.28 
 
 
308 aa  226  6e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  7.75168e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  39.46 
 
 
348 aa  213  4e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2382  ApbE family protein  39.86 
 
 
305 aa  212  7e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  39.32 
 
 
381 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  4.31252e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0092  ApbE family lipoprotein  42.96 
 
 
308 aa  209  5e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0025456  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  36.31 
 
 
360 aa  203  4e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  36.33 
 
 
380 aa  202  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.52679e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1217  membrane-associated lipoprotein for thiamine biosynthesis  35.46 
 
 
361 aa  201  1e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000151125  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1601  thiamine biosynthesis membrane-associated lipoprotein  34.06 
 
 
358 aa  195  8e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  33.87 
 
 
366 aa  193  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  34.53 
 
 
350 aa  184  1e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2215  ApbE family lipoprotein  32.04 
 
 
330 aa  178  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0332053  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.94 
 
 
363 aa  177  3e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  38.46 
 
 
371 aa  177  3e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0510  ApbE family lipoprotein  31.33 
 
 
353 aa  167  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00242012  hitchhiker  3.24218e-10 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  34.42 
 
 
343 aa  165  7e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  36.54 
 
 
386 aa  160  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21260  thiamine biosynthesis lipoprotein  37.11 
 
 
306 aa  158  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  33.11 
 
 
328 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  34.28 
 
 
308 aa  153  3e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  1.98345e-05  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3758  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 
316 aa  153  4e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.390614  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  35.96 
 
 
379 aa  152  6e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  34.55 
 
 
351 aa  150  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0976  ApbE family lipoprotein  32.25 
 
 
346 aa  150  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.402435  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2654  ApbE family lipoprotein  33 
 
 
326 aa  148  1e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.131589 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1117  ApbE family lipoprotein  31.41 
 
 
350 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  33.67 
 
 
308 aa  145  9e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5765  ApbE family lipoprotein  34.78 
 
 
315 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.734986 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  33.56 
 
 
317 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
339 aa  143  4e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  32.68 
 
 
338 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  32.65 
 
 
336 aa  142  9e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.56 
 
 
335 aa  141  1e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  31.37 
 
 
339 aa  139  6e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21060  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.22 
 
 
320 aa  138  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  32.07 
 
 
369 aa  138  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1338  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 
339 aa  137  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.337899  unclonable  1.41849e-06 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  31.79 
 
 
336 aa  137  2e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.325217 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00140  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.04 
 
 
313 aa  137  2e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.594186 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  32.54 
 
 
336 aa  135  7e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  29.43 
 
 
355 aa  135  1e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4919  membrane-associated ApbE-like lipoprotein  32.94 
 
 
340 aa  135  1e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0104223 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4467  ApbE family lipoprotein  30.61 
 
 
309 aa  133  4e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1142  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 
362 aa  132  9e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0809507  normal  0.548232 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1063  ApbE family lipoprotein  35.32 
 
 
362 aa  131  2e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_05200  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.33 
 
 
332 aa  130  2e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.666118  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  30.97 
 
 
350 aa  130  4e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  34.13 
 
 
331 aa  129  5e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3767  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 
417 aa  127  2e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.301189  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4169  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 
346 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1575  ApbE-like lipoprotein  33.08 
 
 
350 aa  127  2e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.121916  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1244  ApbE family lipoprotein  32.26 
 
 
348 aa  127  2e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.462864  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2563  ApbE family lipoprotein  29.18 
 
 
329 aa  127  2e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  28.81 
 
 
349 aa  127  2e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4057  ApbE family lipoprotein  31.56 
 
 
346 aa  127  2e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.807087  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1366  thiamine biosynthesis APBE transmembrane protein  34.32 
 
 
340 aa  125  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  38.5 
 
 
349 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  37.56 
 
 
349 aa  122  9e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  30.07 
 
 
336 aa  121  2e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  29.89 
 
 
349 aa  120  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3196  ApbE-like lipoprotein  32.89 
 
 
344 aa  120  3e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.764413  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3497  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  29.57 
 
 
349 aa  120  5e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.891995  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  33.33 
 
 
345 aa  119  9e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0129  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  31.3 
 
 
361 aa  118  1e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.791974  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2794  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.5 
 
 
351 aa  118  2e-25  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279837  normal  0.884521 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1160  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.14 
 
 
337 aa  118  2e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.483438  normal  0.262417 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0353  ApbE family lipoprotein  33.59 
 
 
350 aa  118  2e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.315811  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  27.24 
 
 
367 aa  117  2e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1278  ApbE family lipoprotein  29.44 
 
 
389 aa  117  3e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0725  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.52 
 
 
351 aa  116  4e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0827027  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3352  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 
351 aa  115  9e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0822228  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02141  predicted thiamine biosynthesis lipoprotein  27.13 
 
 
351 aa  115  9e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.912657  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2513  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 
351 aa  115  9e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00204686  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1444  ApbE family lipoprotein  27.13 
 
 
351 aa  115  9e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.116267  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02100  hypothetical protein  27.13 
 
 
351 aa  115  9e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.873608  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3371  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  28.16 
 
 
353 aa  115  9e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.891248  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  28.36 
 
 
359 aa  115  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1436  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 
351 aa  115  1e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.208237 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  28.36 
 
 
345 aa  115  1e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  28.36 
 
 
331 aa  115  1e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  3.84441e-06 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2353  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  27.13 
 
 
351 aa  114  2e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.180218  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2363  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  26.74 
 
 
351 aa  114  3e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.643512  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0988  ApbE-like lipoprotein  26.89 
 
 
370 aa  113  4e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.51305e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  31.75 
 
 
306 aa  113  5e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002713  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  29.41 
 
 
334 aa  112  7e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1225  ApbE-like lipoprotein  32.43 
 
 
322 aa  112  9e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.65797  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2093  ApbE family lipoprotein  27.98 
 
 
333 aa  112  1e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.11656e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2232  ApbE family lipoprotein  28.96 
 
 
341 aa  111  2e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>