196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_0523 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  100 
 
 
240 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  57.45 
 
 
241 aa  276  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  7.64296e-06 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.40548e-10  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  4.48955e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.9366e-15  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  58.74 
 
 
241 aa  274  1e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4907  transcriptional regulator, LuxR family  58.3 
 
 
244 aa  272  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  1.744e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  57.02 
 
 
241 aa  272  4e-72  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  65 
 
 
140 aa  178  6e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.94 
 
 
212 aa  57.8  1e-07  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  43.55 
 
 
212 aa  57.4  2e-07  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
226 aa  57  2e-07  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  54.55 
 
 
213 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  34.04 
 
 
215 aa  55.5  8e-07  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  3.2992e-05  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
229 aa  54.7  1e-06  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  48.28 
 
 
213 aa  54.7  1e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  43.48 
 
 
220 aa  54.3  2e-06  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  27.36 
 
 
220 aa  53.5  3e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
213 aa  53.5  3e-06  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  28.72 
 
 
223 aa  53.1  4e-06  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  43.33 
 
 
235 aa  52.8  5e-06  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  2.01971e-10 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  40.91 
 
 
208 aa  52.8  5e-06  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  47.37 
 
 
234 aa  52  7e-06  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  47.37 
 
 
265 aa  52.4  7e-06  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
218 aa  52  8e-06  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  27.14 
 
 
220 aa  51.6  1e-05  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 
217 aa  51.2  1e-05  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 
234 aa  51.6  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
229 aa  51.2  1e-05  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  6.74126e-11 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
203 aa  50.4  2e-05  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  26.6 
 
 
219 aa  51.2  2e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
224 aa  50.4  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
215 aa  50.8  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  42.37 
 
 
215 aa  50.8  2e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 
212 aa  50.8  2e-05  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
225 aa  50.8  2e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  41.67 
 
 
229 aa  51.2  2e-05  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  26.59 
 
 
220 aa  50.4  3e-05  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
215 aa  50.1  4e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
213 aa  49.7  4e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  27.14 
 
 
215 aa  49.7  4e-05  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  40 
 
 
216 aa  49.7  5e-05  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  40 
 
 
216 aa  49.3  5e-05  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  25.68 
 
 
238 aa  49.3  5e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  1.02566e-06 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
231 aa  48.9  7e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
215 aa  48.9  7e-05  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.82 
 
 
212 aa  48.9  7e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
236 aa  48.5  8e-05  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.24 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
217 aa  48.5  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
225 aa  48.5  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
207 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  3.89797e-05  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  26.01 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.16 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 
222 aa  47.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  6.00529e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  40.32 
 
 
213 aa  47.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  40.3 
 
 
217 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  40.3 
 
 
217 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
228 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.98144e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  6.25449e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  2.59515e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5557  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.496641  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.58 
 
 
222 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.83918e-07  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  40.3 
 
 
217 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  2.82288e-05  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  40.35 
 
 
216 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
224 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 
214 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  31.4 
 
 
215 aa  46.2  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.93 
 
 
215 aa  46.2  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
223 aa  45.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  1.70982e-05 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.01 
 
 
231 aa  45.4  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1382  two component LuxR family transcriptional regulator  28.99 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  35 
 
 
213 aa  45.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4067  two component LuxR family transcriptional regulator  26.63 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  35.14 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0213  LuxR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00305368 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
196 aa  44.7  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
223 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>