139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A1861 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 196 aa  392  1e-108  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.57 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  47.06 
 
 		 216 aa  54.7  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  56.6 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  56.6 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  56.6 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  56.6 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.9  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  45.59 
 
 		 218 aa  53.9  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  47.06 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  47.06 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  47.06 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  47.17 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  47.17 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  45.59 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3400  response regulator receiver protein  50 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 228 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  51.92 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  45.59 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  28.44 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 232 aa  51.6  0.000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.28 
 
 		 232 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 224 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  42.19 
 
 		 214 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 223 aa  50.8  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  45.61 
 
 		 219 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  47.46 
 
 		 208 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  51.85 
 
 		 265 aa  50.4  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  51.85 
 
 		 234 aa  50.4  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2879  LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 231 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 238 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 215 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  31.13 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  49.02 
 
 		 213 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 246 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  52.94 
 
 		 226 aa  48.5  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 219 aa  48.1  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0605  fimbriae W protein  21.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  23.16 
 
 		 215 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0598  fimbriae W protein  21.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245048 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0599  fimbriae W protein  21.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.211944  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 213 aa  48.1  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0663  fimbriae W protein  21.57 
 
 		 198 aa  48.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000019366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140548  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  0.00000764296 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 241 aa  48.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.63 
 
 		 214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 234 aa  47.4  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  47.06 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 140 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  40.62 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0030  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 229 aa  46.6  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 241 aa  47  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2055  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.86 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3543  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4824  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4907  transcriptional regulator, LuxR family  43.14 
 
 		 244 aa  46.2  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000001744  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 215 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  50.94 
 
 		 225 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4886  putative GerE family regulatory protein  38.6 
 
 		 116 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00651447 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1286  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.172682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  44.23 
 
 		 225 aa  45.4  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 241 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  43.14 
 
 		 240 aa  44.7  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  45.28 
 
 		 219 aa  43.9  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 232 aa  44.3  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.07 
 
 		 211 aa  44.3  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0530  two component LuxR family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 211 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0685  capsular synthesis regulator component B  43.55 
 
 		 210 aa  43.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.394747  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>