186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4955 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 
241 aa  495  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  98.76 
 
 
241 aa  489  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000448955  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  0.00000764296 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000019366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140548  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  65.71 
 
 
241 aa  330  1e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4907  transcriptional regulator, LuxR family  65.02 
 
 
244 aa  325  6e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000001744  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  99.29 
 
 
140 aa  281  7.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  57.45 
 
 
240 aa  276  2e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  31.9 
 
 
226 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  34.91 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  35.45 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  35.45 
 
 
220 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  27 
 
 
220 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  25.49 
 
 
220 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  25.86 
 
 
219 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  46.97 
 
 
213 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4070  two component LuxR family transcriptional regulator  24.51 
 
 
229 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  44.12 
 
 
213 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.4 
 
 
234 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.67 
 
 
212 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  42.11 
 
 
212 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  48.15 
 
 
215 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 
208 aa  55.1  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  27.5 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  26.14 
 
 
207 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.11 
 
 
214 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 
217 aa  53.5  0.000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3105  two component transcriptional regulator, LuxR family  25 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  24.86 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  44.44 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3667  two component LuxR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
215 aa  52.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.849529  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
203 aa  51.2  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.59 
 
 
208 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
213 aa  50.8  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3986  two component LuxR family transcriptional regulator  44.83 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.039666 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2579  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.15 
 
 
352 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0445779 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
235 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  40 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
218 aa  50.1  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1895  two component transcriptional regulator, LuxR family  27.98 
 
 
213 aa  50.4  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
229 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2674  two component LuxR family transcriptional regulator  24.89 
 
 
215 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.721789  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 
236 aa  49.7  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  28.44 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  25.74 
 
 
231 aa  49.7  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  47.17 
 
 
265 aa  49.3  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  47.17 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 
222 aa  48.9  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6653  two component LuxR family transcriptional regulator  47.17 
 
 
238 aa  48.5  0.00008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.879715  hitchhiker  0.00000102566 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
215 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4229  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00851836  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4235  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3779  two component LuxR family transcriptional regulator  29.52 
 
 
234 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0265405 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  30.28 
 
 
224 aa  48.1  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  25.15 
 
 
230 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0880  two component LuxR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
232 aa  47.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.398373 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3939  two component transcriptional regulator  29.46 
 
 
300 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.555587 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1595  two component transcriptional regulator, LuxR family  24.4 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.356259  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  25.15 
 
 
230 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3400  response regulator receiver protein  36.9 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4886  putative GerE family regulatory protein  49.02 
 
 
116 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00651447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  28.44 
 
 
214 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
196 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  30.07 
 
 
215 aa  47  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  20.93 
 
 
233 aa  46.6  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  37.7 
 
 
216 aa  46.6  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4205  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
225 aa  46.6  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.712025  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4728  two component LuxR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
225 aa  47  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.825096  normal  0.434564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  30.07 
 
 
215 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 
208 aa  46.6  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  37.7 
 
 
216 aa  46.6  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  30.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  30.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  30.77 
 
 
215 aa  46.6  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.98 
 
 
212 aa  46.6  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2202  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.43 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  35.56 
 
 
223 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3229  LuxR family DNA-binding response regulator  23.96 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1129  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 
231 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  30.93 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  30.93 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  30.93 
 
 
210 aa  46.2  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  42.59 
 
 
231 aa  45.8  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.34 
 
 
215 aa  45.8  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  38.89 
 
 
230 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  38.03 
 
 
221 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.23 
 
 
212 aa  45.4  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>