206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_4679 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_4679  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 203 aa  425  1e-118  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3033  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.011043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1861  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.419693  normal  0.0598663 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2960  LuxR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 196 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.917749  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.8 
 
 		 212 aa  52.4  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0598  fimbriae W protein  27.85 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0663  fimbriae W protein  27.85 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.839853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0605  fimbriae W protein  27.85 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.579681  normal  0.099042 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0599  fimbriae W protein  27.85 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.211944  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4868  transcriptional regulator, LuxR family  45.45 
 
 		 140 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.221718  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4955  LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4903  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.650668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2153  two component LuxR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 213 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.848776  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0523  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 240 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.335975  decreased coverage  0.00189861 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04242  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00962372  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3632  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000755622  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5878  transcriptional regulator, LuxR family  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0180524  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04208  hypothetical protein  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0122864  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4911  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000448955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3690  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0223527  decreased coverage  0.00000764296 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  50.91 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4598  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000019366  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4959  LuxR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 241 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140548  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4627  two component LuxR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.527017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 213 aa  49.3  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4150  LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 229 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.836637  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1034  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.315998  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2225  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2022  DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2078  LuxR family DNA-binding response regulator  41.1 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 231 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0601  fimbriae W protein  26.58 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.477015  normal  0.0547035 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4907  transcriptional regulator, LuxR family  39.06 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000001744  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6659  two component LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000389797  hitchhiker  0.000384101 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3041  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000032992  normal  0.146168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1921  response regulator receiver protein  28.28 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.287441  normal  0.0849999 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0524  DNA-binding transcriptional activator BglJ  46.43 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.441884  decreased coverage  0.00182445 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0356  two component LuxR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 223 aa  47  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0735  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.06 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1954  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.85 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.228638  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1950  hypothetical protein  48.94 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0094858 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1504  hypothetical protein  48.94 
 
 		 212 aa  45.4  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000918459 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3945  putative DNA-binding response regulator EsrB  39.44 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0480381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0042  nitrate/nitrite response regulator protein  44.9 
 
 		 209 aa  45.4  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59770  putative two component response regulator  45.61 
 
 		 231 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000114482  hitchhiker  1.6476100000000001e-18 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1780  EsrB  48.94 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.111024  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3919  two component LuxR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1526  two-component response regulator EsrB  48.94 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  hitchhiker  0.00169027 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3833  putative DNA-binding response regulator EsrB  39.44 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1489  EsrB  48.94 
 
 		 212 aa  45.8  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.121116  normal  0.320198 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5217  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  45.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4069  two component LuxR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 225 aa  45.1  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  49.02 
 
 		 241 aa  45.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  45.1 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3018  LuxR family DNA-binding response regulator  45.61 
 
 		 221 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.214987  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0700  two component transcriptional regulator, LuxR family  30.68 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00980919  normal  0.316207 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 224 aa  45.1  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4709  putative GerE family regulatory protein  37.29 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.215076  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 229 aa  44.7  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4660  putative GerE family regulatory protein  37.29 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.943162  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4660  putative GerE family regulatory protein  37.29 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4575  putative GerE family regulatory protein  37.29 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  44.64 
 
 		 220 aa  45.1  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3400  response regulator receiver protein  42.59 
 
 		 204 aa  45.1  0.0008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4569  putative GerE family regulatory protein  37.29 
 
 		 90 aa  45.1  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0855442  normal  0.34039 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04243  DNA-binding transcriptional activator  36.05 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0432345  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 246 aa  44.7  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04209  hypothetical protein  36.05 
 
 		 207 aa  44.7  0.0009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0565957  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 218 aa  44.7  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3689  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.05 
 
 		 207 aa  44.7  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.256974  decreased coverage  0.00000689885 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3631  transcriptional regulator, LuxR family  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00452114  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  45.1 
 
 		 220 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4912  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000035455  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2835  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.803464  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 223 aa  43.9  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0190  transcription regulator  46.03 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5879  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0356322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 235 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1949  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.59 
 
 		 208 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0319702  normal  0.0827208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4599  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000141662  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4960  DNA-binding transcriptional activator BglJ  36.05 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000013279  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2103  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 210 aa  43.9  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  38.36 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0143  transcription regulator  46.03 
 
 		 265 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  41.18 
 
 		 230 aa  43.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  35.23 
 
 		 210 aa  43.9  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30580  LuxR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 268 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.706127 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3183  response regulator receiver protein  37.93 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  42.11 
 
 		 220 aa  43.5  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2504  two component LuxR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 218 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00866313  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.61 
 
 		 214 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>