More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4692 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4692  two component LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 223 aa  454  1e-127  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00363591  hitchhiker  0.0000170982 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4699  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 246 aa  167  8e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.372391  hitchhiker  0.00465492 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0289  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.71 
 
 		 212 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4444  capsular synthesis regulator component B, putative  40 
 
 		 212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1621  capsular synthesis response regulator transcription regulator protein  40.85 
 
 		 219 aa  144  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.848219 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0155  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 212 aa  138  6e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2872  two component LuxR family transcriptional regulator  41.04 
 
 		 235 aa  137  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.891055  hitchhiker  0.000000000201971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4965  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 214 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.122556 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3677  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.62 
 
 		 229 aa  135  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0102182  hitchhiker  0.0000000000674126 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0280  two component LuxR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 229 aa  132  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188137 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5845  LuxR response regulator receiver  39.15 
 
 		 214 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0170  capsular synthesis regulator component B  39.25 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.443347  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1634  DNA-binding response regulator  39.25 
 
 		 230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.723228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0258  LuxR response regulator receiver  39.27 
 
 		 230 aa  128  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752946  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3938  two component LuxR family transcriptional regulator  38.05 
 
 		 218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.189042  normal  0.262256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4225  two component LuxR family transcriptional regulator  38.43 
 
 		 241 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.107538  normal  0.322545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0198  DNA-binding response regulator  38.01 
 
 		 230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292201  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1294  LuxR response regulator receiver  36.82 
 
 		 220 aa  125  8.000000000000001e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11120  putative response regulator  38.57 
 
 		 214 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16350  putative two-component response regulator  37.96 
 
 		 213 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0187  LuxR response regulator receiver  36.41 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1630  DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 220 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0322132  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1693  LuxR response regulator receiver  36.84 
 
 		 214 aa  121  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.478316  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0161  LuxR family DNA-binding response regulator  35.29 
 
 		 220 aa  121  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4516  two component LuxR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 214 aa  121  9e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0463384  normal  0.0270495 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4224  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 231 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322534  normal  0.434129 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3209  transcriptional regulator RcsB  36.82 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2843  transcriptional regulator RcsB  38 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1307  transcriptional regulator RcsB  38 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0162714  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2764  transcriptional regulator RcsB  38 
 
 		 217 aa  119  3e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408225  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1107  transcriptional regulator RcsB  36.82 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3042  two component LuxR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.280021 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0142  DNA-binding response regulator  35.44 
 
 		 220 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3267  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00059602  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1041  transcriptional regulator RcsB  37 
 
 		 218 aa  118  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.140172  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4702  two component LuxR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 213 aa  118  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121015 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3017  transcriptional regulator RcsB  36.82 
 
 		 216 aa  118  9e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0790  two component LuxR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 214 aa  117  9.999999999999999e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.870503  normal  0.997505 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1421  putative two-component response regulator  35.51 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3071  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3417  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.8 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.901274  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3010  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3357  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.32 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3752  two component LuxR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 215 aa  116  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6235  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.62 
 
 		 210 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.612124 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5126  two component LuxR family transcriptional regulator  38.86 
 
 		 209 aa  116  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.135043  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07840  putative two-component response regulator  38.57 
 
 		 210 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0171986 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1441  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000259515  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2797  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000000283918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2366  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000282288  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2510  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.731723  normal  0.0675268 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2614  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.588596 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2496  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.424983  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1433  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0102563  hitchhiker  0.00285537 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4641  two component LuxR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.169112  normal  0.068024 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2406  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000625449  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3357  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000561339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0721  transcriptional regulator RcsB  37 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000245188  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2357  transcriptional regulator RcsB  37 
 
 		 228 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000398144  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5152  two component LuxR family transcriptional regulator  35.27 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.535465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2517  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000600529  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2455  transcriptional regulator RcsB  36.63 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427332  normal  0.0831575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0745  putative two-component response regulator  38.1 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3747  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.48 
 
 		 221 aa  113  3e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5717  two component LuxR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.873964  hitchhiker  0.00405289 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0355  two component LuxR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 236 aa  112  5e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6665  two component LuxR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 225 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0397086  normal  0.0268041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4004  two component LuxR family transcriptional regulator  39.05 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4296  two component LuxR family transcriptional regulator  35.55 
 
 		 214 aa  112  6e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.891496  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1021  putative response regulator  37.68 
 
 		 214 aa  112  7.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0630  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.14 
 
 		 234 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.210211 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2880  two component LuxR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 224 aa  111  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345086  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0560  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.91 
 
 		 209 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3287  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.404787 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0354  two component LuxR family transcriptional regulator  38.73 
 
 		 217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3619  LuxR response regulator receiver  34.7 
 
 		 219 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0631  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.04 
 
 		 214 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.151672 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1168  LuxR family transcriptional regulator  32.7 
 
 		 216 aa  110  2.0000000000000002e-23  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0828  response regulator  32.7 
 
 		 216 aa  109  3e-23  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0183204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3936  two component LuxR family transcriptional regulator  32.44 
 
 		 231 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426907  normal  0.200888 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3273  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.02 
 
 		 215 aa  109  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3078  response regulator transcription regulator protein  35.35 
 
 		 222 aa  108  5e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0498276  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1484  DNA-binding response regulator, LuxR family  37.32 
 
 		 208 aa  108  5e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3459  two component LuxR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.141427  normal  0.865068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3595  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.24 
 
 		 215 aa  108  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3388  two-component response regulator transcription regulator protein  35.78 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0201761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6558  two component LuxR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.458284 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2674  DNA-binding response regulator  36.97 
 
 		 210 aa  107  1e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0283  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.59 
 
 		 208 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.393471  normal  0.0532877 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3081  two component LuxR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 217 aa  107  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.450994  normal  0.856151 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4618  LuxR response regulator receiver  36.67 
 
 		 209 aa  107  2e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.601025 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0029  two component LuxR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 214 aa  107  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.317943  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5459  two component LuxR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.953036  normal  0.183697 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1618  DNA-binding response regulator  34.29 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2172  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.29 
 
 		 210 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2562  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0171044  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1782  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0381154  hitchhiker  0.0000000750596 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2677  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0738952  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2600  response regulator  33.5 
 
 		 214 aa  105  6e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000388579  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0709  two component LuxR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 224 aa  105  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.421893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>