More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1399 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_1399  preprotein translocase, SecY subunit  100 
 
 
446 aa  901    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1575  preprotein translocase subunit SecY  50 
 
 
435 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0569624  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2837  preprotein translocase subunit SecY  47.22 
 
 
435 aa  430  1e-119  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1086  preprotein translocase subunit SecY  48.5 
 
 
435 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.135642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0787  preprotein translocase subunit SecY  52.73 
 
 
442 aa  428  1e-118  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0142235  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0728  preprotein translocase, SecY subunit  48.27 
 
 
429 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00054251  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2756  preprotein translocase, SecY subunit  47.86 
 
 
443 aa  423  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.373135  normal  0.477854 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  49.17 
 
 
443 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  49.17 
 
 
443 aa  424  1e-117  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.91 
 
 
442 aa  422  1e-117  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0646  preprotein translocase subunit SecY  47.34 
 
 
435 aa  418  1e-116  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00379524  hitchhiker  0.000000811889 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0953  preprotein translocase subunit SecY  47.58 
 
 
435 aa  421  1e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0415377  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1366  preprotein translocase subunit SecY  47.48 
 
 
437 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000833152  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3308  preprotein translocase subunit SecY  47.58 
 
 
435 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000602472 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3318  preprotein translocase subunit SecY  49.88 
 
 
441 aa  416  9.999999999999999e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.150394  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0339  preprotein translocase subunit SecY  49.42 
 
 
440 aa  412  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000142446  unclonable  0.0000000706243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  48.51 
 
 
435 aa  413  1e-114  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1006  preprotein translocase subunit SecY  48.19 
 
 
446 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38875  hitchhiker  0.00669682 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 
437 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4778  preprotein translocase subunit SecY  47.4 
 
 
444 aa  408  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000420552 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0099  preprotein translocase subunit SecY  45.75 
 
 
437 aa  409  1e-113  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0986849 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1745  preprotein translocase subunit SecY  45.68 
 
 
437 aa  411  1e-113  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261464  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2038  preprotein translocase subunit SecY  48.34 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1953  preprotein translocase subunit SecY  48.58 
 
 
447 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0700  preprotein translocase subunit SecY  47.6 
 
 
435 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.418561  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1976  preprotein translocase subunit SecY  46.42 
 
 
446 aa  402  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.923807  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  49.29 
 
 
434 aa  403  1e-111  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2305  preprotein translocase subunit SecY  48.11 
 
 
453 aa  404  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0325321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1926  preprotein translocase subunit SecY  48.1 
 
 
447 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.228643  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  46.62 
 
 
445 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_004310  BR1213  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 
446 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  49.41 
 
 
443 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5050  preprotein translocase subunit SecY  45.6 
 
 
444 aa  398  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.478224  normal  0.981585 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1176  preprotein translocase subunit SecY  46.19 
 
 
446 aa  399  9.999999999999999e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0379017  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0680  preprotein translocase subunit SecY  44.27 
 
 
437 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0299  preprotein translocase subunit SecY  49.2 
 
 
440 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000631755  hitchhiker  0.00000321163 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3929  preprotein translocase subunit SecY  49.63 
 
 
436 aa  401  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1863  preprotein translocase subunit SecY  45.93 
 
 
446 aa  397  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.271597  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1928  preprotein translocase, SecY subunit  46.61 
 
 
445 aa  395  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1384  preprotein translocase subunit SecY  45.35 
 
 
443 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.378018 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3423  preprotein translocase subunit SecY  48.03 
 
 
436 aa  396  1e-109  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.23916 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  48.82 
 
 
439 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0333  preprotein translocase, SecY subunit  46.15 
 
 
445 aa  398  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.110878  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2352  preprotein translocase subunit SecY  48.69 
 
 
441 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299181  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 
421 aa  394  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2668  preprotein translocase subunit SecY  47.52 
 
 
447 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  46.96 
 
 
420 aa  392  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0073  preprotein translocase, SecY subunit  49.18 
 
 
445 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.867918  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1450  preprotein translocase subunit SecY  46.15 
 
 
446 aa  394  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.337945  normal  0.16685 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
448 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2045  preprotein translocase, SecY subunit  47.93 
 
 
435 aa  393  1e-108  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000027617  hitchhiker  0.00154147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  48.46 
 
 
446 aa  393  1e-108  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3647  preprotein translocase subunit SecY  45.8 
 
 
443 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  44.8 
 
 
448 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  48.69 
 
 
446 aa  394  1e-108  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0776  preprotein translocase subunit SecY  45.45 
 
 
455 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.495487  normal  0.028717 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1352  preprotein translocase subunit SecY  46.83 
 
 
446 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.0023208  normal  0.481629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1565  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 
443 aa  391  1e-107  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.112443  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04500  preprotein translocase subunit SecY  45.05 
 
 
454 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.705639  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4036  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000184742  unclonable  0.00000000000435138 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0216  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000065492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
446 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  388  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0220  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000798254  hitchhiker  0.00367272 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2237  preprotein translocase subunit SecY  45.58 
 
 
437 aa  386  1e-106  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.104557  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  388  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2315  preprotein translocase subunit SecY  45.15 
 
 
443 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.775008  normal  0.296135 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  47.78 
 
 
436 aa  387  1e-106  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3428  preprotein translocase subunit SecY  45.12 
 
 
443 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.452831  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0441  preprotein translocase subunit SecY  48.23 
 
 
443 aa  387  1e-106  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 
419 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
439 aa  388  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0219  preprotein translocase subunit SecY  47.98 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000744124  unclonable  0.0000000000304117 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0214  preprotein translocase subunit SecY  47.98 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000092283  hitchhiker  0.00772115 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4150  preprotein translocase subunit SecY  48.22 
 
 
446 aa  385  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000158721  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  47.98 
 
 
446 aa  386  1e-106  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  47.29 
 
 
439 aa  388  1e-106  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  46.33 
 
 
448 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0251  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
446 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  47.27 
 
 
442 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  47.17 
 
 
444 aa  382  1e-105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  47.41 
 
 
444 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5050  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
437 aa  384  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.34117  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3164  preprotein translocase subunit SecY  44.9 
 
 
443 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0194839  normal  0.509442 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0204  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
446 aa  384  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000662692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  46.26 
 
 
418 aa  383  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  46.31 
 
 
439 aa  383  1e-105  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
441 aa  382  1e-105  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  46.74 
 
 
424 aa  383  1e-105  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0357  preprotein translocase subunit SecY  47.27 
 
 
442 aa  384  1e-105  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000838517  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  46.68 
 
 
439 aa  385  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2144  preprotein translocase, SecY subunit  45.64 
 
 
447 aa  380  1e-104  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2999  preprotein translocase subunit SecY  48.47 
 
 
448 aa  382  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0377089  normal  0.071315 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2154  preprotein translocase subunit SecY  46.7 
 
 
444 aa  380  1e-104  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000317062  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  44.19 
 
 
449 aa  380  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3159  preprotein translocase subunit SecY  48.17 
 
 
447 aa  379  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.453709  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3277  preprotein translocase subunit SecY  48.47 
 
 
440 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.821024  hitchhiker  0.000244814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2459  preprotein translocase, SecY subunit  45.64 
 
 
447 aa  380  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3739  preprotein translocase subunit SecY  47.74 
 
 
446 aa  381  1e-104  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000605107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>