More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_1177 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1177  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
448 aa  909  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.515065  normal  0.177083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22180  DNA repair nucleotidyltransferase/DNA polymerase  59.76 
 
 
432 aa  500  1e-140  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000141857  normal  0.0200421 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1670  DNA-directed DNA polymerase  45.95 
 
 
419 aa  355  8e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  9.99976e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2316  DNA-directed DNA polymerase  45.24 
 
 
411 aa  354  1e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2007  UMUC domain protein DNA-repair protein  45.37 
 
 
413 aa  351  2e-95  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.470929  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2083  DNA-directed DNA polymerase  46.53 
 
 
399 aa  347  2e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.968018  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0224  DNA-directed DNA polymerase  43.45 
 
 
413 aa  308  1e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2727  DNA-directed DNA polymerase  36.3 
 
 
400 aa  247  3e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0115509  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3921  DNA-directed DNA polymerase  36.96 
 
 
432 aa  244  2e-63  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.019973  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1154  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 
417 aa  244  2e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  5.7173e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1904  DNA-directed DNA polymerase  35.97 
 
 
411 aa  230  3e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1616  ImpB/MucB/SamB family protein  36.7 
 
 
409 aa  223  4e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2772  DNA polymerase IV  37.72 
 
 
395 aa  223  8e-57  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.317028  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1229  DNA polymerase IV  36.32 
 
 
400 aa  221  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000257934  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0282  DNA-directed DNA polymerase  36.12 
 
 
421 aa  219  8e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2492  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
409 aa  215  2e-54  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1132  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
408 aa  214  3e-54  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1070  DNA-directed DNA polymerase  35.97 
 
 
409 aa  213  4e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0370  DNA-directed DNA polymerase  35.66 
 
 
423 aa  213  4e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1756  UMUC domain protein DNA-repair protein  35.49 
 
 
409 aa  211  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000481583  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0190  DNA-directed DNA polymerase  34.21 
 
 
410 aa  210  3e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1574  DNA-directed DNA polymerase  36.69 
 
 
410 aa  208  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1441  UMUC-like DNA-repair protein  35.52 
 
 
407 aa  206  8e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0758  DNA polymerase IV  36.72 
 
 
395 aa  206  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0043  ImpB/MucB/SamB family protein  36.41 
 
 
413 aa  206  1e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1314  UMUC domain protein DNA-repair protein  31.84 
 
 
399 aa  204  4e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  1.31963e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2528  DNA polymerase IV  34.35 
 
 
414 aa  199  1e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0738  DNA-directed DNA polymerase  34.48 
 
 
425 aa  196  6e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.59258  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  38.67 
 
 
381 aa  196  9e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3983  DNA polymerase IV  31.8 
 
 
412 aa  195  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  35.69 
 
 
385 aa  193  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08990  DNA-directed DNA polymerase  35.19 
 
 
385 aa  192  8e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  35.79 
 
 
359 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  37.3 
 
 
363 aa  190  5e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  33.8 
 
 
371 aa  190  6e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1393  DNA-directed DNA polymerase  35.9 
 
 
410 aa  188  2e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0677634  normal  0.0363654 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4214  DNA polymerase IV  31.31 
 
 
412 aa  188  2e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000424274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4256  DNA polymerase IV  31.33 
 
 
412 aa  187  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0566938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0979  DNA polymerase IV  31.4 
 
 
412 aa  186  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5438  DNA polymerase IV  34.62 
 
 
407 aa  186  5e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151264  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3129  damage-inducible protein DinP  33.76 
 
 
399 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  36.87 
 
 
380 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  39.62 
 
 
363 aa  185  1e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  31.11 
 
 
389 aa  184  2e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3889  DNA polymerase IV  31.08 
 
 
412 aa  184  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  33.42 
 
 
359 aa  184  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4051  DNA polymerase IV  31.08 
 
 
412 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4366  DNA polymerase IV  31.08 
 
 
412 aa  184  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4166  DNA polymerase IV  31.08 
 
 
412 aa  184  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4788  DNA-directed DNA polymerase  35.97 
 
 
402 aa  184  3e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.182226  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  35.87 
 
 
371 aa  184  4e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4277  DNA polymerase IV  30.83 
 
 
412 aa  184  4e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.727972  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4549  DNA polymerase IV  36.55 
 
 
419 aa  183  4e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.849423  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  37.57 
 
 
378 aa  183  4e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3897  DNA polymerase IV  31.08 
 
 
412 aa  184  4e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 
409 aa  182  8e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1547  DNA-directed DNA polymerase  33.33 
 
 
425 aa  182  8e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.153092  normal  0.161564 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  32.67 
 
 
408 aa  182  9e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5784  DNA-directed DNA polymerase  36.3 
 
 
430 aa  182  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.108507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  36.68 
 
 
373 aa  182  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  38.87 
 
 
365 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5685  DNA polymerase IV  34.34 
 
 
424 aa  181  2e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00273553 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2840  DNA polymerase IV  31.36 
 
 
412 aa  181  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.527026  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  35.14 
 
 
359 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5059  DNA polymerase IV  34.38 
 
 
407 aa  180  5e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.315945  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5147  DNA polymerase IV  34.38 
 
 
407 aa  180  5e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1654  DNA polymerase IV  35.43 
 
 
407 aa  179  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.263851  normal  0.0394567 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_10  DNA polymerase IV (Y-family)  32.32 
 
 
391 aa  179  8e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 
359 aa  179  8e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1560  DNA-directed DNA polymerase  34.26 
 
 
408 aa  179  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  40.13 
 
 
375 aa  179  1e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  36.51 
 
 
354 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  36.16 
 
 
356 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  36.54 
 
 
359 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1362  DNA-directed DNA polymerase  30.87 
 
 
393 aa  177  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  35.62 
 
 
396 aa  176  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3857  DNA polymerase IV  33.58 
 
 
432 aa  176  7e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  36.39 
 
 
360 aa  176  9e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0579  DNA polymerase IV  32.07 
 
 
445 aa  175  1e-42  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2364  DNA-directed DNA polymerase  34.09 
 
 
409 aa  176  1e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.259486  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0144  DNA-directed DNA polymerase  32.69 
 
 
354 aa  174  2e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  34.23 
 
 
372 aa  174  2e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0615  DNA polymerase IV  32.07 
 
 
445 aa  174  2e-42  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  37.28 
 
 
357 aa  174  2e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  33.6 
 
 
360 aa  174  3e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5188  DNA polymerase IV  30.99 
 
 
425 aa  173  4e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.951102 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4721  DNA polymerase IV  31.86 
 
 
425 aa  173  5e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.469065 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3462  DNA-directed DNA polymerase  36.91 
 
 
419 aa  173  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5260  DNA polymerase IV  31.74 
 
 
415 aa  173  6e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5112  DNA-directed DNA polymerase  36.63 
 
 
420 aa  173  7e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.360047  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1767  DNA polymerase IV  35.13 
 
 
414 aa  172  7e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3236  DNA-directed DNA polymerase  36.41 
 
 
419 aa  172  8e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.516429  decreased coverage  0.00986036 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1122  DNA polymerase IV  34.31 
 
 
413 aa  172  8e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2940  DNA-directed DNA polymerase  36.34 
 
 
422 aa  172  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  3.25025e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0010  DNA-directed DNA polymerase  31.93 
 
 
390 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3681  DNA polymerase IV  32.14 
 
 
453 aa  171  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.96872  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  34.78 
 
 
369 aa  171  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  7.22148e-10  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3311  DNA polymerase IV  32.05 
 
 
432 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0786451  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2856  DNA-directed DNA polymerase  36.06 
 
 
406 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107741  normal  0.171619 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  36.93 
 
 
357 aa  171  3e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>