More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_3702 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3702  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3705  dihydrodipicolinate synthetase  59.53 
 
 		 305 aa  371  1e-102  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0168037  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3337  dihydrodipicolinate synthetase  59.01 
 
 		 302 aa  347  1e-94  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.426658  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0454  dihydrodipicolinate synthetase  60.36 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0330317 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3902  dihydrodipicolinate synthetase  42.28 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3733  dihydrodipicolinate synthetase  42.28 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3841  dihydrodipicolinate synthetase  42.28 
 
 		 301 aa  277  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.308055 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3799  dihydrodipicolinate synthetase  41.95 
 
 		 301 aa  275  8e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4382  dihydrodipicolinate synthetase  43.58 
 
 		 303 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0524626 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1265  dihydrodipicolinate synthetase  31.85 
 
 		 297 aa  186  4e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1666  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.458011  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  32.78 
 
 		 303 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0813  dihydrodipicolinate synthetase  30.42 
 
 		 302 aa  173  2.9999999999999996e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1908  dihydrodipicolinate synthase  33 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2005  dihydrodipicolinate synthase  34 
 
 		 301 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.672271  hitchhiker  0.000000182643 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2132  dihydrodipicolinate synthase  34 
 
 		 301 aa  162  6e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.769991  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1179  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000302619 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2113  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.296264  hitchhiker  0.00390104 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5982  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.700449  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2095  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 300 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1458  dihydrodipicolinate synthase  35.09 
 
 		 291 aa  160  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.370783  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0103  dihydrodipicolinate synthase  31.54 
 
 		 293 aa  159  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.148353  normal  0.278132 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 294 aa  159  4e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5401  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0312051  normal  0.474311 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0908  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 288 aa  159  5e-38  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1281  dihydrodipicolinate synthetase  31.56 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.168862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  29.97 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 300 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1224  dihydrodipicolinate synthase  29.93 
 
 		 292 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  28.62 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2565  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1678  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2699  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2619  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2180  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.632855  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1537  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3137  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1453  dihydrodipicolinate synthase  34.34 
 
 		 300 aa  155  6e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.242804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6292  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.454745 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5966  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 298 aa  155  6e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6951  dihydrodipicolinate synthase  35.34 
 
 		 298 aa  155  7e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.522277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  32.52 
 
 		 294 aa  155  7e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  36.07 
 
 		 291 aa  155  8e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  28.46 
 
 		 298 aa  154  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0941  dihydrodipicolinate synthase  33.44 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0386855  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0593  dihydrodipicolinate synthase  32.11 
 
 		 297 aa  154  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.147808 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2641  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 293 aa  154  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.553276  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 298 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0640  dihydrodipicolinate synthase  33.71 
 
 		 293 aa  153  4e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.997412  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1063  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.47 
 
 		 295 aa  153  4e-36  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.285874  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  32.86 
 
 		 298 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_004310  BR0646  dihydrodipicolinate synthase  31.1 
 
 		 293 aa  152  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1942  dihydrodipicolinate synthase  36.78 
 
 		 292 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 298 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  34.27 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0147  dihydrodipicolinate synthase  34.68 
 
 		 291 aa  150  2e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  28.09 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 289 aa  150  2e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1658  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1449  dihydrodipicolinate synthase  31.42 
 
 		 289 aa  150  3e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0410  dihydrodipicolinate synthase  33.78 
 
 		 292 aa  149  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.315899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0987  dihydrodipicolinate synthase  33.7 
 
 		 294 aa  149  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.13213 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 291 aa  149  7e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  34.15 
 
 		 294 aa  149  8e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  27.72 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3586  dihydrodipicolinate synthase  32.39 
 
 		 297 aa  149  8e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1098  dihydrodipicolinate synthase  39.33 
 
 		 296 aa  149  8e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.429598  normal  0.674716 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 289 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3342  dihydrodipicolinate synthase  32.89 
 
 		 292 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1083  dihydrodipicolinate synthase  32.96 
 
 		 294 aa  148  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0824572  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1613  dihydrodipicolinate synthase  31.38 
 
 		 296 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.390661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.85 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 292 aa  147  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 290 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  32.58 
 
 		 294 aa  147  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1548  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 292 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0406446  normal  0.0313891 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1104  dihydrodipicolinate synthase  32.12 
 
 		 319 aa  146  3e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 289 aa  146  3e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  27.34 
 
 		 298 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  34.66 
 
 		 292 aa  146  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0989  dihydrodipicolinate synthase  33.71 
 
 		 294 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.484172  normal  0.862392 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  34.39 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2640  dihydrodipicolinate synthase  33.1 
 
 		 293 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  34.04 
 
 		 290 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  34.12 
 
 		 326 aa  144  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0671  dihydrodipicolinate synthase  33.33 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.108128  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3953  dihydrodipicolinate synthase  31.67 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.121624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0962  dihydrodipicolinate synthase  31.56 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 292 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0843  dihydrodipicolinate synthase  36.6 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0686751  normal  0.56042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0987  dihydrodipicolinate synthase  36.6 
 
 		 290 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.193638  normal  0.417753 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1068  dihydrodipicolinate synthase  32 
 
 		 294 aa  144  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.740256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.06 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2563  dihydrodipicolinate synthase  34.08 
 
 		 293 aa  143  4e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.122823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1585  dihydrodipicolinate synthase  33.21 
 
 		 320 aa  143  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.758368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  30.98 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.77 
 
 		 297 aa  142  8e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>