More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2483 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  46.96 
 
 		 1174 aa  959    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  60.6 
 
 		 1089 aa  1343    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1127 aa  2253    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  68.2 
 
 		 1244 aa  1244    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  40.3 
 
 		 1032 aa  632  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  39.02 
 
 		 1050 aa  627  1e-178  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  36.92 
 
 		 1232 aa  604  1.0000000000000001e-171  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  38.7 
 
 		 1132 aa  560  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 1075 aa  534  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  57.08 
 
 		 1033 aa  525  1e-147  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  41.35 
 
 		 1062 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  59.72 
 
 		 1027 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  58.1 
 
 		 1078 aa  475  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  56.12 
 
 		 1089 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  57.31 
 
 		 1001 aa  462  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  56.07 
 
 		 1082 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  54.48 
 
 		 1161 aa  446  1.0000000000000001e-124  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  55.85 
 
 		 446 aa  441  9.999999999999999e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  53.21 
 
 		 428 aa  441  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  54.2 
 
 		 1156 aa  439  1e-121  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  49.52 
 
 		 414 aa  437  1e-121  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  54.28 
 
 		 1124 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  53.93 
 
 		 1067 aa  414  1e-114  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  50.6 
 
 		 408 aa  412  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  50.36 
 
 		 411 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  50.6 
 
 		 411 aa  379  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  40.43 
 
 		 414 aa  341  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  31.49 
 
 		 457 aa  205  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  31.52 
 
 		 706 aa  199  2.0000000000000003e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.54 
 
 		 817 aa  195  3e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  30.8 
 
 		 409 aa  194  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 785 aa  193  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  27.3 
 
 		 634 aa  184  9.000000000000001e-45  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  29.03 
 
 		 744 aa  179  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  32.67 
 
 		 372 aa  178  4e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 		 797 aa  174  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 653 aa  174  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 705 aa  174  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1056  ATP-dependent DNA helicase  24.66 
 
 		 687 aa  173  2e-41  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.73 
 
 		 741 aa  173  2e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1108  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.81 
 
 		 686 aa  172  2e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.43 
 
 		 685 aa  172  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  29.78 
 
 		 768 aa  172  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 730 aa  170  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0076  UvrD/REP helicase  29.31 
 
 		 732 aa  168  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00111848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  25.16 
 
 		 666 aa  167  8e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  30.02 
 
 		 798 aa  167  9e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  26.81 
 
 		 689 aa  166  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  30.62 
 
 		 712 aa  164  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.66 
 
 		 671 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  29.34 
 
 		 688 aa  163  2e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  25.59 
 
 		 638 aa  162  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.69 
 
 		 690 aa  162  4e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.27 
 
 		 729 aa  162  5e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.3 
 
 		 730 aa  161  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.3 
 
 		 730 aa  161  6e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3266  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.6 
 
 		 670 aa  160  1e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 671 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 715 aa  159  4e-37  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  28.79 
 
 		 682 aa  159  4e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13220  ATP-dependent DNA helicase II uvrD2  31.78 
 
 		 700 aa  158  7e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.529496 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.86 
 
 		 759 aa  157  7e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  28.95 
 
 		 659 aa  158  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.72 
 
 		 670 aa  157  8e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2475  UvrD/REP helicase  31.58 
 
 		 717 aa  157  1e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000259044 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.89 
 
 		 753 aa  156  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.43 
 
 		 743 aa  156  2e-36  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.44 
 
 		 736 aa  156  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19150  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.69 
 
 		 704 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0763962 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 764 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.19 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.19 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.86 
 
 		 674 aa  155  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 747 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  30.61 
 
 		 401 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2919  UvrD/REP helicase  24.73 
 
 		 621 aa  155  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 751 aa  155  4e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.89 
 
 		 753 aa  155  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 794 aa  154  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2753  UvrD/REP helicase  30.97 
 
 		 726 aa  154  1e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.08 
 
 		 747 aa  153  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  26.9 
 
 		 394 aa  153  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.36 
 
 		 770 aa  153  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.5 
 
 		 663 aa  152  2e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 725 aa  152  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2052  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 726 aa  151  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.322566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15060  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.47 
 
 		 709 aa  151  8e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2122  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 726 aa  150  9e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.370294  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  24.27 
 
 		 757 aa  150  1.0000000000000001e-34  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 742 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07530  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.73 
 
 		 694 aa  150  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.565866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3807  UvrD/REP helicase  29.57 
 
 		 708 aa  150  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00612818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  26.19 
 
 		 394 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 		 787 aa  147  9e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  25.96 
 
 		 393 aa  147  9e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 648 aa  147  1e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 648 aa  147  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>