49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7469 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  78.07 
 
 		 1089 aa  669    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  100 
 
 		 428 aa  857    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  69.39 
 
 		 1001 aa  620  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  65.5 
 
 		 1050 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  65.3 
 
 		 1156 aa  555  1e-157  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  65.78 
 
 		 1124 aa  554  1e-156  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  62.12 
 
 		 1032 aa  539  9.999999999999999e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  64.13 
 
 		 1062 aa  530  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  63.66 
 
 		 1067 aa  509  1e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  59.62 
 
 		 1161 aa  503  1e-141  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  58.99 
 
 		 1078 aa  486  1e-136  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  55.26 
 
 		 1132 aa  481  1e-135  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  57.35 
 
 		 1089 aa  474  1e-132  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  56.7 
 
 		 1075 aa  457  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  54.42 
 
 		 1033 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  56.24 
 
 		 446 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  53.68 
 
 		 1244 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  52.69 
 
 		 1232 aa  451  1e-125  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  51.07 
 
 		 414 aa  449  1e-125  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  51.7 
 
 		 408 aa  451  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  53.21 
 
 		 1127 aa  441  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  54.18 
 
 		 1082 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  51.98 
 
 		 1174 aa  427  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  51.57 
 
 		 1027 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  49.64 
 
 		 411 aa  397  1e-109  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  48.66 
 
 		 411 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  44.69 
 
 		 414 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  34.6 
 
 		 457 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  32.54 
 
 		 409 aa  212  7.999999999999999e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  34.42 
 
 		 401 aa  194  2e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  33.74 
 
 		 372 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  28.78 
 
 		 394 aa  164  3e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  31.73 
 
 		 373 aa  162  1e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  27.25 
 
 		 393 aa  160  5e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  27.82 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.3 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  28.77 
 
 		 380 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  23.85 
 
 		 424 aa  143  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  30.09 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  24.36 
 
 		 390 aa  102  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  26.89 
 
 		 392 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  27.38 
 
 		 392 aa  94.4  4e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  25 
 
 		 392 aa  90.9  4e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  24.42 
 
 		 397 aa  87.8  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  24.92 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  29.34 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.21 
 
 		 387 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  27.25 
 
 		 396 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  26.67 
 
 		 386 aa  76.6  0.0000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>