54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1125 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  100 
 
 		 380 aa  785    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  55.83 
 
 		 372 aa  425  1e-118  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  55.26 
 
 		 373 aa  427  1e-118  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  51.88 
 
 		 396 aa  391  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  44.33 
 
 		 457 aa  330  4e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  42.49 
 
 		 409 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  39.95 
 
 		 424 aa  290  3e-77  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  42.24 
 
 		 401 aa  281  1e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  40.53 
 
 		 394 aa  278  1e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  40.53 
 
 		 393 aa  276  3e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  40.48 
 
 		 394 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  40.74 
 
 		 394 aa  273  5.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  31.8 
 
 		 408 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.93 
 
 		 1089 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  29.16 
 
 		 1033 aa  160  5e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  29.38 
 
 		 414 aa  159  8e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  30.57 
 
 		 1075 aa  159  8e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  30.36 
 
 		 411 aa  158  1e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  30.75 
 
 		 1001 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  30.71 
 
 		 1078 aa  158  2e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 1089 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  31.33 
 
 		 411 aa  153  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  30.83 
 
 		 387 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  32.07 
 
 		 446 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 		 1244 aa  146  6e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 1161 aa  145  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  28.77 
 
 		 428 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  29.86 
 
 		 1062 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1127 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  28.37 
 
 		 1032 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1082 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 1132 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  28.91 
 
 		 1067 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  27.6 
 
 		 414 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 1027 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 		 1124 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  27.16 
 
 		 381 aa  126  6e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  28.64 
 
 		 1156 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  30.33 
 
 		 396 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 1232 aa  125  2e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  27.98 
 
 		 1050 aa  124  3e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  29.78 
 
 		 392 aa  124  4e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  27.83 
 
 		 390 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.4 
 
 		 1174 aa  119  7e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  27.5 
 
 		 392 aa  119  9.999999999999999e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  30.71 
 
 		 386 aa  116  5e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  27.29 
 
 		 397 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  27.46 
 
 		 392 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.58 
 
 		 387 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  26.89 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  25.59 
 
 		 251 aa  49.7  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  26.8 
 
 		 235 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0915  PHP domain protein  28.16 
 
 		 249 aa  44.7  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3796  phosphotransferase domain-containing protein  29.76 
 
 		 240 aa  43.5  0.006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>