49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0632 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  100 
 
 
414 aa  868    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  55.74 
 
 
1032 aa  490  1e-137  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  53.79 
 
 
1089 aa  475  1e-133  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  53.22 
 
 
1050 aa  464  1e-129  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  52.02 
 
 
1161 aa  461  1e-129  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  52.38 
 
 
1132 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  51.31 
 
 
1075 aa  455  1e-127  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  51.07 
 
 
428 aa  449  1e-125  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  51.54 
 
 
1001 aa  449  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  51.55 
 
 
1156 aa  448  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  51.19 
 
 
1078 aa  445  1.0000000000000001e-124  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  49.52 
 
 
1244 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  50 
 
 
1089 aa  436  1e-121  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  49.52 
 
 
1127 aa  436  1e-121  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  51.43 
 
 
1062 aa  436  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  49.88 
 
 
1124 aa  430  1e-119  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  52.39 
 
 
1082 aa  429  1e-119  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  51.18 
 
 
446 aa  428  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  50.95 
 
 
1067 aa  425  1e-118  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  51.72 
 
 
408 aa  424  1e-117  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  48.69 
 
 
1033 aa  423  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  49.19 
 
 
1174 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  50.97 
 
 
1027 aa  412  1e-114  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  46.07 
 
 
1232 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  45.85 
 
 
411 aa  382  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  44.39 
 
 
411 aa  378  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  44.61 
 
 
414 aa  355  5.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  33.25 
 
 
457 aa  212  1e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  32.52 
 
 
409 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  30.02 
 
 
401 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  30.75 
 
 
394 aa  170  5e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  30.34 
 
 
394 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  29.61 
 
 
393 aa  162  1e-38  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  29.78 
 
 
394 aa  161  2e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  31.41 
 
 
372 aa  159  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  28.77 
 
 
424 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  29.51 
 
 
373 aa  145  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  30.24 
 
 
396 aa  144  2e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  27.6 
 
 
380 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  27.97 
 
 
390 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  27.14 
 
 
381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  26.97 
 
 
392 aa  108  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  27.12 
 
 
392 aa  100  5e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  25.06 
 
 
397 aa  97.8  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  26.76 
 
 
386 aa  96.3  8e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  27.27 
 
 
396 aa  94.4  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  26.14 
 
 
387 aa  93.6  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  26.85 
 
 
392 aa  93.2  8e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.79 
 
 
387 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>