50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_1753 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  100 
 
 
386 aa  777    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  39.64 
 
 
390 aa  294  1e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  38.75 
 
 
397 aa  283  4.0000000000000003e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  38.5 
 
 
392 aa  280  4e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  40.05 
 
 
392 aa  274  2.0000000000000002e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  40.57 
 
 
387 aa  267  2e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  37.79 
 
 
392 aa  267  2e-70  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  40.87 
 
 
396 aa  253  3e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  38.34 
 
 
387 aa  227  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  34.1 
 
 
381 aa  219  6e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  33.09 
 
 
401 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  28.68 
 
 
393 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  29.37 
 
 
457 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  27.56 
 
 
409 aa  139  7e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  28.29 
 
 
394 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  28.54 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  28.5 
 
 
394 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  26.48 
 
 
424 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  30.71 
 
 
380 aa  116  6e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 
1033 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  28.61 
 
 
372 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  29.93 
 
 
373 aa  107  3e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  25.48 
 
 
414 aa  103  6e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  27.32 
 
 
411 aa  97.8  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  26.76 
 
 
414 aa  96.3  7e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 
1075 aa  95.1  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.25 
 
 
1089 aa  94.7  2e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  27.66 
 
 
411 aa  94  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  27.14 
 
 
1078 aa  94  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  32.82 
 
 
1232 aa  93.2  8e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.91 
 
 
1132 aa  91.3  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  27.47 
 
 
396 aa  90.5  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 
446 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  24.47 
 
 
408 aa  87.8  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  28 
 
 
1001 aa  85.5  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 
1062 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 
1244 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  33.59 
 
 
1124 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 
1027 aa  79.3  0.00000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  27.83 
 
 
1067 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  27.23 
 
 
1161 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  26.67 
 
 
428 aa  76.6  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 
1032 aa  76.3  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 
1089 aa  74.7  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 
1174 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  24.94 
 
 
1050 aa  72.4  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 
1127 aa  72  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 
1156 aa  69.7  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 
1082 aa  58.9  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0694  PHP domain protein  25.89 
 
 
259 aa  47  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>