51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GWCH70_2262 on replicon NC_012793
Organism: Geobacillus sp. WCH70



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  796    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  75.07 
 
 		 396 aa  596  1e-169  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  45.82 
 
 		 392 aa  333  4e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  45.55 
 
 		 392 aa  322  8e-87  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  44.22 
 
 		 390 aa  315  9.999999999999999e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  41.58 
 
 		 392 aa  296  4e-79  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  40.9 
 
 		 397 aa  294  2e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  40.57 
 
 		 386 aa  267  2e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  41.16 
 
 		 387 aa  261  1e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  34.88 
 
 		 381 aa  246  4e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  35.87 
 
 		 393 aa  196  7e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  35.65 
 
 		 424 aa  195  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  34.64 
 
 		 394 aa  178  1e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  33.42 
 
 		 457 aa  178  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  34.64 
 
 		 394 aa  177  4e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  34.64 
 
 		 394 aa  176  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  29.88 
 
 		 409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  32.02 
 
 		 401 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  30.83 
 
 		 380 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  31.07 
 
 		 1033 aa  135  9e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  35.96 
 
 		 373 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  30.96 
 
 		 372 aa  125  9e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  32.97 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.38 
 
 		 1089 aa  125  2e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  35.18 
 
 		 1232 aa  120  3.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 1027 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  28.47 
 
 		 411 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  28.54 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  27.56 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  28.57 
 
 		 1075 aa  112  8.000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  35.11 
 
 		 1161 aa  111  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  29.31 
 
 		 1078 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 1244 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  32.08 
 
 		 1032 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  33.23 
 
 		 1001 aa  108  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  27.58 
 
 		 408 aa  108  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.55 
 
 		 1089 aa  107  3e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 446 aa  105  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 1174 aa  104  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  28.1 
 
 		 1082 aa  103  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 		 1132 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 1127 aa  101  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  32.14 
 
 		 1050 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 1062 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  31.83 
 
 		 1124 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  26.14 
 
 		 414 aa  93.6  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  31.61 
 
 		 1067 aa  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  29.68 
 
 		 1156 aa  85.5  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  29.34 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  25.37 
 
 		 251 aa  54.3  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0694  PHP domain protein  26.26 
 
 		 259 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>