51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0363 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  810    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  75.07 
 
 		 387 aa  609  1e-173  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  44.9 
 
 		 392 aa  330  2e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  46.27 
 
 		 390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  45.76 
 
 		 392 aa  326  5e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  42.35 
 
 		 392 aa  303  5.000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  39.3 
 
 		 397 aa  292  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  40.87 
 
 		 386 aa  265  1e-69  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  41.49 
 
 		 387 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  32.38 
 
 		 381 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  32.3 
 
 		 424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  33.98 
 
 		 393 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  32.28 
 
 		 394 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  32.28 
 
 		 394 aa  162  9e-39  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  31.88 
 
 		 394 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  30.02 
 
 		 457 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  29.93 
 
 		 409 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  31.11 
 
 		 401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  31.08 
 
 		 380 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  30.19 
 
 		 372 aa  120  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  28.5 
 
 		 396 aa  117  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  29.81 
 
 		 411 aa  113  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  28.75 
 
 		 373 aa  113  6e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  30.29 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  33.44 
 
 		 1232 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  28.13 
 
 		 408 aa  109  7.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  30.33 
 
 		 1075 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  28.1 
 
 		 1033 aa  108  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  28.99 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  27.27 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.58 
 
 		 1089 aa  103  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 1027 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  30.39 
 
 		 1062 aa  100  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  30.14 
 
 		 1089 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  27.86 
 
 		 1050 aa  98.6  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  29.62 
 
 		 1032 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  28.61 
 
 		 1078 aa  97.1  5e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  28.3 
 
 		 1132 aa  96.7  6e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  29.11 
 
 		 1124 aa  95.9  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  29.36 
 
 		 1067 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  29 
 
 		 1244 aa  94.7  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  30.89 
 
 		 1161 aa  93.2  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  29.07 
 
 		 1001 aa  92  2e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 446 aa  90.5  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  28.83 
 
 		 1174 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  27.73 
 
 		 428 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  29.35 
 
 		 1156 aa  82.8  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 		 1082 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 1127 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0694  PHP domain protein  23.86 
 
 		 259 aa  53.5  0.000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  21.5 
 
 		 251 aa  43.1  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>