51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1948 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 		 396 aa  817    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  55.08 
 
 		 373 aa  434  1e-120  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  54.57 
 
 		 372 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  51.88 
 
 		 380 aa  391  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  44.82 
 
 		 457 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  43.38 
 
 		 409 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  40.63 
 
 		 394 aa  295  8e-79  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  40.11 
 
 		 394 aa  290  2e-77  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  39.31 
 
 		 393 aa  287  2e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  39.31 
 
 		 394 aa  286  5e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  38.07 
 
 		 424 aa  286  5e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  42.38 
 
 		 401 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  31.25 
 
 		 1078 aa  156  6e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  31.81 
 
 		 1075 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.5 
 
 		 1089 aa  152  7e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  30.27 
 
 		 408 aa  150  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  29.68 
 
 		 1082 aa  150  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  32.7 
 
 		 1032 aa  150  4e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  29.68 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  30.53 
 
 		 1127 aa  144  2e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  29.33 
 
 		 446 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  30.24 
 
 		 414 aa  144  2e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  31.5 
 
 		 1161 aa  143  4e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  29.68 
 
 		 411 aa  143  7e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  31.33 
 
 		 1089 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  30.09 
 
 		 428 aa  140  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 1033 aa  140  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  30.79 
 
 		 1001 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  28.5 
 
 		 414 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  29.09 
 
 		 1050 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 		 1124 aa  133  5e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 1244 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  29.76 
 
 		 1132 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  30.21 
 
 		 1062 aa  125  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  28.23 
 
 		 1027 aa  125  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  32.97 
 
 		 387 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  25.51 
 
 		 381 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  28.71 
 
 		 1156 aa  123  5e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  27.54 
 
 		 390 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  30.28 
 
 		 1067 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 1174 aa  113  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  28 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  31.95 
 
 		 1232 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  27.14 
 
 		 392 aa  109  9.000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  27.7 
 
 		 392 aa  97.8  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  27.16 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  27.47 
 
 		 386 aa  90.5  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  26.52 
 
 		 397 aa  90.1  6e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  32.02 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0344  GMP synthase  29.38 
 
 		 518 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  24.66 
 
 		 236 aa  43.5  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>