49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1399 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  100 
 
 
409 aa  854    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  70.92 
 
 
457 aa  596  1e-169  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  53.4 
 
 
401 aa  428  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  46.79 
 
 
394 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  45.88 
 
 
394 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  45.1 
 
 
394 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  43.56 
 
 
393 aa  329  6e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  41.31 
 
 
424 aa  319  7e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  42.49 
 
 
380 aa  313  4.999999999999999e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  43.38 
 
 
396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  43.05 
 
 
372 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  41.82 
 
 
373 aa  300  2e-80  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  34.7 
 
 
408 aa  226  5.0000000000000005e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  35.18 
 
 
1124 aa  219  5e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.87 
 
 
1089 aa  219  7e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  33.81 
 
 
1078 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  33.11 
 
 
1001 aa  214  1.9999999999999998e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  32.54 
 
 
428 aa  212  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  34.13 
 
 
1161 aa  211  3e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  35.15 
 
 
1032 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.81 
 
 
1089 aa  210  5e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  32.69 
 
 
1075 aa  210  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  34.38 
 
 
1050 aa  208  2e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  33.17 
 
 
414 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 
1156 aa  203  4e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 
446 aa  203  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  32.61 
 
 
411 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  32.13 
 
 
411 aa  202  6e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  32.85 
 
 
1033 aa  200  3e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  32.52 
 
 
414 aa  198  2.0000000000000003e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  30.8 
 
 
1127 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  31.45 
 
 
1062 aa  194  3e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  31.57 
 
 
1082 aa  194  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  31.38 
 
 
1067 aa  190  2.9999999999999997e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  30.66 
 
 
1232 aa  187  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  30.07 
 
 
1244 aa  177  4e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  31.16 
 
 
1027 aa  173  5e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  31.11 
 
 
390 aa  167  4e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 
1132 aa  166  8e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 
1174 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  29.68 
 
 
392 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  29.88 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  29.8 
 
 
392 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  29.85 
 
 
396 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  27.56 
 
 
386 aa  139  7.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  27.63 
 
 
397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  28.04 
 
 
392 aa  134  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  27.03 
 
 
381 aa  127  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  25.88 
 
 
387 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>