53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1343 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  100 
 
 		 381 aa  775    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  34.88 
 
 		 387 aa  246  4e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  35.55 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  32.38 
 
 		 396 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  35.97 
 
 		 392 aa  230  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  34.43 
 
 		 397 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  34.1 
 
 		 386 aa  219  6e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  31.71 
 
 		 392 aa  203  5e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  32.94 
 
 		 387 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  32.14 
 
 		 390 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  30.69 
 
 		 394 aa  153  5e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  30.92 
 
 		 394 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  30.45 
 
 		 394 aa  152  8e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  31.44 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  31.03 
 
 		 424 aa  144  3e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  27.79 
 
 		 457 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  26.7 
 
 		 401 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  28.9 
 
 		 372 aa  136  5e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  27.03 
 
 		 409 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  27.16 
 
 		 380 aa  126  6e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  25.51 
 
 		 396 aa  125  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  25.26 
 
 		 373 aa  117  3e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  27.14 
 
 		 414 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  25.42 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  25.3 
 
 		 411 aa  97.4  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  26.83 
 
 		 414 aa  95.9  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1033 aa  95.9  1e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  24.76 
 
 		 408 aa  94.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  23.63 
 
 		 1127 aa  91.3  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  25.3 
 
 		 1075 aa  88.2  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 1132 aa  86.7  6e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 1032 aa  85.9  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  25.18 
 
 		 1244 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.94 
 
 		 1089 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  24.47 
 
 		 1078 aa  83.2  0.000000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  24.92 
 
 		 428 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  23.64 
 
 		 1027 aa  82  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 1001 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  23.87 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  24.2 
 
 		 1082 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 1067 aa  74.7  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  23.88 
 
 		 1124 aa  71.6  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  23.28 
 
 		 1089 aa  71.6  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 1062 aa  70.5  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  26.83 
 
 		 1156 aa  67.4  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  30.32 
 
 		 1232 aa  66.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  24.92 
 
 		 1050 aa  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  24.56 
 
 		 1174 aa  64.7  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  24.61 
 
 		 1161 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0095  PHP domain protein  25 
 
 		 251 aa  45.4  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000129632 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2143  phosphotransferase domain-containing protein  26.14 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2808  phosphotransferase domain-containing protein  31.71 
 
 		 288 aa  43.9  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000695757  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  23.48 
 
 		 236 aa  44.3  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>