50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_1094 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  100 
 
 
394 aa  813    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  84.22 
 
 
393 aa  703    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  94.92 
 
 
394 aa  776    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  95.94 
 
 
394 aa  785    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  59.53 
 
 
424 aa  513  1e-144  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  46.79 
 
 
409 aa  350  2e-95  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  44.58 
 
 
457 aa  341  1e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  44.62 
 
 
401 aa  330  3e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  40.63 
 
 
396 aa  295  8e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  40.11 
 
 
372 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  38.26 
 
 
373 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  40.53 
 
 
380 aa  278  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  33.74 
 
 
392 aa  189  8e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  32.75 
 
 
414 aa  182  6e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.98 
 
 
1089 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  33.41 
 
 
390 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  34.64 
 
 
387 aa  176  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  29.16 
 
 
1078 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  29.47 
 
 
408 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  31.12 
 
 
1032 aa  171  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  30.75 
 
 
414 aa  170  5e-41  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  30.22 
 
 
1050 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  27.99 
 
 
1033 aa  168  1e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  28.1 
 
 
411 aa  168  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  28.03 
 
 
411 aa  166  8e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 
1075 aa  164  3e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  28.61 
 
 
1244 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  28.78 
 
 
428 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  28.43 
 
 
1001 aa  162  9e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  27.58 
 
 
1161 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  31.95 
 
 
396 aa  160  4e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 
1027 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  29.88 
 
 
392 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  33.17 
 
 
392 aa  154  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 
1127 aa  153  5e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  30.69 
 
 
381 aa  153  5e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 
1174 aa  152  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 
1124 aa  151  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 
1089 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  27.78 
 
 
1082 aa  150  5e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
446 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  27.6 
 
 
1132 aa  145  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 
1156 aa  138  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  28.29 
 
 
386 aa  133  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  29.68 
 
 
397 aa  132  9e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  26 
 
 
1062 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  27.71 
 
 
1232 aa  125  9e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  27.12 
 
 
1067 aa  124  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  29.17 
 
 
387 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0337  PHP-like protein  25.51 
 
 
236 aa  48.5  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.268427  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>