49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1564 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1564  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  947    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1399  PHP-like protein  70.92 
 
 		 409 aa  596  1e-169  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0764  phosphotransferase domain-containing protein  53.98 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.311457  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1581  phosphotransferase domain-containing protein  45.34 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.647284  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1094  phosphotransferase domain-containing protein  44.58 
 
 		 394 aa  341  1e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0508566  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0852  phosphotransferase domain-containing protein  44.33 
 
 		 394 aa  339  7e-92  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.017726  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1107  phosphotransferase domain-containing protein  44.19 
 
 		 393 aa  335  7.999999999999999e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1125  PHP-like  44.33 
 
 		 380 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.964414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0960  PHP domain protein  46.13 
 
 		 372 aa  329  6e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1948  phosphotransferase domain-containing protein  44.82 
 
 		 396 aa  320  1.9999999999999998e-86  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1296  TPR repeat-containing protein  42.49 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.51711 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1319  phosphotransferase domain-containing protein  40.59 
 
 		 424 aa  302  9e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2545  hypothetical protein  35.9 
 
 		 408 aa  239  6.999999999999999e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000698733  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0317  UvrD/REP helicase  35.57 
 
 		 1032 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.907606  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1328  hypothetical protein  34.14 
 
 		 411 aa  227  3e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000106195  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2878  DNA and RNA helicase  33.33 
 
 		 1050 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.015904  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2955  hypothetical protein  33.17 
 
 		 411 aa  226  9e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0254  UvrD/REP helicase  33.85 
 
 		 1232 aa  225  1e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.764036  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3266  DNA helicase II, putative  32.97 
 
 		 1078 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0167  UvrD/REP helicase  34.1 
 
 		 1161 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3744  UvrD/REP helicase  35.01 
 
 		 1124 aa  221  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.183659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3223  UvrD/REP helicase  32.83 
 
 		 1075 aa  219  6e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.124845 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7469  ATP-dependent DNA helicase  34.6 
 
 		 428 aa  219  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.747593 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3499  ATP-dependent DNA helicase UvrD  33.49 
 
 		 1089 aa  219  8.999999999999998e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1422  UvrD/REP helicase  33.4 
 
 		 1089 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0634  UvrD/REP helicase  34.22 
 
 		 1001 aa  216  9e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0632  hypothetical protein  33.25 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  32.33 
 
 		 1033 aa  208  2e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0992  UvrD/REP helicase  34.38 
 
 		 1156 aa  207  3e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2483  UvrD/REP helicase  31.49 
 
 		 1127 aa  205  1e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1930  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 1082 aa  203  5e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00120508  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5049  UvrD/REP helicase  31.98 
 
 		 1062 aa  202  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0107382 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1268  PHP domain protein  32.45 
 
 		 414 aa  197  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.128961  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3587  UvrD/REP helicase  34.45 
 
 		 446 aa  197  3e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000249291  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4539  UvrD/REP helicase  33.25 
 
 		 1067 aa  194  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1171  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 1132 aa  191  2e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  31.32 
 
 		 1244 aa  191  2e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2402  UvrD/REP helicase  33.98 
 
 		 1027 aa  189  8e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1553  hypothetical protein  34.64 
 
 		 390 aa  187  3e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2262  hypothetical protein  33.42 
 
 		 387 aa  178  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06840  conserved hypothetical protein TIGR00375  31.27 
 
 		 392 aa  178  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0022  UvrD/REP helicase  30.25 
 
 		 1174 aa  178  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0598  hypothetical protein  30.02 
 
 		 392 aa  157  5.0000000000000005e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0363  hypothetical protein  30.02 
 
 		 396 aa  153  5e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0355  hypothetical protein  31.68 
 
 		 392 aa  150  6e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1672  hypothetical protein  28.26 
 
 		 397 aa  146  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.530783  normal  0.0149602 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1753  hypothetical protein  29.37 
 
 		 386 aa  141  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.800597  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1343  PHP domain protein  27.79 
 
 		 381 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3463  hypothetical protein  27.41 
 
 		 387 aa  116  6.9999999999999995e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0239396  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>