More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_2522 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_2522  Peptidase M23  100 
 
 
605 aa  1174    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2424  peptidase M23B  51.84 
 
 
610 aa  225  1e-57  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.343501 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3154  membrane proteins, metalloendopeptidase-like  65.03 
 
 
388 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2003  flagellar protein FlgJ  54.33 
 
 
560 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  47.11 
 
 
282 aa  127  5e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  48.77 
 
 
243 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2376  peptidase M23B  51.64 
 
 
186 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0194718  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  44.7 
 
 
274 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  48.61 
 
 
238 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  48.61 
 
 
238 aa  118  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1837  peptidase family M23/M37 domain-containing protein  49.26 
 
 
252 aa  117  5e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.396478  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0525  peptidase M23  49.17 
 
 
271 aa  117  6.9999999999999995e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  42.5 
 
 
363 aa  116  1.0000000000000001e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1843  Peptidase M23  50 
 
 
186 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000204635 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2405  hypothetical protein  50.46 
 
 
197 aa  116  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0511  peptidase M23B  47.5 
 
 
271 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.119076  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  47.73 
 
 
294 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  45.58 
 
 
291 aa  114  6e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1251  Peptidase M23  47.2 
 
 
430 aa  114  7.000000000000001e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.767497  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  46.97 
 
 
292 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  44.88 
 
 
305 aa  113  9e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4692  peptidase M23B  45.45 
 
 
302 aa  113  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.574974  normal  0.126416 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  45.67 
 
 
305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  45.67 
 
 
305 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  45.67 
 
 
305 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  37.7 
 
 
400 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2401  peptidase M23B  46.36 
 
 
297 aa  111  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2924  Peptidase M23  44.17 
 
 
314 aa  111  5e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2231  peptidase M23B  49.55 
 
 
247 aa  110  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000597073  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2565  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.26 
 
 
304 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.966222  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  43.8 
 
 
309 aa  110  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  46.22 
 
 
446 aa  110  9.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  45.08 
 
 
404 aa  109  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2192  Peptidase M23  47.97 
 
 
296 aa  109  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0192897  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1658  peptidase M23B  39.31 
 
 
265 aa  109  1e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.508498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  44.88 
 
 
301 aa  108  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  42.86 
 
 
501 aa  108  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  45.38 
 
 
455 aa  108  4e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  45.38 
 
 
451 aa  108  4e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  43.48 
 
 
305 aa  107  4e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  45.08 
 
 
411 aa  108  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  42.86 
 
 
537 aa  107  5e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0789  peptidase M23B  47.11 
 
 
284 aa  107  6e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.236004  normal  0.0154646 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0609  Peptidase M23  48.67 
 
 
412 aa  107  6e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.01787e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  48.36 
 
 
333 aa  107  7e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1202  Peptidase M23  47.15 
 
 
367 aa  107  7e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  43.7 
 
 
494 aa  107  8e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1181  Peptidase M23  47.5 
 
 
241 aa  106  1e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000634852 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3645  peptidase M23B  50 
 
 
184 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3080  peptidase M23B  47.9 
 
 
247 aa  105  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.390999  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  42.15 
 
 
427 aa  105  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1877  Peptidase M23  41.26 
 
 
273 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000121356  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5144  peptidase M23  45.08 
 
 
404 aa  105  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1350  peptidase M23B  40.97 
 
 
240 aa  105  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000125735  hitchhiker  0.000000000113309 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4526  peptidase M23B  45.08 
 
 
299 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000111133  unclonable  0.0000000250462 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  42.15 
 
 
427 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0616  peptidase M23B  45.22 
 
 
319 aa  105  3e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00137898  hitchhiker  0.00000225062 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04359  peptidase  47.32 
 
 
313 aa  104  4e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0361  peptidase M23B  45.45 
 
 
299 aa  104  4e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000166445  unclonable  0.00000779697 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.28 
 
 
452 aa  104  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1678  peptidase M23B  44.96 
 
 
285 aa  104  5e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00661427  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0210  peptidase M23B  42.62 
 
 
216 aa  104  6e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  normal  0.0105886 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0400  peptidase M23B  44.2 
 
 
198 aa  103  6e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000116464  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2106  M24/M37 family peptidase  45.14 
 
 
328 aa  103  8e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0499  M23/M37 peptidase domain-containing protein  50 
 
 
251 aa  103  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  46.34 
 
 
323 aa  103  1e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11020  peptidase M23B  42.28 
 
 
324 aa  102  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.185646  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2125  peptidase M23B  42.98 
 
 
249 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000148266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3797  peptidase M23B  43.8 
 
 
299 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000938222  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0417  peptidase M23B  44.83 
 
 
299 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000018485  hitchhiker  0.000198891 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1960  peptidase M23  45.54 
 
 
319 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.065884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  42.4 
 
 
377 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1048  peptidase M23B  45.97 
 
 
379 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.038603  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  47.5 
 
 
198 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3446  peptidase M23B  45.9 
 
 
299 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000175079  unclonable  0.00000226335 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  45.16 
 
 
375 aa  101  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  44.53 
 
 
321 aa  102  3e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3012  peptidase M23B  48.15 
 
 
199 aa  102  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000904375  normal  0.921697 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  47.5 
 
 
198 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  40.5 
 
 
438 aa  101  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  40.16 
 
 
283 aa  102  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3955  putative metalloendopeptidase  43.8 
 
 
453 aa  101  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.862096 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2335  peptidase M23B  44.17 
 
 
455 aa  101  4e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1541  peptidase M23  36.84 
 
 
425 aa  101  4e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.759696  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0610  Peptidase M23  45.53 
 
 
318 aa  101  5e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0598438  normal  0.897424 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1788  peptidase M23B  43.44 
 
 
423 aa  101  5e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.448241  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  42.74 
 
 
374 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2040  peptidase  45.54 
 
 
369 aa  100  6e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0406653  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4732  peptidase M23B  44.92 
 
 
394 aa  100  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0130567  normal  0.138326 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0855  Fe-S type hydro-lyases tartrate/fumarate alpha region  44.83 
 
 
310 aa  100  7e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000487918  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  47.46 
 
 
447 aa  100  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2318  LysM/M23/M37 peptidase  39.82 
 
 
307 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.234924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0717  peptidase M23B  45.16 
 
 
541 aa  99.8  1e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23480  peptidase M23B  42.42 
 
 
334 aa  100  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000421975  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0789  NlpD  36.36 
 
 
295 aa  99.8  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.278455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2849  peptidase M23B  42.15 
 
 
455 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.649835  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0362  peptidase M23B  43.44 
 
 
299 aa  99.8  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000004833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2444  peptidase M23B  41.41 
 
 
318 aa  99  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.00000108635  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0473  Peptidase M23  44.07 
 
 
372 aa  99  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1995  peptidase M23B  38.3 
 
 
309 aa  99.4  2e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>